• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2016 Fiscal Year Annual Research Report

Research for fundamental algorithm of natural intelligence by means of mathematical science and biological information science

Research Project

Project/Area Number 26310202
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

中垣 俊之  北海道大学, 電子科学研究所, 教授 (70300887)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 上田 肇一  富山大学, 大学院理工学研究部(理学), 准教授 (00378960)
手老 篤史  九州大学, マス・フォア・インダストリ研究所, 准教授 (60431326)
黒田 茂  北海道大学, 電子科学研究所, 助教 (90431303)
佐藤 勝彦  北海道大学, 電子科学研究所, 准教授 (90513622)
Project Period (FY) 2014-07-18 – 2017-03-31
Keywords生体生命情報処理 / アルゴリズム / 単細胞 / 数理モデリング / 行動 / 繊毛虫 / 粘菌 / 反応拡散方程式
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、単細胞レベルで実現される生命知のパフォーマンスを運動方程式により数理モデル化し、そこから高等動物に至る生命情報処理の共通則を探索した。単細胞生物である粘菌や繊毛虫をモデル生物として、ネットワーク最適化、学習、行動選択について成果を得た。どのサブテーマでも論文発表ないし論文投稿まで到達できた。以下では、特にネットワーク最適化についてより詳細に述べる。
ネットワーク最適化:粘菌の体内循環系である管ネットワークでは、「よく使われる部分は強化され、そうでない部分は弱化される」という用不用則が作用している。この粘菌法則に倣って、北海道地域の「交通路と町の共発展現象」を数理モデル化し、北海道の主な交通路と人口上位30都市ほどの地理分布を概ね再現できた。粘菌の輸送系構築は、人の集住運動と思わぬ類似性があると示唆された。次にこの用不用則を構造物の形成に適用した。ヒト大腿骨におけるリモデリング現象では、骨粗しょう症に特徴的な骨の構造パタンを再現できた。輸送系と構造系でも、同様の用不用則モデルで記述できることがわかった。これらの発見を受けて、片持梁のデザインに用不用則を適用した。「どれほど使われるとどれほど強化されるか」を定める関数形(さじ加減)によって、多様なトポロジーをもつ形状が生み出された。また、初期状態をあえて一様でなくして、偏りをつけておくことによっても、多様さが生じた。用不用則の運動方程式に基づくアルゴリズムで構造物を設計する方法を提案できた。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (32 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 6 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (20 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 19 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Oxford(United Kingdom)

    • Country Name
      United Kingdom
    • Counterpart Institution
      University of Oxford
  • [Int'l Joint Research] Monash University(Australia)

    • Country Name
      Australia
    • Counterpart Institution
      Monash University
  • [Journal Article] 粘菌の用不用適応能に倣った形状最適化設計法の検討2017

    • Author(s)
      吉原 一詞、中垣 俊之
    • Journal Title

      土木学会論文集 A2(応用力学)

      Volume: 72(2) Pages: 3, 11

    • Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The Role of Noise in Self-organized Decision Making by the True Slime Mold Physarum polycephalum2017

    • Author(s)
      B. Meyer, C. Ansorge and T. Nakagaki
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Direct observation of orientation distributions of actin filaments in a solution undergoing shear banding2017

    • Author(s)
      K. Sato, I. Kunita, Y. Takikawa, D. Takeuchi, Y. Tanaka, T. Nakagaki and H. Orihara
    • Journal Title

      Soft Matter

      Volume: 13 Pages: 2708, 2716

    • DOI

      10.1039/c6sm02832b

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Studies of the phase gradient at the boundary of the phase diffusion equation, motivated by peculiar wave patterns of rhythmic contraction in the amoeboid movement of Physarum polycephalum2017

    • Author(s)
      M. Iima, H. Kori and T. Nakagaki
    • Journal Title

      Journal of Physics D: Applied Physics

      Volume: 50 Pages: -

    • DOI

      10.1088/1361-6463/aa6269

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Experimental models for Murray's law2017

    • Author(s)
      D. Akita, I. Kunita, M. Fricker, S. Kuroda, K. Sato and T. Nakagaki
    • Journal Title

      Journal of Physics D: Applied Physics

      Volume: 50 Pages: -

    • DOI

      10.1088/1361-6463/50/2/024001-

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 人工知能と自然知能2016

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Journal Title

      情報処理

      Volume: 57 Pages: 2, 3

  • [Journal Article] A ciliate memorizes the geometry of a swimming arena2016

    • Author(s)
      I. Kunita, T. Yamaguchi, A. Tero, M. Akiyama, S. Kuroda and T. Nakagaki
    • Journal Title

      J. Roy. Soc. Interface

      Volume: 13 Pages: -

    • DOI

      10.1098/rsif.2016.0155

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 生物の用不用則に基づく機能的な形づくり2017

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Organizer
      第12回理研「バイオものづくりシンポジウム」
    • Place of Presentation
      理化学研究所(埼玉県、和光市)
    • Year and Date
      2017-03-10 – 2017-03-10
    • Invited
  • [Presentation] Transport network in a micro-organism2017

    • Author(s)
      T. Nakagaki
    • Organizer
      MANA International Symposium 2017
    • Place of Presentation
      Tsukuba International Congress Center(茨城県、つくば市)
    • Year and Date
      2017-03-02 – 2017-03-02
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 繊毛虫の学習行動2017

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Organizer
      津田一郎教授退官記念研究会ー複雑系数理の新展開ー
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2017-02-15 – 2017-02-15
  • [Presentation] 粘菌の物理エソロジー2017

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Organizer
      レーザー学会「ナチュラルコンピューティングとレーザーカオス」シンポジウム
    • Place of Presentation
      徳島大学(徳島県、徳島市)
    • Year and Date
      2017-01-08 – 2017-01-08
    • Invited
  • [Presentation] あるアメーバ型細胞の作る細胞内輸送ネットワーク2016

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Organizer
      ナノ学会ナノ機能応用部会講演会
    • Place of Presentation
      秋田県グランドパレス川端(秋田県、大仙市)
    • Year and Date
      2016-12-26 – 2016-12-26
    • Invited
  • [Presentation] 単細胞のちょっと賢いはなし2016

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Organizer
      明治大学MIMS共同利用研究集会「比較動物学と現象数理学から考える「海の霊長類」の知の表現法」
    • Place of Presentation
      明治大学(東京都、中野区)
    • Year and Date
      2016-12-16 – 2016-12-16
    • Invited
  • [Presentation] Transport network in living systems designed by current-reinforcement rule2016

    • Author(s)
      T. Nakagaki
    • Organizer
      Asia pacific Consortium of Mathematics for Industry, Forum Math-for-Industry 2016, Agriculture as a metaphor for creativity in all human nendeavors
    • Place of Presentation
      Queensland University of Technology, Brisbane(オーストラリア)
    • Year and Date
      2016-11-23 – 2016-11-23
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 単細胞生物の賢さを探る2016

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Organizer
      第25回先端科学移動大学
    • Place of Presentation
      釧路市生涯学習センター(北海道、釧路市)
    • Year and Date
      2016-11-19 – 2016-11-19
    • Invited
  • [Presentation] Pattern formation of spatial distribution of town and transportation network -a case study on Hokkaido region-2016

    • Author(s)
      T. Nakagaki
    • Organizer
      Interdisciplinary Applications of Nonlinear Science
    • Place of Presentation
      Kagoshima University(鹿児島県、鹿児島市)
    • Year and Date
      2016-11-04 – 2016-11-04
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] テトラヒメナにおける空間形状への適応的遊泳2016

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Organizer
      日本微生物生態学会 日本原生生物学会共催シンポジウム「原生生物の環境センシングと運動」
    • Place of Presentation
      横須賀市文化会館(神奈川県、横須賀市)
    • Year and Date
      2016-10-25 – 2016-10-25
    • Invited
  • [Presentation] A ciliate memorizes the geometry of a swimming arena2016

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Organizer
      RIMS研究集会「集団ダイナミクスに現れる時空間パターンの数理」
    • Place of Presentation
      京都大学数理解析研究所(京都府、京都市)
    • Year and Date
      2016-10-13 – 2016-10-13
    • Invited
  • [Presentation] 粘菌:生きたゾルゲル変換体の形作りと機能作り2016

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Organizer
      第67回コロイドおよび界面化学討論会
    • Place of Presentation
      旭川市民文化会館(北海道、旭川市)
    • Year and Date
      2016-09-23 – 2016-09-23
    • Invited
  • [Presentation] Introduction to physical ethology2016

    • Author(s)
      T. Nakagaki
    • Organizer
      University of Bremen, Institute for biophysics SONDERKOLLOQUIUM
    • Place of Presentation
      University of Bremen(ドイツ)
    • Year and Date
      2016-09-16 – 2016-09-16
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Biomechanics of crawling locomotion in legged and limbless organisms2016

    • Author(s)
      T. Nakagaki
    • Organizer
      Berlin Center for Studies of Complex Chemical Systems regular seminar
    • Place of Presentation
      Berlin PTB Institute(ドイツ)
    • Year and Date
      2016-09-14 – 2016-09-14
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 粘菌、数理モデリング、共同研究2016

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Organizer
      数理で解き明かす森羅万象~小林亮とゆかいな仲間たちの研究会~
    • Place of Presentation
      広島大学(広島県、東広島市)
    • Year and Date
      2016-08-20 – 2016-08-20
    • Invited
  • [Presentation] 生物の用不用則に基づく適応的なネットワーク設計2016

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Organizer
      電子情報通信学会情報ネットワーク科学時限研究専門委員会(NetSci)/複雑コミュニケーションサイエンス研究専門委員会(CCS)共催ワークショップ
    • Place of Presentation
      余市町中央公民館(北海道、余市町)
    • Year and Date
      2016-08-09 – 2016-08-09
    • Invited
  • [Presentation] physical ethology of single-celled organism2016

    • Author(s)
      T. Nakagaki
    • Organizer
      The 31st International Congress of Psychology, invited symposium [Ig Noble prize winners talk about the evolutionary basis of the human mind]
    • Place of Presentation
      Pacifico Yokohama(神奈川県、横浜市)
    • Year and Date
      2016-07-26 – 2016-07-26
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 粘菌の形作りと機能作り~力学の視点から~2016

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Organizer
      電気学会 新しい原子分子組織化物質・材料創出に向けた光・量子ビーム応用技術専門委員会講演会
    • Place of Presentation
      札幌市定山渓ビューホテル(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-06-25 – 2016-06-25
    • Invited
  • [Presentation] 原生生物粘菌の構造物最適化設計法ー用不用則なる適応能からー2016

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Organizer
      土木学会応用力学委員会主催第19回応用力学シンポジウム
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-05-22 – 2016-05-22
    • Invited
  • [Presentation] 生き物に学ぶ最適化設計2016

    • Author(s)
      中垣 俊之
    • Organizer
      バイオミメティック市民セミナー
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-04-02 – 2016-04-02
    • Invited
  • [Book] Brain evolution by design -From Neural origin to cognitive architecture- (Ed. by S. Shigeno, Y. Murakami, T. Nomura) ISBN: 978-4-431-56467-62017

    • Author(s)
      S. Kuroda, S. Takagi, T. Saigusa and T. Nakagaki
    • Total Pages
      21 (pp. 3-23)
    • Publisher
      Springer-Verlag
  • [Remarks] 数物科学で読み解く生物行動学

    • URL

      http://pel.es.hokudai.ac.jp/

  • [Remarks] 数物科学で読み解く生物行動学

    • URL

      http://altair.sci.hokudai.ac.jp/polymer/laboratory/lab-c/cooperation-08.html

URL: 

Published: 2018-01-16  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi