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2015 Fiscal Year Research-status Report

AIM二元関数解析法の新展開:結晶および不安定物質中における弱い相互作用の解析

Research Project

Project/Area Number 26410050
Research InstitutionWakayama University

Principal Investigator

中西 和郎  和歌山大学, 学内共同利用施設等, 名誉教授 (80110807)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 林 聡子  和歌山大学, システム工学部, 准教授 (00294306)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords理論有機化学 / 有機典型元素 / 構造有機化学 / AIM二元関数解析法 / 水素結合 / ファン・デル・ワールス相互作用 / X線結晶構造解析 / 拡張超原子価結合
Outline of Annual Research Achievements

物質科学を発展させ新規化合物を開拓するためには、弱い相互作用の本質を的確に解析・評価し、自在にかつ巧みに操ることが求められる。Baderが提案したAIM (Atoms-in-Molecules Method)は、化学結合および相互作用の特性を評価・分類できる方法として注目を集めてきた。実験化学者の立場から測定結果や物性を自身のイメージで解析を行うために、AIM二元関数解析法(AIM-DFA)を提唱し、相互作用全体を統一的に評価・分類できる基本的な解析法として確立してきた。しかし化学現象全体を有効に解析するためには、本法のより高度な解析法としての確立という課題が浮上した。本研究の目的は、AIM-DFAを物質科学の発展と新規物質創製に挑戦できる解析法として発展・確立することであり、具体的には、(1)相互作用の動的特性に関連して新規な摂動構造作成法を提案し、AIM-DFAをさらに高精度化し、(2)不安定化学種や結晶中の相互作用を含めて有効な解析法として確立することである。
AIM-DFAの提案当初は、相互作用の動的特性は着目する相互作用の周辺から受ける影響を加味して解析した方が良いと考えていた。しかし、動的特性は小さいながらも周辺からの影響に比例して変化するという解析結果が得られた。このことを踏まえて、平成27年度は、研究の目的(1)に関連して、AIM-DFAを適用して、相互作用の動的特性の解析する際、着目する相互作用の周辺からの影響を取り除いた形で相互作用の動的特性が解析できる新規摂動構造作成法の提案と確立を目指した。実際にはCompliant force constantsに対応する基準座標(C-NIV) を用いて作成した摂動構造がこの目的を果たすために有効に機能すると考え、新規摂動構造の作成のため、プログラムを工夫し、実証を行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

平成27年度も、(1)の課題に取り組んだ。AIM二元関数解析法を適用して相互作用の動的特性の解析する際、着目する相互作用の周辺からの影響を取り除いた(いわば絶対的な値として)形で相互作用の動的特性が解析できる新規摂動構造の作成法に取り組んだ。Compliant force constantsに対応する基準座標(C-NIV) を用いて作成する摂動構造がこの目的を果たすために有効に機能するものと考えた。多原子分子の場合、着目する相互作用運動は、周辺の運動による影響を受けるため、通常、着目する相互作用運動のみが自然な形で抽出されることは極めて稀である。この場合、周辺の運動による影響下にある相互作用の運動の力の定数は、本来の相互作用の値ではなく、周辺の運動の力の定数によって変化したものとなる。Compliant force constantとは、着目する相互作用の運動に関して本来の相互作用に由来する値が得られる様に数学的処理をしたものであるといえる。従ってその様な処理後の運動に対応する基準座標 (C-NIV) を用いて摂動構造を作成した場合、着目する相互作用の周辺からの影響を取り除いた形で相互作用の動的特性が解析できると考えた。
Compliant force constantの提案者であるドイツ ブラウンシュバイク工科大学のGrunenberg教授らとの共同研究として新規摂動構造の作成を進めた。データの打ち出し段階でプログラムに工夫を加える必要があり、時間は要したが、結果うまく行えた。容易性などの微妙な調整を行っている。多環式化合物や多重水素結合系に、AIM二元関数解析法を適応し、ほぼ満足いく成果が得られた。現在報文にまとめているところである。

Strategy for Future Research Activity

平成27年度の計画で、完成させたCompliant force constantのプログラムを用いて、AIM二元関数解析を行い、その適用性をPOM法およびNIV法の結果と比較しつつ検討する。また当初計画の通り、平成28年度は、課題(2)を中心に、不安定化学種、特に遷移状態(TS)における相互作用の解析・評価を中心に研究を行う予定である。

Causes of Carryover

Dynamic and static behavior of the H---π and E---π interactions in EH2 adducts of benzene π-system (E = O, S, Se and Te), elucidated by QTAIM dual functional analysis Phys. Chem. Chem. Phys. の論文が、Inside coverに採用されることになった(2015年12月に連絡あり)が、掲載時期が2016年3月から5月の期間とすぐには確定しなかった。そのため掲載料金として残した。

Expenditure Plan for Carryover Budget

Dynamic and static behavior of the H---π and E---π interactions in EH2 adducts of benzene π-system (E = O, S, Se and Te), elucidated by QTAIM dual functional analysis Phys. Chem. Chem. Phys. の論文が、2016年4月号のInside coverに採用されたため、その掲載料金の請求が2016年5月3日にあり、支払い手続きを行った。

  • Research Products

    (16 results)

All 2016 2015

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 9 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Dynamic and static behavior of the H---π and E---π interactions in EH2 adducts of benzene π-system (E = O, S, Se and Te), elucidated by QTAIM dual functional analysis2016

    • Author(s)
      Satoko Hayashi, Yuji Sugibayashi and Waro Nakanishi
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 18 Pages: 9948-9960

    • DOI

      10.1039/C5CP06062A

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Dynamic and static behavior of hydrogen bonds of the X-H…π type (X = F, Cl, Br, I, RO and RR'N; R, R' = H or Me) in the benzene π-system, elucidated by QTAIM dual functional analysis2015

    • Author(s)
      Y. Sugibayashi, S. Hayashi and W. Nakanishi
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 17 Pages: 28879-28891

    • DOI

      10.1039/C5CP04885K

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Transannular E---E' Interactions in Neutral, Radical Cationic, and Dicationic Forms of cyclo-[E(CH2CH2CH2)2E'] (E, E' = S, Se, Te, and O) with Structural Feature: Dynamic and Static Behavior of E---E' Elucidated by QTAIM Dual Functional Analysis2015

    • Author(s)
      S. Hayashi, K. Matsuiwa, N. Nishizawa, and W. Nakanishi
    • Journal Title

      J. Org. Chem.

      Volume: 80 Pages: 11963-11976

    • DOI

      10.1021/acs.joc.5b01794

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 相互作用全体を統一的に解析できる方法の確立と弱い相互作用への適用2016

    • Author(s)
      林 聡子
    • Organizer
      第3回CUTEシンポジウム:コンピュータ化学「計算科学と実験化学の接点」
    • Place of Presentation
      三重大学新産業創成研究拠点 (三重)
    • Year and Date
      2016-03-28 – 2016-03-28
    • Invited
  • [Presentation] グルタチオンジカルコゲニドの配座解析とカルコゲン-カルコゲン相互作用の挙動解明2016

    • Author(s)
      坪本 裕、林 聡子、中西 和郎
    • Organizer
      日本化学会 第96春季年会
    • Place of Presentation
      同志社大学 京田辺キャンパス (京都)
    • Year and Date
      2016-03-24 – 2016-03-27
  • [Presentation] AIM二元関数解析法によるベンゼンπ系におけるH-H---π型水素結合の動的および静的挙動の解明2015

    • Author(s)
      杉林 祐至、林 聡子、中西 和郎
    • Organizer
      第42回有機典型元素化学討論会
    • Place of Presentation
      名古屋大学 野依記念学術交流館 (愛知)
    • Year and Date
      2015-12-03 – 2015-12-05
  • [Presentation] AIM 二元関数解析法による 1,5-(ジカルコゲナ)カンのモノおよびジカチオン二量体におけるカルコゲン-カルコゲン相互作用の挙動解明2015

    • Author(s)
      大槻 昭太、永田 健吾、西澤 望、林 聡子、中西 和郎
    • Organizer
      第26回基礎有機化学討論会
    • Place of Presentation
      愛媛大学・松山大学 (愛媛)
    • Year and Date
      2015-09-24 – 2015-09-26
  • [Presentation] DYNAMIC AND STATIC BEHAVIOR OF HYRDOGEN BONDS OF THE X-H---π TYPE (X = F, CL, BR, I, RO-H AND RR’N-H; R, R’ = H AND/OR ME) IN BENZENE p-SYSTEM, ELUCIDATED BY AIM-DFA2015

    • Author(s)
      S. Hayashi, Y. Sugibayashi and W. Nakanishi
    • Organizer
      7th International Meeting on Halogen Chemistry (HALCHEM VII)
    • Place of Presentation
      Czestochowa (Poland)
    • Year and Date
      2015-09-03 – 2015-09-06
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DYNAMIC AND STATIC BEHAVIOR OF HALOGEN BONDS OF THE Y-X---π TYPE (X, Y = F, CL, BR AND I) IN BENZENE AND OTHER π- SYSTEMS, ELUCIDATED BY AIM-DFA2015

    • Author(s)
      Yuji Sugibayashi, Satoko Hayashi and Waro Nakanishi
    • Organizer
      7th International Meeting on Halogen Chemistry (HALCHEM VII)
    • Place of Presentation
      Czestochowa (Poland)
    • Year and Date
      2015-09-03 – 2015-09-06
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] BEHAVIOR OF E---E’ IN NEUTRAL AND CHARGED FORMS OF CYCLO-1,2-EE’(CH2)3 (E, E’ = O, S, Se, AND Te), ELUCIDATED BY AIM-DFA2015

    • Author(s)
      Kengo Isoda, Kohei Matsuiwa, Satoko Hayashi, and Waro Nakanishi
    • Organizer
      The 11th International Conference on Heteroatom Chemistry (ICHAC-11)
    • Place of Presentation
      Caen (France)
    • Year and Date
      2015-06-14 – 2015-06-19
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] EXTENDED HYPERVALENT Se4 4c-6e INTERACTIONS IN BENZENE AND NAPHTHALENE SYSTEMS2015

    • Author(s)
      Yutaka Tsubomoto, Yoshiyuki Nagano, Satoko Hayashi, and Waro Nakanishi
    • Organizer
      The 11th International Conference on Heteroatom Chemistry (ICHAC-11)
    • Place of Presentation
      Caen (France)
    • Year and Date
      2015-06-14 – 2015-06-19
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] BEHAVIOR OF LINEAT 1E---2E INTERACTIONS IN MONO- AND DI-CATIONIC DIMERS OF 1,5-(DICHALCOGENA)CANES: THEORETICAL INVESTIGATIONS2015

    • Author(s)
      Shota Otsuki, Kohei Matsuiwa, Satoko Hayashi, and Waro Nakanishi
    • Organizer
      The 11th International Conference on Heteroatom Chemistry (ICHAC-11)
    • Place of Presentation
      Caen (France)
    • Year and Date
      2015-06-14 – 2015-06-19
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] BEHAVIOR OF E---E' IN DICATIONIC OLIGOMERS OF CYCLO- E(CH2CH2CH2)2E' (E, E' = S, Se, AND Te) ELUCIDATED BY AIM-DFA2015

    • Author(s)
      Kengo Nagata, Satoko Hayashi, and Waro Nakanishi
    • Organizer
      The 11th International Conference on Heteroatom Chemistry (ICHAC-11)
    • Place of Presentation
      Caen (France)
    • Year and Date
      2015-06-14 – 2015-06-19
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DYNAMIC BEHAVIOR OF THE Y-X---π INTERACTIONS (X, Y = F, Cl, Br, AND I) IN BENZENE π SYSTEM, ELUCIDATED BY AIM-DFA2015

    • Author(s)
      Yuji Sugibayashi, Satoko Hayashi, and Waro Nakanishi
    • Organizer
      The 11th International Conference on Heteroatom Chemistry (ICHAC-11)
    • Place of Presentation
      Caen (France)
    • Year and Date
      2015-06-14 – 2015-06-19
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] BEHAVIOR OF E---E’ INTERACTIONS IN NEUTRAL AND CHARGED 1,5-(DICHALCOGENA)CANES, ELUCIDATED BY AIM-DFA2015

    • Author(s)
      Nozomu Nishizawa, Kohei Matsuiwa, Satoko Hayashi, and Waro Nakanishi
    • Organizer
      The 11th International Conference on Heteroatom Chemistry (ICHAC-11)
    • Place of Presentation
      Caen (France)
    • Year and Date
      2015-06-14 – 2015-06-19
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] BEHAVIOR OF HYDROGEN BONDS FROM PURE CLOSED SHELL TO SHARED SHELL INTERACTION REGIONS, ELUCIDATED BY AIM-DFA2015

    • Author(s)
      Waro Nakanishi, Kohei Matsuiwa, and Satoko Hayashi
    • Organizer
      The 11th International Conference on Heteroatom Chemistry (ICHAC-11)
    • Place of Presentation
      Caen (France)
    • Year and Date
      2015-06-14 – 2015-06-19
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2017-01-06  

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