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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of molecular association and dissociation mechanism in replication restart

Research Project

Project/Area Number 26440031
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

阿部 義人  九州大学, 薬学研究院, 准教授 (60315091)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 片山 勉  九州大学, 薬学研究院, 教授 (70264059)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords複製再開始プライモソーム / タンパク質-DNA複合体 / タンパク質構造 / PriB / PriC / DnaT
Outline of Annual Research Achievements

紫外線や化学物質によって生じるDNA損傷によって、一時的にDNA複製は停止し、DNA修復が起こった後、複製フォーク構造が再形成されると考えられている。この複製フォーク構造の形成後にDnaBヘリカーゼが再導入され、複製は再開始される。この大腸菌複製再開始のメカニズム研究を構造生物学的観点から行い、1)いまだ解かれていない複製再開始因子の立体構造を決定し、各因子同士の相互作用解析を行い、2)複製再開始複合体の分子集合・解離の過程を検出し、明らかにすることを本申請の目的とした。最終年度である本年度は、DnaT-PriBの相互作用解析を行い、PriBにおいてDnaT結合部位に存在する幾つかのアミノ酸の重要性を調べ、複製再開始における一本鎖DNAがPriBに結合し、DnaTによって解離するモデルの構築を行った。その結果に関しては、現在投稿中であり、この結果を元に、シンガポール国際大学との共同研究も始まっている。また、DnaTのN末ドメインの機能であるオリゴマー形成を調べる為、幾つかの変異体を作成し、オリゴマー形成に重要な部位を同定した。この情報を利用し、未だ判明していないDnaTN末の立体構造決定に向けて、現在検討を行っている。これらの結果は2件の国際学会を含め、本年度は6件の学会発表を行った。本申請では、複製再開始因子PriB、PriC、DnaTの構造およびそれらの間の相互作用情報、それぞれの因子とDNAとの相互作用情報を集めた。その結果は複製再開始のメカニズム解明に寄与したと自負している。期間全体として、16件の学会発表、4件の論文発表を行い、今後も本申請の結果を元に、論文を作成する予定である。

  • Research Products

    (7 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] シンガポール国際大学(シンガポール)

    • Country Name
      SINGAPORE
    • Counterpart Institution
      シンガポール国際大学
  • [Presentation] Analysis of DnaT oligomeric structure in Escherichia coli replication restart primosome2017

    • Author(s)
      池田陽平, 藤山紗希, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • Organizer
      KAIST-Kyushu University Joint Seminar
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2017-01-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 大腸菌DNA複製再開始タンパク質PriB・DnaTの構造を基盤とした相互作用解析2016

    • Author(s)
      藤山 紗希, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • Organizer
      第89回日本生化学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2016-09-26
  • [Presentation] NMR Analysis of an Interaction between PriB and DnaT on Bacterial Replication Restart Primosome2016

    • Author(s)
      藤山 紗希, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • Organizer
      The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2016-07-25
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 大腸菌 DNA 複製再開始因子 DnaT の多量体構造解析2016

    • Author(s)
      池田 陽平, 藤山紗希, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • Organizer
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2016-06-08
  • [Presentation] 大腸菌 DNA 複製再開始因子 DnaT の構造と機能2016

    • Author(s)
      阿部 義人, 藤山 紗希, 池田 陽平, 片山 勉, 植田 正
    • Organizer
      第13回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      2016-06-02
  • [Presentation] 大腸菌 DNA 複製再開始タンパク質 PriB・DnaTの相互作用機序の解析2016

    • Author(s)
      藤山紗希, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • Organizer
      日本生化学会九州支部会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Year and Date
      2016-05-14

URL: 

Published: 2018-01-16  

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