• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2016 Fiscal Year Annual Research Report

Prediction of human migration by H. pylori and and evolutionary analysis of the virulence

Research Project

Project/Area Number 26440198
Research InstitutionOita University

Principal Investigator

鈴木 留美子  大分大学, 医学部, 助教 (70599092)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山岡 吉生  大分大学, 医学部, 教授 (00544248)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywordsピロリ菌 / ゲノムシーケンス / 系統解析 / 胃がん / 胃MALTリンパ腫 / 胃炎
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、Helicobacter pylori(ピロリ菌)のゲノム解析を通して、(1)先史時代アジアにおける人類移動経路の推定、および(2)東アジア株における新規疾患関連領域の探索、の2つのテーマを追究した。テーマ(1)に関しては、GenBankに登録されているピロリ菌70株の完全ゲノムに、我々が次世代シーケンサーを用いて読み取った24株の完全ゲノムを加えて系統解析を行った結果、沖縄には他の東アジア地域にないピロリ菌集団が2つ存在し、そのうちの1つ(沖縄A)の分岐年代が約2万年~3万年前であること、もう一つ(沖縄B)のグループの分岐年代が約1万年前であることを解明した。また、7つのハウスキーピング遺伝子配列を用いた集団解析では、Oki-Aと、パプアニューギニアやオーストラリアに存在するhpSahulグループに共通性が見られ、Oki-Bは、北海道アイヌの株が含まれるhspAmerindと同じサブブランチに属し、ヒトSNPの研究でアイヌ人と琉球人に共通性が見られるという結果と一致した。テーマ(2)に関しては、大分で採取されたピロリ菌について、胃がん由来18株、胃マルトリンパ腫由来12株、どちらの疾患にも進展していない胃炎株18株に分けて、ピロリ菌の主要な病原遺伝子であるCagAおよびVacAのアミノ酸配列全長を比較した結果、疾患群間でアミノ酸頻度に有意差のある座位を、CagAで4座位、VacAで3座位同定した。また、CagA、VacAで有意差の見られたアミノ座位が、タンパク質上でどのようなドメインに入っているかを示し、CagAについてはタンパク立体構造上のどこに位置するかも明らかにした。

  • Research Products

    (3 results)

All 2016

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Differences in amino acid frequency in CagA and VacA sequences of Helicobacter pylori distinguish gastric cancer from gastric MALT lymphoma.2016

    • Author(s)
      Hashinaga M, Suzuki R, Akada J, Matsumoto T, Kido Y, Okimoto T, Kodama M, Murakami K, Yamaoka Y.
    • Journal Title

      Gut Pathog

      Volume: 8 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1186/s13099-016-0137-x

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Helicobacter pyloriから探る人類の旅2016

    • Author(s)
      鈴木留美子・山岡吉生
    • Journal Title

      Helicobacter Research

      Volume: vol.20 no.5 Pages: 45-59

    • DOI

      -

  • [Presentation] コロンブス後の南米におけるピロリ菌・mtDNA・ Y2016

    • Author(s)
      鈴木留美子, 小野孝明, 塩田星児, 山岡吉生
    • Organizer
      日本進化学会第18回大会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都目黒区)
    • Year and Date
      2016-08-26 – 2016-08-26

URL: 

Published: 2018-01-16  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi