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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Roles of the histone variant H3.3 on the distal enhancer of differentiation specific gene.

Research Project

Project/Area Number 26460373
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

西山 晃  横浜市立大学, 医学研究科, 准教授 (80589664)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords転写因子 / 細胞分化 / エピジェネティックス / ヒストンバリアント / ヒストン修飾
Outline of Annual Research Achievements

細胞分化は、未成熟な細胞が最終的に組織特異的な機能を獲得する過程であり、この過程においては細胞系譜特異的な遺伝子の発現が重要である。この遺伝子発現制御には、エピジエネティック制御も重要な役割を持ち、その中でもヒストンバリアントH3.3は「転写の記憶」を担う。H3.3は転写の亢進した領域に加え、分化特異的な遺伝子のエンハンサー領域にも予備的に取込まれる。一方エンハンサー領域におけるH3.3の取込み機能に加え、H3.3がどのようにして分化特異的な遺伝子発現に貢献するか、また分化特異的な遺伝子発現と「転写の記憶」との関連など、解明されるべき重要な点が多く残っている。本研究では、転写因子IRF8が誘導する単球分化でのH3.3の機能や取込み機構の解析を行い、細胞分化に必須な遺伝子発現を適切に導く分子機構を理解することを目的とし、研究を進めてきた。
これまでIRF8の標的遺伝子である転写因子Klf4の遺伝子発現をモデルとして解析を行ってきた。Klf4遺伝子には広大なエンハンサーが存在しており、IRF8の結合が起点となり遺伝子発現を導く。H3.3はエンハンサーと遺伝子の両領域に、同時に蓄積する分子の中で最も早く取込まれ、両領域を結びつける重要な役割を担うと考えられた。さらに、各々の領域を欠失させると、もう一方の活性化が不全となり、両領域が連携して遺伝子発現を導く可能性が見出された。以上の結果から、H3.3は遺伝子発現誘導の過程の中で、エンハンサーと遺伝子の双方の連携を導く役割を持つ可能性が示唆された。
今後、さらに分化特異的な遺伝子発現におけるH3.3の役割を解析していきたいと考えている。本研究の成果は、血球分化の分子機構の理解のみならず、遺伝子発現の制御破綻による発生異常や白血病、がんなどの病態理解や治療法開発に繋がると期待される。

  • Research Products

    (16 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Generation and gene expression profiling of 48 transcription-factor-inducible mouse embryonic stem cell lines2016

    • Author(s)
      Yamamizu K., Sharov A.A., Piao Y., Amano M., Yu H., Nishiyama A., Dudekula D.B., Schlessinger D., Ko M.S.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 6 Pages: 25667

    • DOI

      10.1038/srep25667

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Transcription elongation factor Brd4-P-TEFb accelerates intestinal differentiation-associated SLC2A5 gene expression2016

    • Author(s)
      Inamochi Y., Dey A., Nishiyama A., Kubota T., Ozato K., Goda T., Mochizuki K.
    • Journal Title

      Biochemistry and Biophysics Reports

      Volume: 7 Pages: 150-156

    • DOI

      10.1016/j.bbrep.2016.05.016

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Lyn Kinase Suppresses the transcriptional activity of IRF5 in the TLR-MyD88 pathway to restrain the development of autoimmunity2016

    • Author(s)
      Ban T., Sato G.R., Nishiyama A., Akiyama A., Takasuna M., Umehara M., Suzuki S., Ichino M., Matsunaga S., Kimura A., Kimura Y., Yanai H., Miyashita S., Kuromitsu J., Tsukahara K., Yoshimatsu K., Endo I., Yamamoto T., Hirano H., Ryo A., Taniguchi T., Tamura, T.
    • Journal Title

      Immunity

      Volume: 45 Pages: 319-332

    • DOI

      10.1016/j.immuni.2016.07.015

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Biallelic TBCD Mutations Cause Early-Onset Neurodegenerative Encephalopathy2016

    • Author(s)
      Miyake N., Fukai R., Ohba C., Chihara T., Miura M., Shimizu H., Kakita A., Imagawa E., Shiina M., Ogata K., Okuno-Yuguchi J., Fueki N., Ogiso Y., Suzumura H., Watabe Y., Imataka G., Leong H.Y., Fattal-Valevski A., Uri Kramer U., Miyatake S., Kato M., Okamoto N., Sato Y., Mitsuhashi S., Nishino I., Kaneko N. et al.
    • Journal Title

      American Journal of Human Genetics

      Volume: 99 Pages: 950-961

    • DOI

      10.1016/j.ajhg.2016.08.005

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Stepwise and mutual activation between distal enhancer and proximal promoter in the induction of cell differentiation-related genes2017

    • Author(s)
      Nishiyama A., Nakabayahi J., Fushimi K., Tamura T.
    • Organizer
      The 2017 Japan-NIH joint Symposium
    • Place of Presentation
      東北大学星陵オーディトリアム(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2017-02-15 – 2017-02-17
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 細胞分化特異的な遺伝子発現を導く遠位エンハンサーと近位プロモーター領域間での相互活性化2017

    • Author(s)
      西山 晃, 中林 潤, 伏見 健太郎, 田村 智彦
    • Organizer
      冬の若手ワークショップ2017
    • Place of Presentation
      一宮シーサイドオーツカ(千葉県一宮町)
    • Year and Date
      2017-01-30 – 2017-02-01
  • [Presentation] 細胞分化特異的な遺伝子発現を導く遠位エンハンサーと近位プロモーター領域間での相互活性化2017

    • Author(s)
      西山 晃, 中林 潤, 伏見 健太郎, 田村 智彦
    • Organizer
      第34回染色体ワークショップ・第15回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      かずさアカデミアホール(千葉県木更津市)
    • Year and Date
      2017-01-11 – 2017-01-13
  • [Presentation] IRF5 hyperactivation caused by Lyn deficiency is linked to the development of SLE-like disease2016

    • Author(s)
      Ban T., Sato G.R., Nishiyama A., Ichino M., Yanai H., Ryo A., Taniguchi T., Tamura T.
    • Organizer
      第45回日本免疫学会学術集会
    • Place of Presentation
      沖縄コンベンションセンター(沖縄県宜野湾市)
    • Year and Date
      2016-12-05 – 2016-12-07
  • [Presentation] Lyn suppresses IRF5 by preventing the stepwise IRF5 post-translational modifications2016

    • Author(s)
      Sato G.R., Ban T., Nishiyama A., Ichino M., Yanai H., Ryo A., Taniguchi T., Tamura T.
    • Organizer
      第45回日本免疫学会学術集会
    • Place of Presentation
      沖縄コンベンションセンター(沖縄県宜野湾市)
    • Year and Date
      2016-12-05 – 2016-12-07
  • [Presentation] BCR-ABL promotes the generation of basophils expressing high levels of the immune checkpoint related protein PD-L1 in a murine CML model2016

    • Author(s)
      Kaneko N., Nishiyama A., Sasaki H., Koizumi S., Tamura T.
    • Organizer
      第45回日本免疫学会学術集会
    • Place of Presentation
      沖縄コンベンションセンター(沖縄県宜野湾市)
    • Year and Date
      2016-12-05 – 2016-12-07
  • [Presentation] Soluble factors derived from BCR-ABL-expressing hematopoietic cells inhibit the development of dendritic cells in mice2016

    • Author(s)
      Harada I., Ichino M., Nishiyama A., Tamura T.
    • Organizer
      第45回日本免疫学会学術集会
    • Place of Presentation
      沖縄コンベンションセンター(沖縄県宜野湾市)
    • Year and Date
      2016-12-05 – 2016-12-07
  • [Presentation] 細胞分化特異的な遺伝子発現を導く遠位エンハンサーとプロモーターの相互活性化2016

    • Author(s)
      西山 晃, 中林 潤, 伏見 健太郎, 田村 智彦
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] BCR-ABL induces the formation of activate enhancers for immunosuppressive genes2016

    • Author(s)
      Nishiyama A., Koizumi S., Sasaki H., Kaneko N., Harada I., Tamura T.
    • Organizer
      第78回日本血液学会学術集会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-10-13 – 2016-10-15
  • [Presentation] C/EBPβ mediates the repression of Irf8 expression and dendritic cell development by BCR-ABL2016

    • Author(s)
      Sasaki H., Nishiyama A., Koizumi S., Kaneko N., Yokota A., Hirai H., Nakabayashi J., Tamura T.
    • Organizer
      第78回日本血液学会学術集会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-10-13 – 2016-10-15
  • [Book] 白血病学(下)2016

    • Author(s)
      田村智彦, 西山 晃
    • Total Pages
      6
    • Publisher
      日本臨牀社
  • [Remarks] 免疫学教室 - 横浜市立大学

    • URL

      http://www-user.yokohama-cu.ac.jp/~immunol/

URL: 

Published: 2018-01-16  

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