2016 Fiscal Year Annual Research Report
Epigenetic regulation of large intergenic non-coding RNA in Head and Neck Cancer
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26462599
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| Research Institution | Hamamatsu University School of Medicine |
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Principal Investigator |
三澤 清 浜松医科大学, 医学部附属病院, 講師 (90334979)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
遠藤 志織 浜松医科大学, 医学部附属病院, 医員 (10625205)
峯田 周幸 浜松医科大学, 医学部, 教授 (40190714)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 頭頸部癌 / DNAメチル化 / non-coding RNA / エピジェネティックス |
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| Outline of Annual Research Achievements |
DNAのメチル化を始めとするエピジェネティックな変化が、RNA合成、ひいてはタンパク質の発現を抑制することから、癌化機構の一つとして認識されている。近年、トランスクリプトーム解析によって同定された遺伝子間領域から転写される大小さまざまな非コードRNA(non-coding RNA)群が、ヒストン修飾酵素複合体と結合し、特異的な標的遺伝子の発現制御にかかわっていることが明らかにされつつある。今回我々は、長鎖遺伝子間non-coding RNA(lincRNA)に注目し、頭頸部癌におけるエピジェネティック制御におけるlincRNAの役割について調べている。
最終年の今年は、次世代シークエンサー解析をおこなった。具体的には、頭頸部扁平上皮癌細胞株Fadu, UM-SCC-6, UM-SCC-47にsiSALL4を導入し次世代シークエンサーRNA解析を行った。それぞれの細胞株のsiSALL4導入前と導入後を比較し、平均で2倍上の増減を認のたものは、27000余りのRNAのうち、増加した RNAが869(3.2%)、減少したものが1805(6.7%)だった。増加したRNAのうち主たるnon-coding RNAはmiRNA 15.7%、lincRNA 3.6%、snRNA 3.5%であった。減少したRNAのうち主たるnon-coding RNAはmiRNA 11.2%、lincRNA 3.8%、snRNA 3.5%であった。現在、どのnon-coding RNAがSALL4と連動し頭頸部癌において発癌に関連しているのか解析を行っている。
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Research Products
(9 results)
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[Journal Article] Indwelling Voice Prosthesis insertion after Total Pharyngolaryngectomy with Free Jejunal Reconstruction2017
Author(s)
Fukushima Hirofumi, Kanazawa Takeharu, Kawabata Kazuyoshi, Mitani Hiroki, Yonekawa Hiroyuki, Sasaki Toru, Shimbashi Wataru, Seto Akira, Kamiyama Ryousuke, Misawa Kiyoshi, Asakage Takahiro
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Journal Title
Laryngoscope Investigative Otolaryngology
Volume: 2(1)
Pages: 30-35
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Human papillomavirus-associated small cell carcinoma/neuroendocrine carcinoma of the oropharynx: A report of two cases2016
Author(s)
Misawa K, Kawasaki H, Matsuo R, Sugiyama K, Mochizuki D, Endo S, Imai A, Misawa Y, Yamatodani T, Mizuta K, Mineta H
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Journal Title
SpringerPlus
Volume: 5(1)
Pages: 1847
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Abnormal expressions of DNA glycosylase genes NEIL1, NEIL2, and NEIL3 are associated with somatic mutation loads in human cancer2016
Author(s)
Shinmura K, Kato H, Kawanishi Y, Igarashi H, Goto M, Tao H, Inoue Y, Nakamura S, Misawa K, Mineta H and Sugimura H
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Journal Title
Oxid Med Cell Longev
Volume: 2016
Pages: 1546392
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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