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2015 Fiscal Year Research-status Report

次世代シークエンシング技術を利用したマメガキおよびカキの雌雄性制御機構の解明

Research Project

Project/Area Number 26660025
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

田尾 龍太郎  京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (10211997)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 河井 崇  京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 助教 (90721134)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords果樹 / 園芸 / 雌雄異株性
Outline of Annual Research Achievements

本研究では,従来の研究手法のみの利用では,さらなる研究の進展に限界があり,研究の発展が阻まれているマメガキの雌雄性研究に,近年,急速な進歩を遂げた次世代シークエンシング技術を導入することでブレークスルーをはかり,マメガキ(Diospyros lotus)の雌雄性決定因子を同定し,その結果を栽培カキ(D. kaki)の雌雄性研究に応用しようとするものである.昨年度までの研究で,マメガキの雌雄決定機構が明確になったので,研究2年目にあたる本年は栽培ガキの研究を進め,以下の実験結果を得た.
① マメガキの雄性決定遺伝子であるOGI遺伝子が,栽培器の雌雄性と関連性があるかどうか,マメガキのOGI配列を参考にPCR増幅用のプライマーを作製し調査した.
② 栽培ガキのOGI配列とMeGI配列をクローニングして,マメガキの配列と比較した.
③ 栽培ガキのsmall RNA-Seq解析とOGIとMeGI配列のメチル化解析を行った.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

マメガキの性決定領域が予想より小さかったことや次世代シークエンシング技術が予想以上にうまく機能したことから,既にマメガキにおける雌雄異株性の決定機構の解明に成功しており,栽培ガキの解析も順調に進んでいる.

Strategy for Future Research Activity

当初の計画以上の研究進展をみており,栽培ガキの雌雄性の制御機構の解明にも予定より早く着手できている.今後,栽培ガキの雌雄性の制御機構の解明に鋭意取り組む予定である.

Causes of Carryover

実験計画の一部が,当初の予定より効率的に行うことが可能であったため,次年度使用額が生じた.

Expenditure Plan for Carryover Budget

さらに研究の進展を早めるために,研究3年度目に予定していた研究をさらに充実させるために使用する.

  • Research Products

    (7 results)

All 2016 2015 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] マメガキ(Diospyros lotus L.)で同定された雄性決定因子連鎖領域とカキ(D. kaki Thunb.)品種の雄花着生特性との関連性2015

    • Author(s)
      梶田啓・赤木剛士・山根久代・田尾龍太郎・米森敬三
    • Journal Title

      園学研

      Volume: 14 Pages: 103-113

    • DOI

      doi: 10.2503/hrj.14.121

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] カキの性決定2015

    • Author(s)
      赤木剛士・田尾龍太郎
    • Journal Title

      果実日本

      Volume: 71 Pages: 24-26

  • [Presentation] Evolution of a flexible sex determination system in polyploid persimmon.2016

    • Author(s)
      Akagi, T., I. M. Henry, R. Tao and L. Comai
    • Organizer
      Plant and Animal Genome Conference XXIII
    • Place of Presentation
      San Diego, California
    • Year and Date
      2016-01-09 – 2016-01-13
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Variation on a theme: diploid and hexaploid persimmon regulate sex in slightly different ways2016

    • Author(s)
      Henry, I. M., T. Akagi, R. Tao and L. Comai
    • Organizer
      Plant and Animal Genome Conference XXIII
    • Place of Presentation
      San Diego, California
    • Year and Date
      2016-01-09 – 2016-01-13
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Successful utilization of the nex-generation sequencing technologies to identify sex determinant in persimmons: A possible application for kiwifruit study2015

    • Author(s)
      Akagi, T. and R. Tao
    • Organizer
      International Symposium on Genetic Bases for Kiwifruit Breeding
    • Place of Presentation
      Takamatsu, Japan
    • Year and Date
      2015-12-09 – 2015-12-09
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Sexuality in Diospyros species2015

    • Author(s)
      Tao, R.
    • Organizer
      Interrnational symposium of correlative gene system; Establishing next-generation genetics
    • Place of Presentation
      Nara, Japan
    • Year and Date
      2015-05-29 – 2015-05-30
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 京都大学アカデミックデイ2015 -果樹のライフサイクル研究の最前線-

    • URL

      http://research.kyoto-u.ac.jp/academic-day/2015/19/

URL: 

Published: 2017-01-06  

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