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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of the molecular basis of sex determination in Diospyros species by means of NGS technologies

Research Project

Project/Area Number 26660025
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

田尾 龍太郎  京都大学, 農学研究科, 教授 (10211997)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 河井 崇  京都大学, 農学研究科, 助教 (90721134)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords果樹 / 果樹ゲノム / 雌雄異株性
Outline of Annual Research Achievements

本研究では,従来の研究手法のみの利用では,さらなる研究の進展に限界があり,研究の発展が阻まれているマメガキの雌雄性研究に,近年,急速な進歩を遂げた次世代シークエンシング技術を導入することでブレークスルーをはかり,マメガキ(Diospyros lotus)の雌雄性決定因子を同定し,その結果を栽培カキ(D. kaki)の雌雄性研究に応用しようとするものである.研究初年度の研究でマメガキの雌雄決定機構が明確になったので,研究2年目以降は栽培ガキの研究を進めた.最終年度にあたる本年度も引き続き栽培ガキの雌雄性制御に関する研究を進め,以下の結果を得た.
① マメガキの雄性決定遺伝子であるOGI遺伝子の相同遺伝子が栽培ガキのゲノム中に存在するが,雄花を着生する栽培ガキには必ずこのOGI遺伝子が存在することを明らかにした.またOGI遺伝子がゲノム中に存在しない栽培ガキは雌花のみを着生することも明らかとなりOGIの存在が栽培ガキの雄花着生の必要条件であることを示した.
② 栽培ガキの栽培ガキのOGIの発現解析を行ったところ,栽培ガキではOGIの発現はほとんど見られないことが明らかになった.しかしながらMeGI由来のsmall RNAが雄花を着生する芽で多く産出されていた.
③ 栽培ガキのOGIにはSINE様の配列が挿入されており,このことによりOGI遺伝子がメチル化され,OGIの発現が抑制されていることが明らかになった.
④ 以上の結果に基づいて,栽培ガキにおける不安定な性表現の制御機構の作業仮説を構築し,論文発表した.

  • Research Products

    (14 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 6 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] UC Davis(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      UC Davis
  • [Journal Article] A male determinant gene in diploid dioecious Diospyros, OGI, is required for male flower production in monoecious individuals of Oriental persimmon2016

    • Author(s)
      Akagi, T., T. Kawai, and R. Tao
    • Journal Title

      Sci. Hort.

      Volume: 213 Pages: 243-251

    • DOI

      doi.org/10.1016/j.scienta.2016.10.046

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Epigenetic regulation of the sex determination gene MeGI in polyploid persimmon2016

    • Author(s)
      Akagi, T., I. M. Henry, T. Kawai, L. Comai and R. Tao
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: 28 Pages: 2905-2915

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1105/tpc.16.00532

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Transcriptomic analysis to dissect flower sexuality determination mechanism in Diospyros kaki2017

    • Author(s)
      Yang, Ho-Wen・赤木剛士・田尾龍太郎
    • Organizer
      園芸学会春季大会
    • Place of Presentation
      日本大学生物資源学部
    • Year and Date
      2017-03-19 – 2017-03-20
  • [Presentation] 柿における性の成立と揺らぐ性への進化2016

    • Author(s)
      赤木剛士
    • Organizer
      植物科学シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大
    • Year and Date
      2016-12-07 – 2016-12-07
    • Invited
  • [Presentation] Sex determination in Diospyros2016

    • Author(s)
      Tao, R.
    • Organizer
      ISHS VI International Symposium on Persimmon
    • Place of Presentation
      Valencia, Spain
    • Year and Date
      2016-10-16 – 2016-10-20
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Possible applications of the current knowledge of sex determination in Diospyros to persimmon breeding and culture2016

    • Author(s)
      Tao, R. and T. Akagi
    • Organizer
      ISHS VI International Symposium on Persimmon
    • Place of Presentation
      Valencia, Spain
    • Year and Date
      2016-10-16 – 2016-10-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Current progress in the studies on sex determination in Diospyros2016

    • Author(s)
      Tao, R.
    • Organizer
      The Second Asian Horticultural Congress
    • Place of Presentation
      Chengdu, China
    • Year and Date
      2016-09-26 – 2016-09-28
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 木本性植物における性決定機構の多様性と一般性 ~カキとキウイフルーツと…2016

    • Author(s)
      赤木剛士
    • Organizer
      日本植物学会
    • Place of Presentation
      沖縄コンベンションセンター
    • Year and Date
      2016-09-16 – 2016-09-19
    • Invited
  • [Presentation] カキ属の性決定を統御する転写因子2016

    • Author(s)
      赤木剛士
    • Organizer
      園芸学会秋季大会
    • Place of Presentation
      名城大学
    • Year and Date
      2016-09-10 – 2016-09-12
    • Invited
  • [Presentation] エピジェネティックな記憶によるカキの可塑的な性決定(第2報)2016

    • Author(s)
      赤木剛士・Isabelle M. Henry・Luca Comai・田尾龍太郎
    • Organizer
      園芸学会秋季大会
    • Place of Presentation
      名城大学
    • Year and Date
      2016-09-10 – 2016-09-12
  • [Presentation] カキ属植物における「柔軟な」性決定~遺伝的制御からエピジェネティック性への進化2016

    • Author(s)
      赤木剛士
    • Organizer
      日本遺伝学会
    • Place of Presentation
      国立遺伝学研究所
    • Year and Date
      2016-09-07 – 2016-09-09
    • Invited
  • [Presentation] A review of the current progress in our studies on sex determination in Diospyros2016

    • Author(s)
      Tao, R.
    • Organizer
      ISHS International Workshop on Floral Biology and S-Incompatibility in Fruit Species
    • Place of Presentation
      Murcia, Spain
    • Year and Date
      2016-05-23 – 2016-05-26
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 京都大学大学院農学研究科農学専攻果樹園芸学研究室

    • URL

      http://www.pomology.kais.kyoto-u.ac.jp/

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Published: 2018-01-16   Modified: 2022-02-16  

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