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2015 Fiscal Year Annual Research Report

タンパク質ポリマー形成による動的膜形態形成の直接可視化による解明

Publicly Offered Research

Project AreaNovel measurement techniques for visualizing 'live' protein molecules at work
Project/Area Number 15H01641
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

末次 志郎  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (70345031)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Keywords生物物理学
Outline of Annual Research Achievements

試験管内のBARドメインタンパク質による脂質膜チューブ形成の開始と伸長過程の可視化
endophilinについては、安藤班と共同で、原子間力顕微鏡によりチューブ形成の可視化に成功した。しかし、チューブ形成は非常に短時間で生じることがわかった。この急速なチューブ形成のため、原子間力顕微鏡の走査速度では、脂質膜表面のタンパク質の粒子は観察できず、従って、チューブ形成の過程の可視化には成功していない。そこで、チューブ形成を緩やかに生じさせるために、脂質膜の組成を検討した。endophilinと様々な組成の再構成膜を反応させ、再構成膜の形態を負染色により電子顕微鏡で観察した。その結果、脂質膜の脂肪酸の飽和度や電荷を持ったホスファチジルセリンの含量によってチューブ形成能が変化することを見出した。
細胞内のBARドメインタンパク質による脂質膜チューブ形成の開始過程の可視化
BARドメインタンパク質を培養細胞において観察するために、GFP融合タンパク質の安定発現株の樹立を試み、またレトロウイルスによる安定発現を行った。次にGFPの一分子局在を解析するために、GFPに対する組み換え抗体(nanobody)を用いた。Nanobodyは分子量が通常の抗体よりも小さいために、浸透がよく、GFPの標識密度を上げることが可能であると考えられる。GFPに対するnanobodyをAlexa647で標識し、超解像観察を行った結果、分子局在を細胞内で検出することに成功した。その際近接距離は、タンパク質分子の大きさと近く、BARドメインタンパク質の膜上での整列が示唆された。BARドメインを直接ラベルする抗体については適切な抗体を見出せなかったため引き続き抗体を検討する予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

すでに目的としているBARドメインタンパク質の一定の可視化に成功しているため。

Strategy for Future Research Activity

ホスホイノシタイドの集積が、BARタンパク質のよる脂質膜チューブ形成のきっかけとなる可能性が考えられるので、ホスホイノシタイドを添加して作製したリポソームを用いて膜チューブ形成を観察する。ホスホイノシタイドの位置は、特異的に結合するPHドメインなどを用いて可視化することを検討する。また、超解像解析をさらに推し進め、細胞内における分子数に対する観察分子数を推定することで、多量体形成を結論づける。さらに、構造解析により同定したコンタクトサイトのアミノ酸残基に変異をいれ、変異体タンパク質を発現精製して、試験管内での脂質膜の形態形成における影響を調べる。また、細胞における膜構造形成における役割も、変異体を発現させることにより調べる。

  • Research Products

    (10 results)

All 2016 2015

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results,  Open Access: 4 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Higher-order assemblies of BAR domain proteins for shaping membranes.2016

    • Author(s)
      Suetsugu S.
    • Journal Title

      Microscopy (Oxf)

      Volume: 65 Pages: 201-210

    • DOI

      10.1093/jmicro/dfw002

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Yeast Ivy1p Is a Putative I-BAR-domain Protein with pH-sensitive Filament Forming Ability in vitro.2016

    • Author(s)
      Itoh Y, Kida K, Hanawa-Suetsugu K, Suetsugu S.
    • Journal Title

      Cell Struct Funct.

      Volume: 41 Pages: 1-11

    • DOI

      10.1247/csf.15014.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Phosphorylation of PACSIN2 by protein kinase C triggers the removal of caveolae from the plasma membrane.2015

    • Author(s)
      Senju Y, Rosenbaum E, Shah C, Hamada-Nakahara S, Itoh Y, Yamamoto K, Hanawa-Suetsugu K, Daumke O, Suetsugu S.
    • Journal Title

      J Cell Sci.

      Volume: 128 Pages: 2766-2780

    • DOI

      10.1242/jcs.167775

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Possible regulation of caveolar endocytosis and flattening by phosphorylation of F-BAR domain protein PACSIN2/Syndapin II.2015

    • Author(s)
      Senju Y, Suetsugu S.
    • Journal Title

      Bioarchitecture

      Volume: 5 Pages: 70-77

    • DOI

      10.1080/19490992.2015.1128604.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] TRPV4イオンチャネルのアンキリンリピート ドメインとPI(4,5)P2の相互作用による新たな制御機構2015

    • Author(s)
      末次志郎, 高橋重成, 伊藤弓弦, 竹村和浩, 嶋田 睦, 北尾彰朗, 森 泰生
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 55 Pages: 262-265

    • DOI

      10.2142/biophys.55.262

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] PACSIN2のリン酸化によるカベオラ細胞膜局在の負の制御2015

    • Author(s)
      千住 洋介、末次 志郎
    • Organizer
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県、神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-04
  • [Presentation] BARタンパク質エンドフィリンの膜切断活性とがんにおける変異2015

    • Author(s)
      木田 和輝、北又 学、塙 京子、末次 志郎
    • Organizer
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県、神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
  • [Presentation] 新規結合タンパク質によるF-BARタンパク質CIP4の管状形成阻害2015

    • Author(s)
      福永 優也、塙 京子、末次 志郎
    • Organizer
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県、神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
  • [Presentation] IRSp53の上皮間葉転換における役割2015

    • Author(s)
      多羅尾 賢斗、塙 京子、末次 志郎
    • Organizer
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県、神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
  • [Presentation] The identificaiton of the ankyrin repeat domain as a novel lipid-binding module2015

    • Author(s)
      末次 志郎
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学(石川県、金沢市)
    • Year and Date
      2015-09-14
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2017-01-06  

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