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2017 Fiscal Year Annual Research Report

アッセンブリーシャペロンが関わるプロテアソームの動的成熟過程の活写

Publicly Offered Research

Project AreaNovel measurement techniques for visualizing 'live' protein molecules at work
Project/Area Number 17H05890
Research InstitutionNagoya City University

Principal Investigator

矢木 宏和  名古屋市立大学, 大学院薬学研究科, 講師 (70565423)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2019-03-31
Keywordsプロテアソーム / アッセンブリー過程 / 高速AFM
Outline of Annual Research Achievements

平成29年度当初は2つのサブユニットのみで構成される古細菌由来のプロテアソームを対象として研究を進めた。その結果、古細菌のプロテアソームとアッセンブリーシャペロンのホモログが結合した状態を高速AFM解析と溶液散乱を用いて捉えることに成功した。こうした研究を通じて、真核生物のプロテアソームのアッセンブリー中間体を解析するための基盤技術を整えることができた。
真核生物のプロテアソームに関しては、大腸菌発現系を用いて、7種類のαサブユニットおよびアッセンブリーシャペロンをリコンビナントタンパク質として調製することに成功した。これらタンパク質を超分子質量分析に供したところ、14量体構造を示すα7以外のαサブユニットは単量体と2量体の平衡状態で存在することを明らかにした。リコンビナントタンパク質として調製した各αサブユニットとアッセンブリーシャペロン(PAC1-2およびPAC3-4)を試験管内で混ぜ合わせた結果、PAC1-2がα1およびα2と結合した複合体、PAC3-4がα5と結合した複合体がアッセンブリー中間体として存在することを見出した。また、混合試料をゲル濾過カラムで分離した高分子量の分画に、α7とα6が7:1で含まれるヘテロオクタマーが形成されていることも見出した。このヘテロ8量体の形成過程に関しては、高速AFM解析によってα7ホモ14量体とα6による形成過程の可視化を試みた。その結果、2重リング構造を形成しているα7の14量体に対して単量体のα6が相互作用することで、2重リング構造が開裂し、α7の1重リング構造の中心にα6が結合するという中間体形成プロセスを明らかにすることに成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

大腸菌発現系を用いて、7種類のαサブユニットおよびアッセンブリーシャペロンをリコンビナントタンパク質と調製することが可能となったため、プロテアソームのアッセンブリー中間体を取れることに成功している。一部のアッセンブリー中間体に関しては、高速AFM解析によってその形成過程を捉えることに成功した。こうした結果は、2017年の11月に論文公表している [Kozai et al. Scientific Reportsvolume 7, Article number: 15373 (2017)]。
以上の成果を総合的に判断して順調に研究は進展しているものと判断している。

Strategy for Future Research Activity

前年度に引き続き、同定したアッセンブリー中間体は、超分子質量分析により複合体中の構成サブユニットの化学量論を明らかにする。
古細菌由来のプロテアソーム複合体を対象として行った溶液散乱や高速AFMなど解析から蓄積することのできた各計測手法の基盤技術を真核生物のプロテアソーム中間体のキャラクタライズへ応用する。前年度までに明らかになっているアッセンブリー中間体に関しては、構成コンポーネントを組換えタンパク質として大量発現し、試験管内再構築をすることにより、その3次元構造情報を得ることを試みる。また本研究で見出される形成中間体は、動的であり構造的に不均一である可能性が高いため、高速AFMで複合体を測定する。さらにはこうした複合体に関して、構成するサブユニットを順次加えて行くことで、高速AFMによって複合体の形成過程を活写することを試みる。
一方で、安定性の高い中間体においては、量子ビーム散乱も利用して、構造のキャラクタライズを行うことも計画している。

  • Research Products

    (9 results)

All 2018 2017

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] Conversion of functionally undefined homopentameric protein PbaA into a proteasome activator by mutational modification of its C-terminal segment conformation2018

    • Author(s)
      Yagi-Utsumi, M., Sikdar, A., Kozai, T., Inoue, R., Sugiyama, M., Uchihashi, T., Yagi, H., Satoh, T., Kato, K.
    • Journal Title

      Protein Engineering, Design and Selection

      Volume: 31(1) Pages: 29-36

    • DOI

      10.1093/protein/gzx066

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Two-step process for disassembly mechanism of proteasome α7 homo-tetradecamer by α6 revealed by high-speed atomic force microscopy2017

    • Author(s)
      Kozai, T., Sekiguchi, T., Satoh, T., Yagi, H., Kato, K., Uchihashi, T.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7(1) Pages: art. no. 15373

    • DOI

      10.1038/s41598-017-15708-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 構造に基づいたプロテアソームのサブユニット集合メカニズムの理解2018

    • Author(s)
      関口太一朗,河村裕樹,栗本英治,矢木宏和,佐藤匡史,加藤晃一
    • Organizer
      第5回 将来を見据えた生体分子の構造・機能解析から分子設計に関する研究会
  • [Presentation] 超分子質量分析によるプロテアソーム構成サブユニットの相互作用解析2018

    • Author(s)
      石井健太郎,関口太一朗,矢木宏和,佐藤匡史,内山 進,加藤晃一
    • Organizer
      平成29年度中部支部講演会
  • [Presentation] α7サブユニットを起点としたαリング形成中間体の同定と構造解析2017

    • Author(s)
      関口太一朗,河村裕樹,石井健太郎,Chihong Song,村田和義,栗本英治,内山 進,矢木宏和,佐藤匡史,加藤晃一
    • Organizer
      第81回 日本生化学会中部支部例会・シンポジウム
  • [Presentation] アッセンブリーシャペロンが関わるプロテアソームの動的成熟過程の活写2017

    • Author(s)
      矢木宏和
    • Organizer
      新学術領域研究「動的構造生命」第3回 班会議
  • [Presentation] 高速原子間力顕微鏡で可視化するタンパク質の動的秩序2017

    • Author(s)
      内橋貴之,杉山翔吾,小財稔矢,與語理那,谷中冴子,佐藤匡史,矢木宏和,盛 徹也,Carl Johnson,安藤敏夫,加藤晃一
    • Organizer
      第17回 日本蛋白質科学会
  • [Presentation] 高速 AFM 観察で明らかにされた α7 ホモ 14 量体の α6 による解体過程2017

    • Author(s)
      小財稔矢,佐藤匡史,矢木宏和,内橋貴之,加藤晃一
    • Organizer
      第55回 日本生物物理学会年会
  • [Presentation] 試験管内再構成系を利用したプロテアソームアッセンブリー機構の解析2017

    • Author(s)
      河村裕樹,関口太一朗,栗本英治,矢木宏和,佐藤匡史,加藤晃一
    • Organizer
      日本病院薬剤師東海ブロック・日本薬学会東海支部 合同学術大会2017

URL: 

Published: 2018-12-17  

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