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2010 Fiscal Year Annual Research Report

RNAサイレンシング機構からみたメリステムの解析

Publicly Offered Research

Project AreaPlant regulatory systems that control developmental interactions between meristems and lateral organs
Project/Area Number 21027008
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

渡邊 雄一郎  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 教授 (60183125)

Keywords小分子RNA / tasiRNA / Processing Body / SGS3/RDR6 body / 植物ウイルス / RNAプロセッシング
Research Abstract

1)SGS3はRNA-dependent RNA polymerase 6(RDR6)と協働してウイルス由来のRNAに対する小分子RNA、内在性のTAS遺伝子を前駆体とする小分子RNAの生合成に関わる。このSGS3とRDR6が相互作用すること、さらに新規な構造体SGS3/RDR6-bodyとなづけた構造に局在することが明らかとなった。mRNAの分解や貯蓄を担うProcessing-body(P-body)とは独立の構造であった。このことで、tasiRNA生成の過程で中間体が細胞内で複雑に、複数の会合体間を移動することが示唆された。今後一過的な発現ではなく、ナチュラルに近い状態での発現におけるSGS3/RDR6-bodyの存在、組織依存性、発生時期依存性を明らかとする必要性がでてきた。
2)免疫沈降法によるAGO1と結合する3種類の候補タンパク質の解析をおこないかたわら、東京大学大学院理学系研究科の上田貴志氏に種々の細胞内膜系のマーカーを発現するラインをいただき、詳細なAGO1あるいはP-bodyとの関係を解析した。
3)AGO1,RDR6タンパク質の発現の組織特異性、発生時期特異性を検討するために、各遺伝子のプロモーター(2-3kb)下流にGUS遺伝子をつなぎ、形質転換体を作成した。双方の発現はメリステム近辺で強いが、AGO1タンパク質は発芽後一週間ほど、RDR6はむしろそれに遅れて10日過ぎに発現が多くなることを見いだした。今後SGS3についても同様のプロモーター解析を行い、SGS3/RDR6-bodyの時空間的機能解析の重要性が明らかとなり、解析を継続している。

  • Research Products

    (12 results)

All 2010 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (3 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Network modeling reveals prevalent negative regulatory relationships between signaling sectors in Arabidopsis immune signaling2010

    • Author(s)
      Sato, M.
    • Journal Title

      PLoS Pathogen

      Volume: 6 Pages: e1001011(1-15)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Large-scale analysis of full-length cDNA of tomato (Solanum lycopersicum) cultivar Micro-Tom, a reference system for Solanaceae genomics2010

    • Author(s)
      Aoki, K.
    • Journal Title

      BMC Genomics

      Volume: 11 Pages: 210(1-16)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fabrication of aligned magnetic nanoparticles using tobam oviruses2010

    • Author(s)
      Kobayashi, M.
    • Journal Title

      NANO letters

      Volume: 10 Pages: 773-776

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fabrication of 3-nm platinum wires using a tobacco mosaic virus template2010

    • Author(s)
      Kobayashi, M.
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: 39 Pages: 616-618

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reduction of amyloid beta-peptide accumulation in Tg2576 transgenic mice by oral vaccination2010

    • Author(s)
      Ishii-Katsuno, R.
    • Journal Title

      Biochem.Biophys.Res.Communication

      Volume: 399 Pages: 593-599

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 植物におけるmiRNAの生合成経路2010

    • Author(s)
      渡辺雄一郎
    • Journal Title

      生体の科学

      Volume: 61 Pages: 349-354

  • [Journal Article] 植物における小分子RNAの動態制御2010

    • Author(s)
      渡辺雄一郎
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 82 Pages: 397402

  • [Presentation] 小分子RNAの細胞内・細胞間移動2010

    • Author(s)
      渡邊雄一郎
    • Organizer
      日本植物学会
    • Place of Presentation
      中部大学・春日井
    • Year and Date
      2010-09-10
  • [Presentation] 植物の小分子RNAの理解とその応用の可能性2010

    • Author(s)
      渡邊雄一郎
    • Organizer
      日本RNA i研究会
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル 広島
    • Year and Date
      2010-08-27
  • [Presentation] 植物はRNAを介してどれだけの状況判断ができるのか2010

    • Author(s)
      渡邊雄一郎
    • Organizer
      RNAから植物を考える~植物RNA研究の最先端~
    • Place of Presentation
      北海道大学・創成研究機構
    • Year and Date
      2010-08-26
  • [Book] Plant microRNA protocol book/Methods in Molecular Biology series2010

    • Author(s)
      Tagami, Y., Watanabe, Y.
    • Total Pages
      16
    • Publisher
      Human Press
  • [Remarks]

    • URL

      http://bio.c.u-tokyo.ac.jp/labs/watanabe/ResearchTopics.htm

URL: 

Published: 2012-07-19  

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