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2010 Fiscal Year Annual Research Report

レーザー脱離法による生体分子高次構造の生成と赤外振動スペクトルによる構造解析

Publicly Offered Research

Project AreaMolecular Science for Supra Functional Systems ? Development of Advanced Methods for Exploring Elementary Process
Project/Area Number 22018023
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

三枝 洋之  横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 教授 (90162180)

Keywords核酸塩基ヌクレオチド / レーザー脱離法 / 超音速ジェット法 / 赤外振動スペクトル / 非調和振動計算
Research Abstract

レーザー脱離法は、熱的に不安定な生体分子を非破壊的に気化するのに有効であるが、気化した分子は高温であるためクラスターの生成には極低温冷却する必要がある。本研究では、独自に開発したレーザー脱離装置を用いて、糖-リン酸基が塩基に結合した塩基ヌクレオチドを非破壊的に気化することに初めて成功した。これは、塩基ヌクレオチドが脱プリン化反応を起こすことを抑制するために、リン酸基をエステル化することで可能となった。このリン酸基のエステル化は、早川芳宏教授(愛知工業大学)と塚本眞幸博士(名古屋大学)との共同研究として行われ、今後2個以上の核酸塩基がリン酸基で結合したポリヌクレオチドを合成し、これを気相孤立化することで、塩基対の高次構造形成における糖-リン酸基バックボーンの役割を検討できると期待される。
また本研究では、このような大規模分子系に適用可能な非調和振動理論を開発し、これを用いて塩基対や塩基水和の構造を決定することを山梨大学(現、University of Illinois)八木清博士との共同研究として行った。その結果、グアノシンのようなヌクレオシドや塩基水和物の赤外振動スペクトルを、低振動モードのカップリングを効率的に取り入れることにより、従来のようなスケーリング因子を用いることなく再現することが可能となった。この成果は、Pacifichem 2010 Congressにて公表(865220)し、オーガナイザーにより注目論文の一つに採択された。

  • Research Products

    (14 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (9 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Mass Spectrometry for Nonvolatile Functional Molecules by Laser Desorption/Vacuum-Ultraviolet Photoionization Method2011

    • Author(s)
      R.Kikkawa, Y.Inokuchi, T.Ebata, H.Saigusa
    • Journal Title

      BECKNIK(ロシアオレンブルグ大学紀要)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mass Spectrometry for Nonvolatile Functional Molecules by Laser Desorption/Vacuum-Ultraviolet Photoionization Method2011

    • Author(s)
      三枝洋之
    • Journal Title

      横浜市立大学叢書

      Volume: 61 Pages: 91-100

  • [Journal Article] Microhydration of the guanine-guanine and guanine-cytosine base pairs2010

    • Author(s)
      S.Urashima, H.Asami,, M.Ohba, H.Saigusa
    • Journal Title

      Journal of Physical Chemistry A

      Volume: 114 Pages: 11231-11237

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Gas-phase isolation of diethyl guanosine 5'-monophosphate and its conformational assignment2010

    • Author(s)
      H.Asami, M.Tsukamoto, Y.Hayakawa, H.Saigusa
    • Journal Title

      Physical Chemistry Chemical Physics

      Volume: 12 Pages: 13918-13921

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Non-destructive vaporization of GMP enabled by the phosphoesterification : Conformational preference in the gas phase2010

    • Author(s)
      H.Asami, A.Motoda, M.Tsukamoto, Y.Hayakawa, H.Saigusa
    • Organizer
      37th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Place of Presentation
      Yokohama, Japan
    • Year and Date
      20101110-20101112
  • [Presentation] Effects of hydration on the base pair structures of guanine-Stacked vs.planar base pairing2010

    • Author(s)
      H.Asami, H.Saigusa
    • Organizer
      Pacifichem 2010 Congress (872314)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawai
    • Year and Date
      2010-12-17
  • [Presentation] Conformational analysis of the guanine nucleosides based on ab initioanharmonic vibrational calculation2010

    • Author(s)
      H.Asami, H.Saigusa, K.Yagi
    • Organizer
      Pacifichem 2010 Congress (865220)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawai
    • Year and Date
      2010-12-17
  • [Presentation] Microhydration of the guanine nucleosides and base pairs2010

    • Author(s)
      H.Saigusa
    • Organizer
      Pacifichem 2010 Congress (842124)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawai
    • Year and Date
      2010-12-16
  • [Presentation] 揮発性分子のレーザー蒸発/レーザー分光の装置開発2010

    • Author(s)
      吉川竜一, 片桐勇志, 江幡孝之, 井口佳哉, 三枝洋之
    • Organizer
      分子科学討論会2010(4A16)
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      2010-09-17
  • [Presentation] グアニンヌクレオチドのリン酸基エステル化による非破壊的気化と赤外振動分光2010

    • Author(s)
      浅見祐也, 元田彩香, 塚本眞幸, 早川芳宏, 三枝洋之
    • Organizer
      分子科学討論会2010(3A01)
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      2010-09-16
  • [Presentation] 赤外-紫外二重共鳴分光法によるグアニン-シトシン及びグアニン-グアニン塩基対の微細水和構造解析2010

    • Author(s)
      浦島周平, 浅見祐也, 三枝洋之
    • Organizer
      分子科学討論会2010(3A02)
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      2010-09-16
  • [Presentation] 9-メチルグアニン一水和物の電子状態とその性質2010

    • Author(s)
      伊藤悠太, 浅見祐也, 三枝洋之, 小関史朗, 河野裕彦, 島倉紀之
    • Organizer
      分子科学討論会2010(3P097)
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      2010-09-16
  • [Presentation] Infrared Spectra of Hydrated Clusters of Guanine Nucleosides Observed by IR-UV Double Resonance Spectroscopy2010

    • Author(s)
      S.Urashima, H.Asami, H.Saigusa
    • Organizer
      International Symposium on Molecular Spectroscopy 65th Meeting (TB05)
    • Place of Presentation
      Columbus, Ohio
    • Year and Date
      2010-06-22
  • [Remarks]

    • URL

      http://laser.sci.yokohama-cu.ac.jp/

URL: 

Published: 2012-07-19  

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