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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Development of the cell-free synthesis system of membrane proteins for integration into society

Publicly Offered Research

Project AreaBottom-up creation of cell-free molecular systems: surpassing nature
Project/Area Number 22H05392
Research InstitutionIwate University

Principal Investigator

西山 賢一  岩手大学, 農学部, 教授 (80291334)

Project Period (FY) 2022-06-16 – 2024-03-31
Keywordsタンパク質膜挿入 / 再構成 / 試験管内タンパク質合成 / MPIase / 膜保護活性
Outline of Annual Research Achievements

申請者らはモデル生物大腸菌におけるタンパク質膜挿入機構を解析し、糖脂質MPIaseを同定し、構造・機能解析を進めてきた。SecYEGやSRP、YidCなど、従来タンパク質膜挿入に関与することが知られている因子とMPIaseを組み合わせて、タンパク質膜挿入の再構成系の構築に成功した。再構成リポソームはマグネシウムなどの化学物質に対して不安定であることに着想を得て、生体膜に耐性度を与える物質、BPFの精製を進めてきた。前年度までの解析により、BPFはMPIaseに類似の化合物であることがわかっていた。本年度はBPFの構造をより詳細に解析したところ、BPFとMPIaseは同一の構造であることが判明した。したがって、MPIaseとタンパク質性の膜挿入因子を組み合わせることにより汎用的な膜タンパク質合成・膜挿入システムの構築ができると期待される。MPIaseは微量糖脂質であるため、MPIaseの部分化学合成標品を用いて本システムの構築を目指した。MPIaseはアセチル化された3種のアミノ糖からなる糖ユニットが10回程度繰り返した糖鎖をもつ。繰り返し数が1のmini-MPIaseでも膜挿入活性が発現し、繰り返し数が2、3と増加するにつれ膜挿入活性が上昇した。3糖ユニットを構成するGlcNAcの6位は一部O-アセチル化されている。O-アセチル基を有するmini-MPIaseでは強い膜挿入活性が検出されたが、O-アセチル基をもたないmini-MPIaseではほとんど膜挿入活性が観察されなかった。一方、O-アセチル基をもたないmini-MPIaseは強い膜保護活性を示し、O-アセチル基をもつmini-MPIaseの膜保護活性は弱かった。O-アセチル基をもつmini-MPIaseとO-アセチル基をもたないmini-MPIaseを共存させることにより汎用的な膜挿入システムの構築が可能になる。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (21 results)

All 2024 2023 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (17 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] CdsA, a CDP‐diacylglycerol synthase involved in phospholipid and glycolipid MPIase biosynthesis, possesses multiple initiation codons2024

    • Author(s)
      Hikage Runa、Sekiya Yusei、Sawasato Katsuhiro、Nishiyama Ken‐ichi
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 29 Pages: 347~355

    • DOI

      10.1111/gtc.13104

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structural Requirements of a Glycolipid MPIase for Membrane Protein Integration2023

    • Author(s)
      Fujikawa Kohki、Han Youjung、Osawa Tsukiho、Mori Shoko、Nomura Kaoru、Muramoto Maki、Nishiyama Ken‐ichi、Shimamoto Keiko
    • Journal Title

      Chemistry-A European Journal

      Volume: 29 Pages: e202300437

    • DOI

      10.1002/chem.202300437

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Coordinated upregulation of two CDP-diacylglycerol synthases, YnbB and CdsA, is essential for cell growth and membrane protein export in the cold2023

    • Author(s)
      Kamemoto Yuki、Hikage Runa、Han Youjung、Sekiya Yusei、Sawasato Katsuhiro、Nishiyama Ken-ichi
    • Journal Title

      FEMS Microbiology Letters

      Volume: 370 Pages: fnad131

    • DOI

      10.1093/femsle/fnad131

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 低温かつ CdsA の制限された条件における YnbB の重要性2024

    • Author(s)
      日景瑠那、西山賢一
    • Organizer
      第4回細胞形成研究会
  • [Presentation] タンパク質膜挿入に関わる糖脂質酵素MPIaseの構造と機能に関する研究2024

    • Author(s)
      Han Youjung、西山賢一
    • Organizer
      第4回細胞形成研究会
  • [Presentation] 大腸菌内膜、外膜由来の生体膜保護物質の同定と構造・機能解析2024

    • Author(s)
      古谷萩、西山賢一
    • Organizer
      第4回細胞形成研究会
  • [Presentation] 生体膜保護物質(BPF)の同定・構造機能解析~BBMV由来のマウスBPF精製スキームの検討~2024

    • Author(s)
      渡会未夢、古谷萩、Wiriyasermukul Pattama、永森收志、西山賢一
    • Organizer
      第4回細胞形成研究会
  • [Presentation] TATタンパク質膜透過機構の解析2024

    • Author(s)
      西川華子、西山賢一
    • Organizer
      第4回細胞形成研究会
  • [Presentation] YidCと相互作用する機能未知因子YibNのin vitro 解析2024

    • Author(s)
      山本波知、西川華子、Katherine Zhao、Franck Duong、西山賢一
    • Organizer
      第4回細胞形成研究会
  • [Presentation] 大腸菌生体膜由来の膜保護物質の同定および構造機能解析2024

    • Author(s)
      古谷 萩、沢里克宏、森祥子、藤川紘樹、島本啓子、西山賢一
    • Organizer
      第9回デザイン生命工学研究会
  • [Presentation] 再構成系を用いたTAT 膜透過機構の解析2024

    • Author(s)
      西川 華子、山本 波知、菅野 琴華、沢里 克宏、山田 美和、西山 賢一
    • Organizer
      第18 回 無細胞生命科学研究会
  • [Presentation] 大腸菌EmrE タンパク質の膜挿入機構の解析2024

    • Author(s)
      山本 波知、小川 裕太、西川 華子、松浦 友亮、西山 賢一
    • Organizer
      第18 回 無細胞生命科学研究会
  • [Presentation] リン脂質および糖脂質MPIase 生合成に関わるCDP-ジアシルグリセロール生合成酵素をコードするcdsA遺伝子の翻訳開始領域の解析2024

    • Author(s)
      日景瑠那 、関谷優晟 、沢里克宏 、西山賢一
    • Organizer
      日本農芸化学会 2024年度大会
  • [Presentation] CDP-ジアシルグリセロール生合成酵素CdsAの翻訳開始領域の解析2023

    • Author(s)
      日景瑠那、西山賢一
    • Organizer
      第19回 21世紀大腸菌研究会
  • [Presentation] 大腸菌のタンパク質膜挿入に関わる糖脂質MPIaseの生合成酵素の探索2023

    • Author(s)
      澁谷まゆ、Han Youjung、田近優太、大澤月穂、藤川絋樹、島本啓子、西山賢一
    • Organizer
      予知生合成科学 第2回公開シンポジウム
  • [Presentation] 構造類似糖脂質MPIase、BPF、ECAの生合成酵素の探索・比較による糖付加戦略の解明2023

    • Author(s)
      西山賢一
    • Organizer
      予知生合成科学 第2回公開シンポジウム
  • [Presentation] 社会実装を目指した汎用的セル・フリー膜タンパク質合成システムの開発2023

    • Author(s)
      西山賢一
    • Organizer
      超越分子システム 第二回領域会議
  • [Presentation] 膜タンパク質の複合体形成と機能発現におけるMPIaseの役割2023

    • Author(s)
      山本波知、西川華子、Pattama Wiryasermkul、永森収志、西山賢一
    • Organizer
      超越分子システム 第二回領域会議
  • [Presentation] TAT (Twin-Arginine Translocation )膜透過機構の解析2023

    • Author(s)
      西川華子、山本波知、菅野琴華、沢里克宏、山田美和、西山賢一
    • Organizer
      第96回日本生化学会大会
  • [Presentation] タンパク質膜挿挿入に関与するMPIase生合成酵素の探索2023

    • Author(s)
      Han Youjung、藤川 紘樹、島本啓子、西山賢一
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
  • [Remarks] 岩手大学農学部・応用生物化学科・分子生物学研究室

    • URL

      http://news7a1.atm.iwate-u.ac.jp/~sec/

URL: 

Published: 2024-12-25  

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