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2022 Fiscal Year Annual Research Report

合成分子と生体分子によって超越する遺伝子発現光制御システムの構築

Publicly Offered Research

Project AreaBottom-up creation of cell-free molecular systems: surpassing nature
Project/Area Number 22H05425
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

蓑島 維文  大阪大学, 大学院工学研究科, 准教授 (20600844)

Project Period (FY) 2022-06-16 – 2024-03-31
Keywords転写制御 / 光応答性色素 / 多剤結合転写因子
Outline of Annual Research Achievements

本研究では生体分子、低分子化合物、光を用いて可逆的に遺伝子発現を制御できる手法の構築に取り組む。光は範囲、時間、強度、波長といったパラメータを調節して照射することができるため、時空間的な操作、変換量の細かい調節に優れている。転写制御因子と光変換可能な低分子を組み合わせて、天然の細胞が持たない、光の波長に応じた高い効率の遺伝子発現の活性化、不活性化の制御をシンプルな系で実現することを目指す。
光応答で駆動する遺伝子発現系を構築するため、バクテリアの薬剤排出ポンプの発現系を制御している多剤結合転写因子、QacRの機能に着目した。QacRは通常遺伝子のリプレッサーとして機能しており、転写を抑制しているが、カチオン性の色素分子と結合するとDNAから解離し、転写を活性化させる。そこで、カチオン性の色素に結合する性質に基づき、光を照射することでカチオン性が現れる色素を利用することで光駆動型の遺伝子発現系が構築できると考えた。色素を探索した結果、光活性化能を持つイメージング用色素として近年報告されたXanthone系色素を選択した。この色素を合成し、光を照射したところ速やかにカチオン性を持つ物質に変換されることを確認した。次に、この色素のQacRに対する結合能を蛍光偏光、ITCを用いて評価したところ、光照射後の化合物選択的にQacRと結合することを確認した。また、QacRに制御される転写量のコントロールが可能かin vitro transcriptionを利用してRNA量を調べたところ、発現量が光照射後に上昇していることが分かった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

本研究課題は採択時から立ち上げたものであるが、光応答性分子の合成、多剤結合転写因子を利用した発現系の構築が順調に進んでおり、試験管内の評価において光による転写活性の制御を達成できたことから、当初の計画以上のペースで進展していると考える。

Strategy for Future Research Activity

開発したQacRと光活性化色素を利用した転写制御法がタンパク質発現まで適用できるかどうか、in vitro及び生細胞における発現系に組み込むことで検証する。発現のレポーターとして、ルシフェラーゼ及び蛍光タンパク質を使ってまずは評価を行う。光照射の時間、強度、波長について検討し、光制御に適した条件について検討する。発現量の差が低い場合は色素およびQacRアミノ酸の変異体を用いることでスクリーニングを行い、発現量のさらなる上昇を目指す。また本発現制御系を用いた遺伝子発現制御技術への応用、共同研究を展開する。

  • Research Products

    (12 results)

All 2023 2022

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 3 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Development of a Versatile Protein Labeling Tool for Live‐Cell Imaging Using Fluorescent β‐Lactamase Inhibitors2023

    • Author(s)
      Minoshima Masafumi、Umeno Taro、Kadooka Kohei、Roux Margaux、Yamada Namiko、Kikuchi Kazuya
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 62 Pages: e202301704

    • DOI

      10.1002/anie.202301704

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] JAK inhibition ameliorates bone destruction by simultaneously targeting mature osteoclasts and their precursors2023

    • Author(s)
      Yari Shinya、Kikuta Junichi、Shigyo Hotaka、Miyamoto Yu、Okuzaki Daisuke、Furusawa Yuki、Minoshima Masafumi、Kikuchi Kazuya、Ishii Masaru
    • Journal Title

      Inflammation and Regeneration

      Volume: 43 Pages: 18

    • DOI

      10.1186/s41232-023-00268-4

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Recent Advances in Activatable 19F Magnetic Resonance Imaging Nano‐Probes for the Detection of Biomarkers2022

    • Author(s)
      Salaam Jeremy、Minoshima Masafumi、Kikuchi Kazuya
    • Journal Title

      Analysis & Sensing

      Volume: 3 Pages: -

    • DOI

      10.1002/anse.202200081

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Hybrid, dual visible and near-infrared fluorescence emission of (6,5) single-walled carbon nanotubes modified with fluorescein through aryl diazonium salt chemistry2022

    • Author(s)
      Tomczyk Mateusz Michal、Minoshima Masafumi、Kikuchi Kazuya、Blacha-Grzechnik Agata、Starosolski Zbigniew、Bhavane Rohan、Zalewski Mariusz、Kuznik Nikodem
    • Journal Title

      Nanotechnology

      Volume: 34 Pages: 055703

    • DOI

      10.1088/1361-6528/ac9c6a

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Photoinitiator‐Free Two‐Photon Polymerization of Biocompatible Materials for 3D Micro/Nanofabrication2022

    • Author(s)
      Nakayama Atsushi、Kumamoto Yasuaki、Minoshima Masafumi、Kikuchi Kazuya、Taguchi Atsushi、Fujita Katsumasa
    • Journal Title

      Advanced Optical Materials

      Volume: 10 Pages: 2200474

    • DOI

      10.1002/adom.202200474

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Efficient visible/NIR light-driven uncaging of hydroxylated thiazole orange-based caged compounds in aqueous media2022

    • Author(s)
      Hashimoto Ryu、Minoshima Masafumi、Sakata Souhei、Ono Fumihito、Ishii Hirokazu、Watakabe Yuki、Nemoto Tomomi、Yanaka Saeko、Kato Koichi、Kikuchi Kazuya
    • Journal Title

      Chemical Science

      Volume: 13 Pages: 7462~7467

    • DOI

      10.1039/D2SC02364D

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] pH‐Sensitive Polymethacrylates as Potential Contrast Agents in 19F MRI2022

    • Author(s)
      Zalewski Mariusz、Janasik Dawid、Kapala Anna、Minoshima Masafumi、Sugihara Fuminori、Raj Wojciech、Pietrasik Joanna、Kikuchi Kazuya、Krawczyk Tomasz
    • Journal Title

      Macromolecular Chemistry and Physics

      Volume: 223 Pages: 2200027

    • DOI

      10.1002/macp.202200027

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of 19F Magnetic Resonance Imaging Probe for in vivo Sensing Biomarkers2022

    • Author(s)
      Masafumi Minoshima
    • Organizer
      ASBIC10
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] β-ラクタマーゼ阻害剤を用いた タンパク質ラベル化プローブの開発とオートファジー検出への応用2022

    • Author(s)
      蓑島維文、梅野太朗、門岡康平、菊地和也
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第16回年会
  • [Presentation] 入れ替わり可能な蛍光プローブを用いた タンパク質標識法の開発2022

    • Author(s)
      蓑島維文、Shahi Imam Reja, 粟津利邦、神原丈敏、飯嶋康平、岨稔康、岡田康志、菊地和也
    • Organizer
      第16回バイオ関連化学シンポジウム
  • [Presentation] 入れ替わり可能な蛍光標識法を利用した分子モーター解析2022

    • Author(s)
      蓑島維文
    • Organizer
      第11回分子モーター討論会
    • Invited
  • [Patent(Industrial Property Rights)] タンパク質を蛍光標識する方法2023

    • Inventor(s)
      蓑島維文,飯嶋航平,Shahi Imam Reja,菊地和也
    • Industrial Property Rights Holder
      蓑島維文,飯嶋航平,Shahi Imam Reja,菊地和也
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2023-34762

URL: 

Published: 2023-12-25  

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