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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Cryo-electron tomography of Birbeck granules

Publicly Offered Research

Project AreaNew cross-scale biology
Project/Area Number 22H05538
Research InstitutionUniversity of Yamanashi

Principal Investigator

小田 賢幸  山梨大学, 大学院総合研究部, 教授 (20569090)

Project Period (FY) 2022-06-16 – 2024-03-31
Keywordsクライオ電子顕微鏡 / 表皮 / 免疫
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、HEK293T細胞にランジェリンタンパク質を大量発現することでバーベック顆粒を細胞内で形成させた。クライオ電子トモグラフィー法を用いて、単離されたバーベック顆粒を観察し、ハチの巣状構造を取っているランジェリンの繰り返し単位の3D構造を6.4オングストロームの解像度で再構築した。この構造解析によりランジェリンホモ三量体間の相互作用は、残基258-263の可動性の高いループが二次糖鎖結合部位にドッキングすることによって媒介されることが明らかになった。258-263ループ内部に変異を導入すると、変異残基の数に応じてバーベック顆粒の形成阻害が観察された。さらにこれらの変異ランジェリンを発現する細胞にHIV偽ウイルス粒子を感染させる実験を行ったところ、258-263ループへの変異がウイルスの取り込みも阻害することがわかった。これらの結果は、バーベック顆粒が膜ジッパー構造を形成する分子機構を示唆しており、ランジェリンがウイルス感染に対する防御において果たす役割について新たな知見をもたらした。以上の研究から、バーベック顆粒の膜ジッパー構造の形成に関わる分子機構が明らかになり、ランゲルハンス細胞におけるウイルス感染防御に関与するランジェリンの働きについての理解が深まった。本研究はeLife誌に掲載された(https://elifesciences.org/articles/79990)。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

主たる目的を達成し、論文を発表した。進捗状況に問題は無い。

Strategy for Future Research Activity

現在メゾ複合体として、uroplakin complexとPMEL amyloid fibrilの2つの構造解析を行っている。
1.uroplakin complexを豚の膀胱から単離精製し、クライオ電子顕微鏡を用いて三次元構造解析を行っている。すでにアミノ酸側鎖が部分的に見える程度にまで解像度を向上させた。今後、論文発表に向けて実験結果をまとめていく。
2.PMELのCAFドメインを大腸菌で発現し、変性下で精製した。これをdilutionによりrenatureすることでamyloid fibrilを作らせることに成功した。すでにアミノ末端側30アミノ酸程度の部分配列からなるamyloid fibrilの高解像度解析に成功した。今後はカルボキシル末端側のamyloid formation条件をしらべ、完全なamyloid fibrilの生成を試みる。またpigment dispersion syndromeの原因変異を導入し、構造がどのように変化するか解析する。

  • Research Products

    (1 results)

All 2022

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results)

  • [Journal Article] Cryo-electron tomography of Birbeck granules reveals the molecular mechanism of langerin lattice formation2022

    • Author(s)
      Toshiyuki Oda, Haruaki Yanagisawa, Hideyuki Shinmori, Youichi Ogawa, Tatsuyoshi Kawamura
    • Journal Title

      elife

      Volume: 11 Pages: e79990

    • DOI

      10.7554/eLife.79990

    • Peer Reviewed / Open Access

URL: 

Published: 2023-12-25  

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