2013 Fiscal Year Annual Research Report

インターメア機能配列の情報量規準と機械学習による同定および進化的解析

Publicly Offered Research

Project Area	Functions of non-coding DNA region for genome integrity
Project/Area Number	24114501
Research Institution	Hokkaido University
Principal Investigator	遠藤俊徳北海道大学, 情報科学研究科, 教授 (00323692)
Project Period (FY)	2012-04-01 – 2014-03-31
Keywords	インターメア / 機能的配列 / 分子進化 / 機械学習
Research Abstract	ヒト～原索動物のゲノム配列から、既知の機能配列および繰り返し配列の抽出を行い、カタログ化したデータベースを構築した。繰り返し配列の一部は進化的にゲノム上を移動する事のあることが知られるが、それによって選択的スプライシングや、マイクロRNA配列導入が生じる可能性があることから、具体例の収集を行ってデータ解析を進めた。また、生物学的情報を元に機械学習を用いて分類解析する方法の開発を行った。未分類配列から機能配列のもつ特徴的パターンを抽出するためのアルゴリズム開発を行った。また、生物種間の比較に基づいて機能配列を見つけるため、進化的遺伝子分岐の解析方法の開発を行った。
Current Status of Research Progress	Reason 25年度が最終年度であるため、記入しない。
Strategy for Future Research Activity	25年度が最終年度であるため、記入しない。

(3 results)