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2014 Fiscal Year Annual Research Report

生体触媒の基質誤認識を利用する不活性炭化水素への酸素原子挿入反応触媒系の開発

Publicly Offered Research

Project AreaMolecule Activation Directed toward Straightforward Synthesis
Project/Area Number 25105724
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

荘司 長三  名古屋大学, 理学研究科, 准教授 (90379587)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
KeywordsシトクロムP450 / 生体触媒 / 炭化水素 / 酸化反応 / 疑似基質 / ベンゼン / エタン / 基質誤認識
Outline of Annual Research Achievements

P450BM3は,巨大菌由来の長鎖脂肪酸水酸化酵素で,炭素数が16前後の長鎖脂肪酸のアルキル鎖末端部分を水酸化する.P450BM3の酸化活性種生成反応では,長鎖脂肪酸の取り込みが反応を開始するトリガーになっていて,長鎖脂肪酸と構造が大きく異なる基質の場合には酸化反応は進行しない.長鎖脂肪酸の末端を含めたすべての水素原子がフッ素原子に置換されたパーフルオロアルキルカルボン酸を疑似基質(デコイ分子)として,P450BM3に取り込ませると,エタンやプロパンなどのガス状アルカンやベンゼンやトルエンなどの長鎖脂肪酸とは構造が大きく異なる基質を酸化できることを報告した.しかしながら,長鎖脂肪酸の水酸化活性と比較すると疑似基質を用いるガス状アルカンなどの水酸化活性は低く,P450BM3の高い触媒活性を十分に引き出すことはできていなかった.そこで,パーフルオロアルキルカルボン酸のカルボキシル基をアミノ酸で修飾した第二世代のデコイ分子を合成し,プロパンの酸化活性を調べた.パーフルオロアルキルカルボン酸のカルボキシル基をアミノ酸で修飾するだけで,活性が大幅に向上し,パーフルオロノナン酸をロイシンで修飾したPFC9-L-Leuをデコイ分子としてエタンの水酸化を試みたところ,毎分45回転でエタンを水酸化できることを明らかにした.さらに,PFC9-L-Trpを取り込んだP450BM3の結晶構造解析にも成功し,PFC9-L-Trpが長鎖脂肪酸と同様に基質結合部位に結合し,パーフルオロアルキル鎖は,活性部位には届いていないことなど,デコイ分子を利用する反応系の反応機構の解明に重要な情報を多く得ることができた.修飾するアミノ酸の側鎖構造の違いにより,酸化活性が大きく変化することから,デコイ分子の構造をさらに最適化することにより,長鎖脂肪酸と同等の酸化活性まで非天然基質の酸化活性を強化できると考えている.

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (16 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 7 results) Book (2 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Activation of Wild-type Cytochrome P450BM3 by the Next Generation of Decoy Molecules: Enhanced Hydroxylation of Gaseous Alkanes and Crystallographic Evidence2015

    • Author(s)
      Z. Cong, O. Shoji, C. Kasai, N. Kawakami, H. Sugimoto, Y. Shiro, Y. Watanabe
    • Journal Title

      ACS Catalysis

      Volume: 5 Pages: 150-156

    • DOI

      10.1021/cs501592f

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Bringing out the potential of wild-type cytochrome P450s using decoy molecules: Oxygenation of nonnative substrates by bacterial cytochrome P450s2015

    • Author(s)
      O. Shoji, Y. Watanabe
    • Journal Title

      Isr. J. Chem.

      Volume: 55 Pages: 32-39

    • DOI

      10.1002/ijch.201400096

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Highly efficient hydroxylation of gaseous alkanes at reduced temperature catalyzed by cytochrome P450BM3 assisted by decoy molecules2015

    • Author(s)
      N. Kawakami, Z. Cong, O. Shoji, Y. Watanabe
    • Journal Title

      J. Porphyrins Phthalocyanines

      Volume: 19 Pages: 329-334

    • DOI

      doi:10.1142/S1088424615500145

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Peroxygenase reactions catalyzed by cytochromes P4502014

    • Author(s)
      O. Shoji, Y. Watanabe
    • Journal Title

      J. Biol. Inorg. Chem.

      Volume: 19 Pages: 529-539

    • DOI

      10.1007/s00775-014-1106-9

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Use of Decoy Molecules as a Reaction Accelerator for the Hydroxylation of Gaseous Alkanes Catalyzed by Cytochrome P450s2015

    • Author(s)
      O. Shoji
    • Organizer
      日本化学会 第95春季年会 (2015)
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • Invited
  • [Presentation] 酸化酵素の誤作動を誘起する次世代疑似基質の開発とガス状アルカンの水酸化2015

    • Author(s)
      荘司長三
    • Organizer
      分子研研究会「生物無機化学の最先端と今後の展望:金属と生体分子の作用機序解明とモデル化および応用への展開」
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2015-01-06 – 2015-01-07
    • Invited
  • [Presentation] Hydroxylation of non-native substrates by wild-type cytochrome P450s assisted by decoy molecules2014

    • Author(s)
      O. Shoji, Y. Watanabe
    • Organizer
      the Active Enzyme Molecule 2014
    • Place of Presentation
      富山
    • Year and Date
      2014-12-17 – 2014-12-19
    • Invited
  • [Presentation] 疑似基質による野生型シトクロムP450の誤作動誘起と不活性炭化水素の水酸化反応2014

    • Author(s)
      荘司長三、渡辺芳人
    • Organizer
      第44回石油・石油化学討論会
    • Place of Presentation
      旭川
    • Year and Date
      2014-10-16 – 2014-10-18
    • Invited
  • [Presentation] Monooxygenation of Nonnative Substrates Catalyzed by Wild-type Cytochrome P450s2014

    • Author(s)
      O. Shoji, Y. Watanabe
    • Organizer
      The 12th International Symposium on Cytochrome P450 Biodiversity and Biotechnology
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2014-09-24 – 2014-09-28
    • Invited
  • [Presentation] 疑似基質による野生型酵素の誤作動誘起と不活性炭化水素の水酸化反応2014

    • Author(s)
      荘司長三
    • Organizer
      第10回触媒化学融合研究センター講演会
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      2014-07-04 – 2014-07-04
    • Invited
  • [Presentation] Gaseous Alkane Hydroxylation by Wild-Type Cytochrome P450BM3 bearing Decoy Molecules2014

    • Author(s)
      O. Shoji, J. Yokobori, T. Kunimatsu, N. Kawakami, Zhiqi Cong, Y. Watanabe
    • Organizer
      ICPP-8
    • Place of Presentation
      Istanbul, Turkey.
    • Year and Date
      2014-06-22 – 2014-06-27
    • Invited
  • [Book] Fifty Years of Cytochrome P450 Research, "Oxygenation of Nonnative Substrates Using a Malfunction State of Cytochrome P450s"2014

    • Author(s)
      O. Shoji, Y. Watanabe
    • Total Pages
      18
    • Publisher
      Springer
  • [Book] 生物工学会誌8月号「「頑固な酵素」を巧みに騙す」2014

    • Author(s)
      荘司長三、渡辺芳人
    • Total Pages
      4
    • Publisher
      公益社団法人 日本生物工学会
  • [Remarks] 名古屋大学 教員詳細

    • URL

      http://profs.provost.nagoya-u.ac.jp/view/html/100001080_ja.html

  • [Remarks] 名古屋大学 生物無機化学研究室

    • URL

      http://bioinorg.chem.nagoya-u.ac.jp/

  • [Remarks] ベンゼンをフェノールに一段階で変換するバイオ触媒の開発

    • URL

      http://www.aip.nagoya-u.ac.jp/public/nu_research_ja/highlights/detail/0000797.html

URL: 

Published: 2016-06-01  

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