KAKEN — Research Projects | Researcher Number: 30175492

Search Results: 17 results / Researcher Number: 30175492

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1. Experimental study on the progress and development of herding activity from ancient west Asia to China by protein archaeology.

Publicly Offered Research

Research Category	Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
Review Section	Transformative Research Areas, Section (I)
Research Institution	Nara Women's University
Principal Investigator	中沢隆奈良女子大学, その他部局等, 名誉教授
Project Period (FY)	2023-04-01 – 2025-03-31Granted
Keywords	中国文明 / タンパク質 / 質量分析 / 牧畜史 / コラーゲン
Outline of Research at the Start	タンパク質は、20 種類のアミノ酸が生物種に固有のDNA の遺伝暗号に基づいて配列した生体高分子である。申請者は、タンパク質、特にタンパク質として例外的に長寿命のコラーゲンについて、独自の化学的処理法と質量分析を組み合わせたアミノ酸配列解析を用いて考古学資料に残存する動物遺体の生物種を同定する。本研 ...
Project Area	A New Archaeology Initiative to Elucidate the Formation Process of Chinese Civilization

2. Protein archaeological study on exploring the possibility of natural hybridization between sheep and goat in the history of herding.

Research Project

Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Review Section	Basic Section 03050:Archaeology-related
Research Institution	Nara Women's University
Principal Investigator	中沢隆奈良女子大学, その他部局等, 名誉教授
Project Period (FY)	2022-04-01 – 2025-03-31Granted
Keywords	新石器時代 / タンパク質 / 質量分析 / 牧畜史 / 自然交配 / 動物骨 / 経年劣化 / 西アジア
Outline of Research at the Start	人類の食糧獲得手段が狩猟・採集から牧畜や農業に移行した時期と地域には諸説あるが、今から約１万年前の西アジアとされている。ヤギとヒツジの家畜化から本格的な牧畜までの過程は、ヤギとヒツジの個体数や分布状況の変化から辿るのが一般的であるが，本研究ではヤギとヒツジの交雑種の出現頻度に注目する。ヤギとヒツジの ...
Outline of Annual Research Achievements	我々は、ヤギとヒツジの家畜化から本格的な牧畜までの過程を、西アジアの遺跡で発掘された動物骨のコラーゲンの質量分析による確実な種の判定をもとに解明するための研究を行っている。ヤギとヒツジの骨を構成するI型コラーゲンは、全アミノ酸配列中でわずか4残基しかアミノ酸の違いがないが、我々は既にこれらのアミノ酸 ...
Current Status of Research Progress	2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Research Products of this project	Journal Article (2 results, of which Int'l Joint Research: 2 results, Peer Reviewed: 2 results, Open Access: 2 results) Presentation (2 results)

3. Protein archaeological study of Paleolithic animal bones

Publicly Offered Research

Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
Review Section	Humanities and Social Sciences
Research Institution	Nara Women's University
Principal Investigator	中沢隆奈良女子大学, その他部局等, 名誉教授
Project Period (FY)	2019-04-01 – 2021-03-31Completed
Keywords	新石器時代 / 動物骨 / コラーゲン / 質量分析 / タンパク質 / 動物考古学 / 牧畜史 / 西アジア / 考古学 / 質量分析学 / タンパク質科学 / 旧石器時代 / 分子古生物学 / アミノ酸配列解析
Outline of Research at the Start	タンパク質は、生物種に固有の遺伝暗号が規定するDNAの塩基配列に正確に対応して配列した20種類のアミノ酸からなる生体高分子である。タンパク質、特に考古学資料の動物骨や歯に含まれるI型コラーゲンはアミノ酸残基数が約1,000ずつの2種類のペプチド鎖からなるため、形態観察が不可能でDNAも残っていない資 ...
Outline of Annual Research Achievements	本研究の当初の目的は西アジアにおける動物の家畜化から牧畜までの歴史的発展を、動物遺骨から抽出したコラーゲンの質量分析による種判定をもとに行うことであった。そこで研究対象をヤギとヒツジに絞り、西アジアの遺跡で発掘された動物骨の種の判定をもとに解明することを試みた。ヤギとヒツジの骨を構成するI型コラーゲ ...
Project Area	Cultural history of PaleoAsia -Integrative research on the formative processes of modern human cultures in Asia

Research Products of this project	Journal Article (3 results, of which Int'l Joint Research: 2 results, Peer Reviewed: 3 results, Open Access: 1 results) Presentation (9 results, of which Int'l Joint Research: 2 results) Remarks (1 results)

4. Study on Palaeolithic Aminal Bones by Protein Archaeology

Publicly Offered Research

Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
Review Section	Humanities and Social Sciences
Research Institution	Nara Women's University
Principal Investigator	中沢隆奈良女子大学, 自然科学系, 教授
Project Period (FY)	2017-04-01 – 2019-03-31Completed
Keywords	タンパク質科学 / 質量分析学 / コラーゲン / 新石器時代 / 動物考古学 / アミノ酸配列解析 / 翻訳後修飾 / 動物種の同定 / 旧石器時代 / 先史時代 / タンパク質考古学 / 動物骨 / 西アジア / 古代文明 / 質量分析
Outline of Annual Research Achievements	本研究課題は、旧石器時代から新石器時代にかけての新・旧人類の交代劇や狩猟、牧畜、農耕といった人類の動物利用に関する文化史を解明する上で必要な、動物種の正確な判定によって本領域の研究に貢献することが求められている。旧石器時代の動物骨ではDNAが分解によって失われていることが多く、動物種の判定にはタンパ ...
Project Area	Cultural history of PaleoAsia -Integrative research on the formative processes of modern human cultures in Asia

Research Products of this project	Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results, of which Open Access: 4 results, Peer Reviewed: 2 results) Presentation (10 results, of which Int'l Joint Research: 4 results)

5. Archaeology of early domestic animals in the southern Caucasus: examinations of their phylogeny and pasture range

Research Project

Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Research Field	Archaeology
Research Institution	Nagoya University
Principal Investigator	Kadowaki Seiji 名古屋大学, 博物館, 講師
Project Period (FY)	2017-04-01 – 2020-03-31Completed
Keywords	考古学 / 先史学 / 家畜 / 古代DNA / タンパク質 / 西アジア / 安定同位体 / 新石器
Outline of Final Research Achievements	This study conducted phylogenetic analyses of early domestic animals in the southern Caucasus and examined early herders’ pasturing practices. The res ...

Research Products of this project	Int'l Joint Research (5 results) Journal Article (8 results, of which Int'l Joint Research: 3 results, Open Access: 3 results, Peer Reviewed: 5 results) Presentation (14 results, of which Int'l Joint Research: 9 results, Invited: 1 results) Book (3 results) Remarks (2 results)

6. Oversea's Research on Archaeological Proteins as Molecular Markers of Ancient Culture and Civilization

Research Project

Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Research Field	Biomolecular chemistry
Research Institution	Nara Women's University
Principal Investigator	Nakazawa Takashi 奈良女子大学, 自然科学系, 教授
Project Period (FY)	2016-04-01 – 2020-03-31Completed
Keywords	タンパク質 / コラーゲン / 質量分析 / アミノ酸配列解析 / 新石器時代 / 旧石器時代 / タンパク質の分解 / タンパク質科学 / 質量分析学 / 動物考古学 / 西アジア / 分子古生物学 / 考古学 / 構造生物科学 / 有機化学 / 翻訳後修飾 / 文化財科学 / タンパク質考古学 / 動物骨 / 環境分析化学 / 古代文明 / エジプト / 古代技術 / 環境化学分析
Outline of Final Research Achievements	The purpose of our project is to apply "protein archaeology" to proteins preserved in Paleolithic and Neolithic animal remains from archaeological sit ...

Research Products of this project	Int'l Joint Research (8 results) Journal Article (16 results, of which Peer Reviewed: 14 results, Open Access: 9 results) Presentation (22 results, of which Int'l Joint Research: 9 results, Invited: 1 results) Book (1 results) Remarks (3 results)

7. Research on the animal glue production in ancient East Asia

Research Project

Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Research Field	Archaeology
Research Institution	Nara Women's University
Principal Investigator	MIYAJI ATSUKO 奈良女子大学, 人文科学系, 教授
Project Period (FY)	2014-04-01 – 2018-03-31Completed
Keywords	動物考古学 / プロテオミクス / タンパク質考古学 / 動物資源 / 考古学 / 膠生産 / 膠流通 / 古代東アジア / 膠 / 文化財 / タンパク質 / 質量分析 / 東アジア / 墨
Outline of Final Research Achievements	In this study, we focused on fiber proteins (collagen) contained in glue used in cultural properties, and based on their accurate analysis using prote ...

Research Products of this project	Journal Article (8 results, of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (4 results, of which Int'l Joint Research: 1 results) Book (6 results) Remarks (1 results)

8. Development of N- and C-terminal sequencing method for proteins with posttranslational modification

Research Project

Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Research Field	Living organism molecular science
Research Institution	Nara Women's University
Principal Investigator	NAKAZAWA TAKASHI 奈良女子大学, 自然科学系, 教授
Project Period (FY)	2012-04-01 – 2015-03-31Completed
Keywords	タンパク質の翻訳後修飾 / プロテオミクス / 末端基の修飾 / ケミカルバイオロジー / 化学修飾 / 同位体交換 / 同位体標識 / 質量分析 / アミノ酸配列解析 / 末端プロテオミクス / タンパク質考古学 / アスパラギンの脱アミド化 / イソペプチド / タンパク質分解酵素 / 末端アミノ酸配列解析 / タンパク質の化学修飾 / 考古学 / タンパク質科学
Outline of Final Research Achievements	In order to identify mature proteins in which either N- or C-terminus is blocked, a new method for the modification of terminal free amino and carboxy ...

Research Products of this project	Journal Article (8 results, of which Peer Reviewed: 7 results, Open Access: 1 results) Presentation (15 results) Remarks (3 results)

9. Stable oxygen isotope of opal phytoliths: Basic information toward the paleoenvironmental reconstruction

Research Project

Research Category	Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
Research Field	Geography
Research Institution	Nara Women's University
Principal Investigator	TAKADA Masashi 奈良女子大学, 人文科学系, 教授
Project Period (FY)	2010 – 2012Completed
Keywords	プラントオパール / セルロース / 同位体比 / 古環境proxy / 質量分析
Research Abstract	In this study we present the preliminary results about the analysis of theδ18Ｏof phytoliths from living leaves of Japanese Sasa and Phyllostachys towa ...

Research Products of this project	Journal Article (12 results, of which Peer Reviewed: 10 results) Presentation (15 results)

10. Enhancing the practicability of the method for proteome analysis based on a new isolation scheme of C-terminal peptides.

Research Project

Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Research Field	Living organism molecular science
Research Institution	Nara Women's University
Principal Investigator	NAKAZAWA Takashi 奈良女子大学, 理学部, 教授
Project Period (FY)	2009 – 2011Completed
Keywords	タンパク質 / C末端ペプチド / プロテオミクス / アミノ酸配列解析 / 質量分析 / 化学修飾 / 安定同位体標識 / 強塩基性陰イオン交換体 / ペプチドの分離 / イオン交換クロマトグラフィー / 文化財科学
Research Abstract	We have established a method to identify proteins by MALDI mass spectrometry of the C-terminal peptide obtained from a protein in which all the carbox ...

Research Products of this project	Journal Article (17 results, of which Peer Reviewed: 17 results) Presentation (4 results) Remarks (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (3 results)

11. NMR and MM Analysis of Tautomerization of His64 Coupled to Ionization of Zinc-bound Solvent during Proton Transfer in Carbonic Anhydrase

Research Project

Research Category	Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Research Field	Biophysics
Research Institution	Japan Advanced Institute of Science and Technology
Principal Investigator	SHIMAHARA Hideto Japan Advanced Institute of Science and Technology
Project Period (FY)	2007 – 2008Completed
Keywords	タンパク質 / 酵素 / 機能 / ヒスチジン / 互変異性 / 触媒 / 反応機構 / プロトン移動 / NMR / QM / MM / 炭酸脱水酵素 / 触媒機構 / 構造機能相関
Research Abstract	NMR データを解析することにより「一般にHis残基の互変異性平衡は水素結合に支配される」との規則性を見出し,それによって同法により得られた「炭酸脱水酵素の機能に重要なHis残基の互変異性平衡定数は1.0である」との結果が示す水素結合の特異性を明らかとした. その結合様式を既知X線構造と比較し,かつ ...

Research Products of this project	Journal Article (13 results, of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (17 results) Remarks (5 results)

12. Development of the method for proteome analysis based on a novel chemical derivatization specific to C-termini of proteins

Research Project

Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Research Field	Living organism molecular science
Research Institution	Nara Women's University
Principal Investigator	NAKAZAWA Takashi Nara Women's University
Project Period (FY)	2006 – 2008Completed
Keywords	プロテオミクス / C末端アミノ酸配列解析 / 化学修飾 / MALDI-MS / 質量分析 / オキサゾロン / 翻訳後修飾 / Terminus proteomics / アミノ酸配列解析 / タンパク質 / ペプチド化学 / Terminal Proteomics / タンパク質のC末端 / C末端アミノ酸配列分析 / 活性エステル / C末端標識
Research Abstract	タンパク質のC末端アミノ酸配列解析法の開発のために、本研究ではペプチドの選択的C末端誘導体化の反応条件を最適化した結果、簡単なアミド化において収率を平均60%以上にすることに成功した。この誘導体化と新規N末端標識に基づくC末端ペプチド単離法を組み合わせることで、C末端が翻訳後修飾されたペプチドのマト ...

Research Products of this project	Journal Article (21 results, of which Peer Reviewed: 17 results) Presentation (11 results) Book (2 results) Remarks (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (7 results, of which Overseas: 2 results)

13. Development of Highly Sensitive, Accurate, and Quantitative Analytical System for Proteome

Research Project

Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
Research Field	Applied genomics
Research Institution	Osaka University
Principal Investigator	OKAMURA Taka-aki (2004-2006) Osaka University, Graduate School of Science, Associate Professor 乗岡茂巳 (2003) 大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 教授
Project Period (FY)	2003 – 2006Completed
Keywords	Proteome / Metal Complex / Protein / Mass Analysis / Amino Acid Sequencing / N-terminal Peptide / C-terminal Peptide / Labeling Reagent
Research Abstract	As a post-genome project, proteome analysis is one of the most important problems. Generally, proteome analyses identify precursor proteins on genes b ...

Research Products of this project	Journal Article (309 results) Book (6 results) Patent(Industrial Property Rights) (17 results)

14. Development of a method allowing high resolution X-ray crystallographic analysis of proteins by site-specific heavy-atom labeling

Research Project

Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Research Field	Structural biochemistry
Research Institution	Nara Women's University
Principal Investigator	NAKAZAWA Takashi Nara Women's University, Faculty of Science, Associate Professor
Project Period (FY)	1999 – 2001Completed
Keywords	Amio acids / heavy atom / tertiary structure of proteins / selenotryptophan / x-ray crystallography / multiwavelength anomalous dispersion (MAD) / energy minimization / Monte Carlo simulated annealing
Research Abstract	This research project includes synthesis of amino acids containing heavy atoms that allow high resolution X-ray crystallographic analysis of a protein ...

Research Products of this project	Publications (9 results)

15. 新最適化アルゴリズムによるタンパク質の折れたたみの研究

Research Project

Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
Research Institution	Okazaki National Research Institutes
Principal Investigator	岡本祐幸岡崎国立共同研究機構, 分子科学研究所, 助教授
Project Period (FY)	1996Completed
Keywords	タンパク質の主体構造 / 最適化 / モンテカルロ法 / 分子動力学法 / 徐冷法 / マルチカノニカル法 / 拡張アンサンブル法 / 核酸
Research Abstract	我々はこれまで、タンパク質の立体構造予測問題に、物理学の分野で開発された、徐冷モンテカルロ法やマルチカノニカル法適用することを提唱してきた。徐冷法ではモンテカルロ法とともに、分子動力学法でのシミュレーションが簡単に実現できるが、マルチカノニカル法の分子動力学法版は単純ではない。タンパク質の分野では、 ...

Research Products of this project	Publications (4 results)

16. 新最適化アルゴリズムによるタンパク質の折れたたみ機構の研究

Research Project

Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
Research Institution	Okazaki National Research Institutes
Principal Investigator	岡本祐幸岡崎国立共同研究機構, 分子科学研究所, 助教授
Project Period (FY)	1995Completed
Keywords	タンパク質の折れたたみ / 立体構造予測 / 徐冷モンテカルロ法 / マルチカノニカル法 / 最適化アルゴリズム
Research Abstract	蛋白質がその自然の特異的立体構造へいかに折れたたまれていくか、その機構を調べることは重要であるが、それは蛋白質分子の複雑さゆえにとても難しい問題である。特に、シミュレーションで理論的に研究するには、系にエネルギー極小状態が無数に存在するために、従来の手法では、全エネルギー空間をカバーすることは不可能 ...

Research Products of this project	Publications (2 results)

17. Tertiary structure prediction of peptides by Monte Carlo simulated annealing and its experimental verification

Research Project

Research Category	Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
Research Field	物質生物化学
Research Institution	NARA WOMEN'S UNIVERSITY
Principal Investigator	NAKAZAWA Takashi Nara Women's University, Faculty of Science, Assistant Professor
Project Period (FY)	1992 – 1993Completed
Keywords	Monte Carlo / Simulated anneling / Energy minimization / BPTI / Tertiary structure / Structural prediction / NMR / Protein folding
Research Abstract	A tertiary structure of the peptide fragment corresponding to residues 16-36 of bovine pancreatic trypsin inhibitor (BPTI) is predicted nsing Monte Ca ...

Research Products of this project	Publications (8 results)