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Biochemical analysis of transcription coupled nucleotide excision repair factors

Research Project

Project/Area Number 15K00541
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Risk sciences of radiation and chemicals
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

KARATA Kiyonobu  名古屋大学, 環境医学研究所, 研究機関研究員 (90345017)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 荻 朋男  名古屋大学, 環境医学研究所, 教授 (80508317)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2017: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2015: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Keywords塩基除去修復 / RNAポリメラーゼ / 転写共役型ヌクレオチド除去修復 / RNA polymerase II
Outline of Final Research Achievements

The detailed function of TC-NER-specific factors, CSA, CSB and UVSSA, remains to be defined. In order to elucidate their function biochemically, we tried to reconstitute in vitro TC-NER assay system using DNA templates harboring a site-directed DNA damage. In addition, we have developed the purification method of UVSSA protein for its X-ray crystal structure analysis.

Report

(4 results)
  • 2017 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2016 Research-status Report
  • 2015 Research-status Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2017 2016 2015

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (9 results)

  • [Journal Article] Specific glutamic acid residues in targeted proteins induce exaggerated retardations in Phos-tag SDS-PAGE migration2017

    • Author(s)
      E.Kinoshita, E. Kinoshita-Kikuta, K. Karata, T. Kawano, A. Nishiyama, M. Yamato, and T. Koike
    • Journal Title

      Electrophoresis

      Volume: 38 Issue: 8 Pages: 1139-1146

    • DOI

      10.1002/elps.201600520

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] DNA修復システムの異常により発症するヒト疾患の分子病態2016

    • Author(s)
      荻 朋男、岡 泰由、郭 朝万、賈 楠、唐田 清伸、中沢 由華
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] トランスオミクス解析を用いた希少遺伝性疾患原因因子の新規同定法の開発2016

    • Author(s)
      岡 泰由、郭 朝万、賈 楠、唐田 清伸、中沢 由華、荻 朋男
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] TC-NER因子UVSSAによるRNAポリメラーゼIIのユビキチン化に関する分子機能解析2016

    • Author(s)
      郭 朝万、中沢 由華、嶋田 繭子、唐田 清伸、賈 楠、岡 泰由、宮崎 仁美、千住 千佳子、荻 朋男
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] ゲノム不安定性を示す遺伝性疾患群の病態解析と新規疾患責任遺伝子変異探索2016

    • Author(s)
      中沢 由華、岡 泰由、郭 朝万、賈 楠、唐田 清伸、嶋田 繭子、宮崎 仁美、千住 千佳子、荻 朋男
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] コケイン症候群と紫外線高感受性症候群の分子病態解析2016

    • Author(s)
      賈 楠、中沢 由華、郭 朝万、唐田 清伸、岡 泰由、嶋田 繭子、宮崎 仁美、千住 千佳子、荻 朋男
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
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      2016 Research-status Report
  • [Presentation] ゲノム不安定性を示す遺伝性疾患の症例収集と病態解析研究2015

    • Author(s)
      荻 朋男、中沢 由華、唐田 清伸、郭 朝万、岡 泰由、賈 楠、嶋田 繭子、宮崎 仁美、千住 千佳子
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-03
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] ゲノム不安定性を示す難治性遺伝性疾患群の症例収集とゲノム・分子機能解析による病態解明研究2015

    • Author(s)
      中沢 由華、荻 朋男、唐田 清伸、郭 朝万、岡 泰由、賈 楠、嶋田 繭子、宮崎 仁美、千住 千佳子
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-02
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] 各種コケイン症候群の分子診断2015

    • Author(s)
      賈 楠、中沢 由華、荻 朋男、唐田 清伸、郭 朝万、岡 泰由、嶋田 繭子、宮崎 仁美、千住 千佳子
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-02
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] XRCC4 deficiency in human subjects causes a marked neurological phenotype but no overt immunodeficiency2015

    • Author(s)
      郭 朝万、中沢 由華、嶋田 繭子、賈 楠、唐田 清伸、岡 泰由、宮崎 仁美、千住 千佳子、荻 朋男
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-02
    • Related Report
      2015 Research-status Report

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Published: 2015-04-16   Modified: 2019-03-29  

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