• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Study on the encapsulation mechanism of guest proteins into bacterial nanocompartment

Research Project

Project/Area Number 16K07264
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Structural biochemistry
Research InstitutionTokyo University of Agriculture and Technology

Principal Investigator

Noguchi Keiichi  東京農工大学, 学術研究支援総合センター, 准教授 (00251588)

Research Collaborator YOHDA masafumi  
FUKUTANI yosuke  
HAKAMADA kazuaki  
FUJII motoko  
KANAMARU kosuke  
SAKURAI natsumi  
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywordsタンパク質シェル構造体 / ナノ構造体 / エンカプスリン / 結晶構造 / ターゲット配列 / 認識部位 / ウィルス様粒子 / X線回折 / 相互作用 / 認識配列 / 内包 / ナノ粒子 / 透過電子顕微鏡 / X線構造解析
Outline of Final Research Achievements

In order to provide insight into the encapsulation mechanism of guest proteins into the internal cavity of the bacterial nanocompartment, the crystal structure of encapsulin from Rhodococcus erythropolis N771 was determined at 3.3 A resolution by an X-ray diffraction method. The structure of estimated recognition site in Rhodococcus erythropolis N771 encapsulin subunit is quite similar to that of Thermotoga maritima. Since the mutations of Phe27, Lys28 and Arg34 in this site results in the significant reduction of encapsulation, it was suggested that these amino acids were interacted with the target sequence fused to the C-terminus of the guest protein.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究により60量体エンカプスリンの結晶構造としては2例目の構造を明らかにすることに成功し、外来タンパクの内包に関わる相互作用部位を推定することができた。この結果は、今後のエンカプスリンの研究にとって必須の構造情報であり、この成果をもとにマイクロリアクター、マイクロセンサー、ドラッグデリバリーキャリアーとしてのエンカプスリンの応用研究が加速されることが期待される。

Report

(4 results)
  • 2018 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2017 Research-status Report
  • 2016 Research-status Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2018 2017 2016

All Presentation (12 results)

  • [Presentation] Rhodococcus erythropolis N771株由来ナノ構造体Encapsulinへの外来タンパク質内包機構の解明2018

    • Author(s)
      金丸宏輔、藤井基子、田村彰朗、福谷洋介、野口恵一、尾高雅文、養王田正文
    • Organizer
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Rhodococcus erythropolis N771株由来エンカプスリンの結晶構造解析2018

    • Author(s)
      櫻井菜摘、金丸宏輔、藤井基子、田村彰朗、福谷洋介、野口恵一、松村洋寿、尾高雅文、養王田正文
    • Organizer
      日本結晶学会年会 平成30年度年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Rhodococcus erythropolis N771株由来Encapsulin(ReEncapsulin)のタンパク質内包機構の解明2018

    • Author(s)
      金丸宏輔、藤井基子、田村彰朗、福谷洋介、野口恵一、尾高雅文、養王田正文
    • Organizer
      第6回日本生物工学会東日本支部コロキウム
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] オキシステロール結合タンパク質OSBPとOSW-1の相互作用解析2017

    • Author(s)
      木村真優、山田里佳、福谷洋介、野口恵一、吉田秀郎、櫻井香里、養王田正文
    • Organizer
      ConBio2017:2017年度 生命化学系学会合同年次大会 (第40回 日本分子生物学会年会・第90回 日本生化学会大会)
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] Rhodococcus erythropolis N771株由来 Encapsulinナノ構造体への外来タンパク質の導入に必要なシグナル配列の探索2017

    • Author(s)
      金丸宏輔、藤井基子、田村彰朗、福谷洋介、野口恵一、尾高雅文、養王田正文
    • Organizer
      ConBio2017:2017年度 生命化学系学会合同年次大会 (第40回 日本分子生物学会年会・第90回 日本生化学会大会)
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 熱帯熱マラリア原虫Plasmodium falciparum由来PTEXの発現及び人工膜を利用した機能解析2016

    • Author(s)
      袴田一晃、渡辺寛和、川野竜司、野口恵一、養王田正文
    • Organizer
      第89回 日本生化学会大会in仙台
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2016-09-26
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] オキシステロール結合タンパク質(OSBP)の発現及びOSW-1との相互作用解析2016

    • Author(s)
      木村真優、山田里佳、福谷洋介、野口恵一、櫻井香里、養王田正文
    • Organizer
      第89回 日本生化学会大会in仙台
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2016-09-26
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] 機能性ナノ粒子構築のためのRhodococcus erythropolis N771株由来Encapsulinへの外来タンパク質の導入2016

    • Author(s)
      藤井基子、田村彰朗、福谷洋介、野口恵一、尾高雅文、養王田正文
    • Organizer
      89回 日本生化学会大会in仙台
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2016-09-26
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] 熱帯熱マラリア原虫 <I>Plasmodium falciparum</I> 由来PTEXの発現及び人工膜を利用した機能解析2016

    • Author(s)
      袴田一晃、渡辺寛和、川野竜司、野口恵一、養王田正文
    • Organizer
      平成28年度 日本生化学会関東支部例会
    • Place of Presentation
      自治医科大学医学部教育研究棟(栃木県)
    • Year and Date
      2016-06-11
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] オキシステロール結合蛋白質(OSBP)の発現及びOSW-1との相互作用解析2016

    • Author(s)
      木村真優、山田里佳、福谷洋介、野口恵一、櫻井香里、養王田正文
    • Organizer
      平成28年度 日本生化学会関東支部例会
    • Place of Presentation
      自治医科大学医学部教育研究棟(栃木県)
    • Year and Date
      2016-06-11
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] マラリア原虫Plasmodium falciprum由来Exp2の発現及び人工膜を利用した機能解析 (Expression and Functional Characterization of the Exp2 from Plasmodium falciprum using Current Analysis)2016

    • Author(s)
      袴田一晃、渡辺寛和、川野竜司、野口恵一、養王田正文
    • Organizer
      第16回日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2016-06-07
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] オキシステロール結合蛋白質(OSBP)の発現及びOSW-1との相互作用解析 (Expression of Oxysterol Binding Protein OSBP and interaction analysis with OSW-1)2016

    • Author(s)
      木村真優、山田里佳、福谷洋介、野口恵一、櫻井香里、養王田正文
    • Organizer
      第16回日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2016-06-07
    • Related Report
      2016 Research-status Report

URL: 

Published: 2016-04-21   Modified: 2020-03-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi