• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Detection of emerging virus from plasma using Next-Generation-Sequencing

Research Project

Project/Area Number 16K08057
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Veterinary medical science
Research InstitutionKagoshima University

Principal Investigator

MOMOI YASUYUKI  鹿児島大学, 農水産獣医学域獣医学系, 教授 (40303515)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 松鵜 彩  鹿児島大学, 農水産獣医学域獣医学系, 准教授 (40348595)
前田 健  山口大学, 共同獣医学部, 教授 (90284273)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2016: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywordsイヌ / ネコ / 新興感染症 / ウイルス / 次世代シーケンス / SFTS / レトロウイルス / 犬 / 獣医 / 感染症
Outline of Final Research Achievements

In this project, we applied Next-Generation-Sequencing to detect unrecognized viruses in dogs and cats. Circulating DNA/RNA was extracted from small volume of plasma samples from clinical cases with lymphoma, hepatitis and fever of unknown origin suspected infectious disease. We successfully detected feline immunodeficiency virus and sever fever with thrombocytopenia syndrome in clinical samples. Endogenous retrovirus and virus-like nucleotide sequence of host genome origin was detected in some cases possibly unrelated to pathological condition. Human endogenous retrovirus and feline morvillivirus was also detected . The method applied used in this project was useful to detect unknown pathogen from clinical samples in veterinary medicine.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

獣医療ではまだ認識されていない多くの感染症がある。未知の感染症を臨床現場で診断することは難しい。本研究では、次世代シーケンスを使い、臨床検体から予想していなかった病因菌を体系的に検出できることを実症例で示すことができた。今後、本技術を感染症疑い症例に対して利用することで新しい感染症を同定することが可能であり、簡易な診断法や新規治療法の開発につなげることができるだろう。また最近では重症熱性血小板減少症(SFTS)など重要な新興感染症が問題となっている。人と密接に接触する伴侶動物の感染症のいちはやく検出することは、人の健康を守るためにも重要であり、本研究の成果はその目的にも資する技術となる。

Report

(4 results)
  • 2018 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2017 Research-status Report
  • 2016 Research-status Report
  • Research Products

    (2 results)

All 2018

All Presentation (2 results)

  • [Presentation] Inonotus 属真菌による全身性深在性真菌症の犬の一例2018

    • Author(s)
      古澤 悠, 高橋 雅 ,上村利也 ,桃井康行 ,岩永朋子 ,矢吹 映 ,加納 塁, 遠藤泰之
    • Organizer
      第14回日本獣医内科学アカデミー
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 鹿児島県で発生した猫の重症熱性血小板減少症候群2018

    • Author(s)
      松鵜 彩, 吉田晴香 ,桃井康行, 内門純一, 川畑貴裕, 濱田亜以, 野口慧多, 森川 茂, 前田 健
    • Organizer
      第14回日本獣医内科学アカデミー
    • Related Report
      2017 Research-status Report

URL: 

Published: 2016-04-21   Modified: 2020-03-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi