Analysis melon reproductive barrier alleviation gene pia using a next generation sequencer

Research Project

Project/Area Number	16K21227
Research Category	Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Allocation Type	Multi-year Fund
Research Field	Horticultural science Science in genetics and breeding
Research Institution	Saga University
Principal Investigator	Matsumoto Yuichi 佐賀大学, 農学部, 講師 (80538265)
Project Period (FY)	2016-04-01 – 2019-03-31
Project Status	Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help	¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000) Fiscal Year 2017: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000) Fiscal Year 2016: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Keywords	メロン / 生殖隔離 / 園芸学 / 育種学
Outline of Final Research Achievements	467,632,885 leads were provided as a result of RAD-seq, and 173,886 locus were detected by analysis with Stacks, and 23,929 SNP was detected. A linkage map of full length 26,406cM that 1,473 SNP consisting of 12 linkage groups was constructed.
Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements	メロン育種において野生遺伝資源の利用の妨げとなる生殖隔離の克服に向け、生殖隔離緩和遺伝子piaの利用を可能とするための遺伝子座の位置について次世代シーケンサーを用いた調査を行った。その結果遺伝子の位置する染色体の領域について明らかとなり、今後の遺伝子の詳細なメカニズムの解明や実際の品種開発への利用について基礎となる情報が得られた。これらの結果をもとにした、生殖隔離の学術的解明のほかメロンを始めとする様々な品種開発への利用・貢献が期待できる。