Comprehensive analysis of non-AUG translation products induced by stress for the investigation of new biomarkers
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16KT0191
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 特設分野 |
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| Research Field |
Complex Systems Disease Theory
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
Ogawa Tetsuhiro 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 助教 (40323480)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
角田 茂 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (80345032)
小川 智子 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 生物機能利用研究部門, チーム長 (90466011)
藤井 渉 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 助教 (40708161)
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| Project Period (FY) |
2016-07-19 – 2020-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2019)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2017: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2016: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
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| Keywords | バイオマーカー / ストレス / 非AUGコドン / タンパク質合成 / ストレス応答 / 非開始コドン / tRNA / 翻訳産物 |
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| Outline of Final Research Achievements |
To investigate new biomarkers for detection of early stage of diseases, we focused on proteins whose translation is initiated at non-AUG codons. It is known that part of non-AUG translation is induced by stress, which requires a specific translation initiation factor. In this study, we screened protein variants, which share the same C-terminal region with their canonical products and the N-terminal region is extended or truncated. Ribosome profiling analysis suggested protein variants, expressed by heat stress and the specific translation initiation factor, as a candidate of the new biomarker.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
これまでに、様々なバイオマーカーが開発されてきたが、疾患の早期発見を可能とするものは限定的であった。このことから、これまでとは一線を画する、新たな視点に基づいたバイオマーカー探索が求められていた。本研究で注目した非AUGコドンからの翻訳産物は、これまでは例外、あるいは実験上のアーティファクトとして見過ごされてきた。今回、これら非AUGコドンからの翻訳産物の中に、ストレスの指標となり得る因子を見出すことに成功した。また、本研究を通して、有用なバイオマーカー取得の方法論を提案することが出来た。
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Report
(5 results)
Research Products
(3 results)
