| Project/Area Number |
17K11618
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Research Field |
Morphological basic dentistry
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| Research Institution | Kagoshima University |
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Principal Investigator |
Oogai Yuichi 鹿児島大学, 医歯学域歯学系, 助教 (40511259)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
松尾 美樹 鹿児島大学, 医歯学域歯学系, 准教授 (20527048)
小松澤 均 鹿児島大学, 医歯学域歯学系, 教授 (90253088)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2019)
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| Budget Amount *help |
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | 歯周病原因菌 / 生理活性ペプチド / ペプチド / small ORF / small RNA / A. actinomycetemcomitans |
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| Outline of Final Research Achievements |
Aggregatibacter actinomycetemcomitans (Aa) is a periodontal pathogen. To identify new small ORF and small RNA in Aa, we performed a systematic search using RNAseq and identified 18 sORF and 120 sRNA. None of the sORFs exhibited the homology with known bioactive-peptides. The cytotoxicity and antimicrobial activity of the fractions extracted from supernatants of Aa strains containing clinically isolates were not detected. The target prediction of sRNAs showed the potential to regulate several virulence genes containing leukotoxin and cytolethal distending toxin.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
過去に行われたsORF解析の多くはバイオインフォマティクス手法によるものである。本研究はsORFの同定を次世代シークエンサーを用いたRNA-seq解析によって行うことにおいて学術的な意義をも有する。また、Aaにおいて、sRNAの同定は一部なされているが、多くの菌株においては不明である。遺伝子発現制御を担う因子として注目されているsRNAの解析は、Aaの病原性への理解においても有意義な情報となると考えられる。
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