• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Creation of fluorescent unnatural aminophospholipid synthases

Research Project

Project/Area Number 17K19338
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Molecular and Genome biology and related fields
Research InstitutionYamagata University

Principal Investigator

Yasushi Tamura  山形大学, 理学部, 准教授 (50631876)

Project Period (FY) 2017-06-30 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2017: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Keywordsリン脂質 / オルガネラ / リン脂質輸送 / 人工酵素 / 出芽酵母
Outline of Final Research Achievements

In this study, we aimed to obtain phosphatidylserine (PS) synthase PssA mutants, which recognize NBD-serine (fluorescence-labeled serine) instead of serine. So far, we created experimental systems in which PssA is expressed in an IPTG-dependent manner in Escherichia coli cells and expressed on various organelle membranes in yeast cells. Interestingly, when PssA is expressed in the ER, lipid droplet, peroxisome or mitochondrial inner membrane, growth defects of cho1-deleted cells were rescued. These results are important for investigating intracellular phospholipid transport pathways. We are now using these yeast cells for genetic screening.
In addition to the genetic method, we tool an advantage of structural analysis. If we were able to determine the recognition site of PssA for the subtrate serine, we could obtain mutants that recognize NBD-serine by introducing mutations to the sites.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

大腸菌のPS合成酵素を真核生物に移植することで,本来不可能であった,真核生物内のPS合成の細胞内局在場所を変化させることが出来るようになった。これにより,PSが小胞体で合成される必然性が初めて検証できるようになった。また様々な細胞内区画で合成されたPSの運命(PS→ホスファチジルエタノールアミンへのミトコンドリア内での変換)をモニターすることで,細胞内の脂質の流れをモニターする実験系の構築に成功した。この実験系により,細胞内の異なるおるがねら膜間をかなり効率的に脂質が移動する様子を様々なおるがねら間で調べることが出来るようになった。

Report

(3 results)
  • 2018 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2017 Research-status Report
  • Research Products

    (43 results)

All 2019 2018 2017 Other

All Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 7 results) Presentation (29 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 11 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Maintenance of Cardiolipin and Crista Structure Requires Cooperative Functions of Mitochondrial Dynamics and Phospholipid Transport2019

    • Author(s)
      Kojima Rieko、Kakimoto Yuriko、Furuta Shiina、Itoh Kie、Sesaki Hiromi、Endo Toshiya、Tamura Yasushi
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 26 Issue: 3 Pages: 1372-1372

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2018.12.070

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Myristoyl group-aided protein import into the mitochondrial intermembrane space2019

    • Author(s)
      Ueda Eri、Tamura Yasushi、Sakaue Haruka、Kawano Shin、Kakuta Chika、Matsumoto Shunsuke、Endo Toshiya
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Issue: 1 Pages: 1185-1185

    • DOI

      10.1038/s41598-018-38016-1

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] CdsA is involved in biosynthesis of glycolipid MPIase essential for membrane protein integration in vivo2019

    • Author(s)
      Sawasato Katsuhiro、Sato Ryo、Nishikawa Hanako、Iimura Naoki、Kamemoto Yuki、Fujikawa Kohki、Yamaguchi Toshiyuki、Kuruma Yutetsu、Tamura Yasushi、Endo Toshiya、Ueda Takuya、Shimamoto Keiko、Nishiyama Ken-ichi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Issue: 1 Pages: 1372-1372

    • DOI

      10.1038/s41598-018-37809-8

    • NAID

      120007176808

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Porin Associates with Tom22 to Regulate the Mitochondrial Protein Gate Assembly2019

    • Author(s)
      Sakaue Haruka、Shiota Takuya、Ishizaka Naoya、Kawano Shin、Tamura Yasushi、Tan Kher Shing、Imai Kenichiro、Motono Chie、Hirokawa Takatsugu、Taki Kentaro、Miyata Non、Kuge Osamu、Lithgow Trevor、Endo Toshiya
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 73 Issue: 5 Pages: 1044-1055

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2019.01.003

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Advanced In Vitro Assay System to Measure Phosphatidylserine and Phosphatidylethanolamine Transport at ER/Mitochondria Interface2019

    • Author(s)
      Tamura Yasushi、Kojima Rieko、Endo Toshiya
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 1949 Pages: 57-67

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-9136-5_6

    • ISBN
      9781493991358, 9781493991365
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 特集 細胞高次機能をつかさどるオルガネラコミュニケーション Ⅲ.ミトコンドリア ミトコンドリアと小胞体間のオルガネラコンタクト2018

    • Author(s)
      田村 康、河野 慎、遠藤 斗志也
    • Journal Title

      生体の科学

      Volume: 69 Issue: 6 Pages: 577-580

    • DOI

      10.11477/mf.2425200926

    • ISSN
      0370-9531, 1883-5503
    • Year and Date
      2018-12-15
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Journal Article] Discovery and Optimization of Inhibitors of the Parkinson’s Disease Associated Protein DJ-12018

    • Author(s)
      Tashiro Shinya、Caaveiro Jose M. M.、Nakakido Makoto、Tanabe Aki、Nagatoishi Satoru、Tamura Yasushi、Matsuda Noriyuki、Liu Dali、Hoang Quyen Q.、Tsumoto Kouhei
    • Journal Title

      ACS Chemical Biology

      Volume: 13 Issue: 9 Pages: 2783-2793

    • DOI

      10.1021/acschembio.8b00701

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Organelle contact zones as sites for lipid transfer2018

    • Author(s)
      Tamura Yasushi、Kawano Shin、Endo Toshiya
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 165 Issue: 2 Pages: 115-123

    • DOI

      10.1093/jb/mvy088

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Visualizing multiple inter-organelle contact sites using the organelle-targeted split-GFP system2018

    • Author(s)
      Kakimoto Yuriko、Tashiro Shinya、Kojima Rieko、Morozumi Yuki、Endo Toshiya、Tamura Yasushi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 8 Issue: 1 Pages: 6175-6175

    • DOI

      10.1038/s41598-018-24466-0

    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Shuttle mission in the mitochondrial intermembrane space2018

    • Author(s)
      Endo Toshiya、Tamura Yasushi
    • Journal Title

      The EMBO Journal

      Volume: 37 Issue: 4

    • DOI

      10.15252/embj.201898993

    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Open Access
  • [Journal Article] Structure?function insights into direct lipid transfer between membranes by Mmm1?Mdm12 of ERMES2017

    • Author(s)
      Kawano Shin、Tamura Yasushi、Kojima Rieko、Bala Siqin、Asai Eri、Michel Agn?s H.、Kornmann Beno?t、Riezman Isabelle、Riezman Howard、Sakae Yoshitake、Okamoto Yuko、Endo Toshiya
    • Journal Title

      The Journal of Cell Biology

      Volume: 217 Issue: 3 Pages: 959-974

    • DOI

      10.1083/jcb.201704119

    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Role of intra- and inter-mitochondrial membrane contact sites in yeast phospholipid biogenesis2017

    • Author(s)
      Tamura Y. and Endo T.
    • Journal Title

      Advances in Experimental Medicine and Biology

      Volume: 997 Pages: 121-133

    • DOI

      10.1007/978-981-10-4567-7_9

    • ISBN
      9789811045660, 9789811045677
    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 脂質輸送におけるオルガネラ間コンタクトサイトの役割2019

    • Author(s)
      田村 康
    • Organizer
      第21回植物オルガネラワークショップ
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Visualizing multiple inter-organelle contact sites using the organelle-targeted split-GFP probes2018

    • Author(s)
      Yasushi Tamura
    • Organizer
      1st International Mitochondrial Meeting for Young Scientists
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ミトコンドリア・小胞体コンタクトサイトの数を制御するメカニズム2018

    • Author(s)
      田村 康
    • Organizer
      生理学研究所研究会 オルガネラ膜ナノドメインの機能と動態
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Split-GFPを用いた オルガネラコンタクトサイトの可視化と解析2018

    • Author(s)
      田村 康
    • Organizer
      第27回 日本バイオイメージング学会学術集会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ミトコンドリア・小胞体コンタクトサイトの数を制御するメカニズム2018

    • Author(s)
      田村 康
    • Organizer
      第91回日本生化学会大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Maintenance of Cardiolipin and Crista Structure Requires Cooperative Functions of Mitochondrial Dynamics and Phospholipid Transport2018

    • Author(s)
      Yasushi Tamura
    • Organizer
      Osakamito2018
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ミトコンドリア・小胞体間コンタクトサイトの数を制御するメカニズム2018

    • Author(s)
      田村 康
    • Organizer
      第18回日本ミトコンドリア学会年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Visualizing multiple inter-organelle contact sites using split-GFP system2018

    • Author(s)
      Yuriko Kakimoto, Shinya Tashiro, Rieko Kojima, Toshiya Endo, Yasushi Tamura
    • Organizer
      2018 Cell and Developmental Biology Meeting(細胞生物学会)
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] ミトコンドリア型CDP-DAG合成酵素Tam41の結晶化2018

    • Author(s)
      木村啓介, 小島理恵子, 遠藤斗志也, 田村康
    • Organizer
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] 遺伝学的スクリーニングに向けた哺乳類細胞内ミトコンドリア-ER膜間コンタクト検出系の構築2018

    • Author(s)
      田代 晋也, 遠藤 斗志也, 田村 康
    • Organizer
      第91回日本生化学会大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] ミトコンドリア型CDP-DAG合成酵素Tam41の結晶化2018

    • Author(s)
      木村 啓介, 小島 理恵子, 遠藤 斗志也, 田村 康
    • Organizer
      第91回日本生化学会大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Split-GFPを用いた新規オルガネラ間近接評価実験系の確立2018

    • Author(s)
      柿元 百合子, 田代 晋也, 小島 理恵子, 遠藤 斗志也, 田村 康
    • Organizer
      第91回日本生化学会大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] ミトコンドリアポリンタンパク質Por1による外膜透過装置TOM複合体のアセンブリー制御2018

    • Author(s)
      阪上 春花, 塩田 拓也, 石坂 直也, 田村 康, 遠藤 斗志也
    • Organizer
      第91回日本生化学会大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] リン脂質代謝におけるPah1の機能解析2018

    • Author(s)
      工藤 真之祐, 古田 詩唯奈, 遠藤 斗志也, 田村 康
    • Organizer
      第91回日本生化学会大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Split-GFPを用いたNVJ連携ゾーンの機能の解析2018

    • Author(s)
      新名 真夏, 柿元 百合子, 遠藤 斗志也, 田村 康
    • Organizer
      第91回日本生化学会大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] 新規オルガネラ間結合因子の同定と生理機能の解析2018

    • Author(s)
      柿元 百合子,小島 理恵子, 新名 真夏,遠藤 斗志也, 田村 康
    • Organizer
      第13回小胞体ストレス研究会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Two AAA-ATPases-mediated degradation pathways of mislocalized tail-anchored proteins on the outer mitochondrial membrane2018

    • Author(s)
      Shunsuke Matsumoto1, Chika Kakuta1, Kunio Nakatsukasa2, Yasushi Tamura3, Masatoshi Esaki, Toshiya Endo
    • Organizer
      分子生物学会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Visualizing multiple inter-organelle contact sites using the organelle-targeted split-GFP probes2018

    • Author(s)
      Yasushi Tamura
    • Organizer
      1st International Mitochondria Meeting for Young Scientists
    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 大阪大学蛋白質研究所セミナー・再構成アプローチが開拓する生体膜・ 膜タンパク質研究の最前線2018

    • Author(s)
      田村 康
    • Organizer
      オルガネラ間リン脂質輸送反応の 再構成実験系
    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 出芽酵母における ミトコンドリア・小胞体連携ゾーンの役割2017

    • Author(s)
      田村 康
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会 ConBio2017
    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Structural and Mechanistic Insights into Phospholipid Transfer via Mitochondria2017

    • Author(s)
      Yasushi Tamura
    • Organizer
      Smasys 2017 (5th International Conference on Smart Systems Engineering 2017)
    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Split GFP を用いたオルガネラ膜間近接評価実験系の確立2017

    • Author(s)
      柿元百合子,遠藤斗志也,田村康
    • Organizer
      第69回日本細胞生物学会
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] ミトコンドリア外膜へのミスターゲットした膜タンパク質の分解機構の解析2017

    • Author(s)
      松本俊介,中務邦雄,田村康,江崎雅俊,遠藤斗志也
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会 ConBio2017
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] カルジオリピン量の維持には正常なクリステ構造が必要である2017

    • Author(s)
      小島理恵子,伊藤喜重,瀬崎博美,遠藤斗志也,田村康
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会 ConBio2017
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 小胞体膜タンパク質Ilm1の欠損はリン脂質輸送とスフィンゴ脂質異常を引き起こす2017

    • Author(s)
      古田詩唯奈,小島理恵子,遠藤斗志也,田村康
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会 ConBio2017
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 基本転写因子TFIIEの構造生物学的研究2017

    • Author(s)
      帯田孝之,三輪康平,小島理恵子,大熊芳明,田村康,水口峰之
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会 ConBio2017
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] ミトコンドリアポリンタンパク質Por1は外膜透過装置TOM複合体のアセンブリー調節因子として機能する2017

    • Author(s)
      阪上春香,石坂直也,塩田拓也,田村康,遠藤斗志也
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会 ConBio2017
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] Split-GFPを用いたオルガネラ膜間テザリング因子の探索2017

    • Author(s)
      柿本百合子,遠藤斗志也,田村康
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会 ConBio2017
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] タンパク質膜挿入反応に関与する糖脂質酵素MPIaseは生育に必須である2017

    • Author(s)
      沢里 克宏,佐藤 諒,西川 華子,飯村 直樹,藤川 鉱樹,山口 敏幸,車 ゆうてつ,田村 康,遠藤 斗志也,上田 卓也,島本 啓子,西山 賢一
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会 ConBio2017
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Book] トコンドリアと小胞体のクロストーク,月刊「細胞」2018年 7月号 オルガネラのバイオロジー 最前線 The leading edge of organelle biology2018

    • Author(s)
      田村康,河野慎,遠藤斗志也
    • Total Pages
      4
    • Publisher
      北隆館
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      https://www.tamuralab.com/

    • Related Report
      2017 Research-status Report

URL: 

Published: 2017-07-21   Modified: 2023-03-20  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi