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オントロジーと機械学習及びコホート調査情報を用いたフレーム問題へ取り込み

Research Project

Project/Area Number 18K11420
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 61030:Intelligent informatics-related
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

高井 貴子 (五十嵐貴子)  東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 非常勤講師 (60222840)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Project Status Discontinued (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2021: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2020: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2019: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2018: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Keywordsオントロジー / ゲノム医療 / 臨床情報の研究利用 / ゲノム疾患研究領域 / フレーム表現 / 機械学習 / コホート調査情報 / フレーム問題
Outline of Annual Research Achievements

生物医学の領域においては、open-worldベースのオントロジーがあり頻用されている。生物医学は概念を要素とする学問であり、オントロジーは要素間の距離を定義し計算可能性を与えることで、本領域の研究進展に欠かせない貢献をなしてきた。しかしながら、オントロジーをベースとした知識獲得やその利用といった、オントロジーを現実社会のモデルとして利用するためには、オントロジーから意味のあるインスタンスできなければならない。open-worldベースのアプローチのみでは限界があると思われた。
本研究では、open-worldベースのオントロジーと、closed-worldにおけるドメイン特異的な知識を表現するフレーム理論との融合により、この問題解決を提案した。フレーム理論は1975年に提案された知識表現の手法であるが、現実世界を表現するには爆発歴なフレームが必要となり、それをどのような指標でコントロールするかという問題は解決されていない。本研究では、統計量をその指標とする案を提案した。対象世界において、頻繁に登場するパタンをフレーム選択の指標として利用する案であり、フレーム選択の機械化も念頭においたものとなっている。
その後、研究代表者の環境変化があり、本研究の継続が困難となった。研究対象データへのアクセスが困難になったこと、研究に利用できる時間の確保が困難になったことが背景であるが、これらを自らの力で克服できなかったことは研究代表者の力不足である。
近年、GoogleはWEB空間の知識を有用にコントロールするために知識グラフを利用し、検索、推論、判断支援、機械応答の技術向上を実現した。知識グラフは、open-worldベースのオントロジーにclosed-worldにおけるドメイン特異的な知識を与え得る性質を持っている。知識グラフ研究は、インスタンス生成問題も解決し得ると思われる。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • 2018 Research-status Report
  • Research Products

    (20 results)

All 2021 2020 2019 2018

All Journal Article (13 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 13 results,  Open Access: 11 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 7 results)

  • [Journal Article] Study Profile of the Tohoku Medical Megabank Community-Based Cohort Study2021

    • Author(s)
      Hozawa A, Tanno K, Nakaya N, Nakamura T, Tsuchiya N, Hirata T, Narita A, Kogure M, Nochioka K, Sasaki R, Takanashi N, Otsuka K, Sakata K, Kuriyama S, Kikuya M, 13名略, Kobayashi T, 53名略, Yamamoto M.
    • Journal Title

      Journal of Epidemiology

      Volume: 31 Issue: 1 Pages: 65-76

    • DOI

      10.2188/jea.JE20190271

    • NAID

      130007966030

    • ISSN
      0917-5040, 1349-9092
    • Year and Date
      2021-01-05
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Cohort Profile: Tohoku Medical Megabank Project Birth and Three-Generation Cohort Study (TMM BirThree Cohort Study): rationale, progress and perspective.2020

    • Author(s)
      Kuriyama S, Metoki H, Kikuya M, Obara T, Ishikuro M, Yamanaka C, Nagai M, Matsubara H, Kobayashi T, 57名略, Yamamoto M.
    • Journal Title

      Int J Epidemiol.

      Volume: 49(1) Issue: 1 Pages: 18-19

    • DOI

      10.1093/ije/dyz169

    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification of a novel uterine leiomyoma GWAS locus in a Japanese population2020

    • Author(s)
      Sakai Kensuke、Tanikawa Chizu、Hirasawa Akira、Terao Chikashi、Kamatani Yoichiro、Takahashi Atsushi、Momozawa Yukihide、Hirata Makoto、Kubo Michiaki、Matsuda Koichi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Issue: 1 Pages: 1024-1024

    • DOI

      10.1038/s41598-020-58066-8

    • NAID

      120006872359

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Design and Progress of Oral Health Examinations in the Tohoku Medical Megabank Project2020

    • Author(s)
      Tsuboi, A., et al., Koshiba, S., et al., Yamamoto, M.(合計33名、本研究者は20番目)
    • Journal Title

      The Tohoku Journal of Experimental Medicine

      Volume: 251 Issue: 2 Pages: 97-115

    • DOI

      10.1620/tjem.251.97

    • NAID

      130007858973

    • ISSN
      0040-8727, 1349-3329
    • URL

      https://pure.teikyo.jp/en/publications/62d8f028-92aa-4584-9ae4-a57a88ed1675

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    • Author(s)
      Sakurai-Yageta M, Kawame H, Kuriyama S, Hozawa A, Nakaya N, Nagami F, Minegishi N, Ogishima S, Takai-Igarashi T, Danjoh I, Obara T, Ishikuro M, Kobayashi T, Aizawa Y, Ishihara R, Yamamoto M, Suzuki Y.
    • Journal Title

      BMC Med Educ.

      Volume: 19(1) Issue: 1 Pages: 297-297

    • DOI

      10.1186/s12909-019-1725-5

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  • [Journal Article] Construction of JRG (Japanese reference genome) with single-molecule real-time sequencing2019

    • Author(s)
      Nagasaki Masao、(中略)、Yasuda Jun(24人中23番目)、Yamamoto Masayuki
    • Journal Title

      Human Genome Variation

      Volume: 6 Issue: 1 Pages: 1-18

    • DOI

      10.1038/s41439-019-0057-7

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    • Author(s)
      Sakurai Rieko、Ueki Masao、Makino Satoshi、Hozawa Atsushi、Kuriyama Shinichi、Takai-Igarashi Takako、Kinoshita Kengo、Yamamoto Masayuki、Tamiya Gen
    • Journal Title

      International Journal of Epidemiology

      Volume: 印刷中 Issue: 4 Pages: 1305-1315

    • DOI

      10.1093/ije/dyz012

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  • [Journal Article] Respiratory resistance among adults in a population-based cohort study in Northern Japan.2019

    • Author(s)
      Miura E, Tsuchiya N, Igarashi Y, Arakawa R, Nikkuni E, Tamai T, Tabata M, Ohkouchi S, Irokawa T, Ogawa H, Takai-Igarashi T, Suzuki Y, Kuriyama S, Tamiya G, Hozawa A, Yamamoto M, Kurosawa H.
    • Journal Title

      Respiratory Investigation

      Volume: 印刷中 Issue: 3 Pages: 30226-0

    • DOI

      10.1016/j.resinv.2018.12.008

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  • [Journal Article] Maternity Log study: A longitudinal lifelog monitoring and multiomics analysis for the early prediction of complicated pregnancy2019

    • Author(s)
      Sugawara J, Ochi D, Yamashita R, Yamauchi T, Saigusa D, Wagata M, Obara T, Ishikuro M, Tsunemoto Y, 18名略, Hiyama S, Nagasaki M
    • Journal Title

      BMJ Open

      Volume: 9 Issue: 2 Pages: e025939-e025939

    • DOI

      10.1136/bmjopen-2018-025939

    • URL

      https://pure.teikyo.jp/en/publications/79935434-8a0b-434d-bf7d-bbfec0e2bdb6

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    • Author(s)
      Yasuda Jun、Kinoshita Kengo、et al.,
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 165 Issue: 2 Pages: 139-158

    • DOI

      10.1093/jb/mvy096

    • NAID

      40021809939

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  • [Journal Article] Genome-wide association study identifies gastric cancer susceptibility loci at 12q24.11-12 and 20q11.212018

    • Author(s)
      Tanikawa C, Kamatani Y, Toyoshima O, Sakamoto H, Ito H, Takahashi A, et al.
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 109 Issue: 12 Pages: 4015-4024

    • DOI

      10.1111/cas.13815

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    • Author(s)
      Koshiba, S., (途中略), Yamamoto, M.(合計21名、本研究者は1番目)
    • Journal Title

      Genes Cells

      Volume: 23 Issue: 6 Pages: 406

    • DOI

      10.1111/gtc.12588

    • URL

      https://localhost/en/publications/6383ce37-5ea4-4f7e-8493-1d86eac8314c

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      X Yuan, K Tsujimoto, K Hashimoto, K Kawahori, N Hanzawa, M Hamaguchi, T Seki, M Nawa, T Ehara, Y Kitamura, I Hatada, M Konishi, N Itoh, Y Nakagawa, H Shimano, T Takai-Igarashi, Y Kamei, Y Ogawa.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 9 Issue: 1 Pages: 636-636

    • DOI

      10.1038/s41467-018-03038-w

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URL: 

Published: 2018-04-23   Modified: 2022-12-28  

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