| Project/Area Number |
18K14253
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 34020:Analytical chemistry-related
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| Research Institution | Tokyo Metropolitan University |
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Principal Investigator |
Yamaki Yuka 首都大学東京, 理学研究科, 客員研究員 (80781525)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2020-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2019)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2018: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
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| Keywords | 質量分析 / RNA / 転写後修飾 / シュードウリジン / LC-MS |
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| Outline of Final Research Achievements |
U2 snRNA and U3 snoRNA were purified from RNA biosynthesized with uridine-5,6-d2 in the human TK6 cells deficient in mono phosphate synthase. U2 snRNA and U3 snoRNA were analyzed by LC-MS after digestion with RNase. Spectrum were searched in the database Ariadne, and novel pseudouridylation sites were revealed.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
シュードウリジン化酵素によりウリジンがシュードウリジン化修飾を受けても、化学的性質に変化は見られず質量に差が生じないことから、質量分析計で両者を判別することは困難であった。しかし、ΔUMPS株とラベルウリジンを用いることで、シュードウリジン化修飾により生じる質量差を利用することで、シュードウリジン化サイトを明らかにすることが可能になった。
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