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Comparative genomics of rhizobia nodulating beach pea ecotypes between heterogeneous environments

Research Project

Project/Area Number 18K14784
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 45030:Biodiversity and systematics-related
Research InstitutionLake Biwa Museum

Principal Investigator

Ohtsuki Tatsuo  滋賀県立琵琶湖博物館, 研究部, 主任学芸員 (60760189)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2020: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsゲノム進化 / 地域適応 / 共生 / 根粒菌 / マメ科植物
Outline of Final Research Achievements

Soil bacteria called rhizobia infect leguminous plants to form root nodules for bacterial nitrogen fixation. Formation nodule require the specific recognition of host and rhizobium. This symbiosis has been widely studied as the model of mutualistic evolution. Especially, the genetic variants that underlie host specific adaptation are key components of models of microbial diversification.
Originally, I was planning to observe ecotypic specialization of rhizobia and characterize genomic variation to adaptive divergence between distinct environments. Phylogenetic analyses revealed vast genetic variations of the rhizobia between in contrasting soil types. At the moment, results of the clustering implied no host specificities between in soil types. Further, cross-infection experiments between host plant and rhizobia respectively showed no differences in plant growth, in spite of the difference in the numbers of rhizobia between in soil types.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

地域適応は生物多様性を創出する主要な原動力である。近年の進化研究では、分子遺伝学や生態学の知見を基に多様化プロセスに迫る研究が求められるが、本研究はそうした潮流に合致する。さらに、根粒共生系の進化という、生物間相互作用の多様性と進化の過程を明らかにする点で、生物多様性の根本的な仕組みに迫ることができる。
研究材料(寄主)は滋賀県の絶滅危惧種に指定されており、行政や地域住民から保全手法の確立が強く求められている植物である。本研究の知見は、保全に関わるステークホルダーの活動を支援できる点において、社会的な意義がある。

Report

(4 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • 2018 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2020 2019 Other

All Presentation (8 results) Remarks (1 results)

  • [Presentation] 伊吹山に分布するイブキノエンドウの遺伝子情報をいた移入経路の解明2020

    • Author(s)
      原田英美子・中島優介・久保直輝・田畑諒一・大槻達郎・首藤光太郎・野間直彦・綱本良啓・陶山佳久・水野瑞夫・玉木一郎
    • Organizer
      日本植物学会第84回大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 地表徘徊性昆虫がハマエンドウの発芽に与える影響2020

    • Author(s)
      大槻 達郎
    • Organizer
      日本植物分類学会第19回大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 伊吹山に自生するヨーロッパ原産帰化植物の移入経路―イブキノエンドウの分布調査および遺伝子解析―2020

    • Author(s)
      中島優介・久保直輝・田畑諒一・大槻達郎・首藤光太郎・野間直彦・原田英美子
    • Organizer
      日本植物分類学会第19回大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 海浜植物ハマエンドウの種子に寄生するマメゾウムシの寄生率の年変動2020

    • Author(s)
      大槻 達郎
    • Organizer
      第67回日本生態学会大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 韓国産テナガエビの遺伝的集団構造(韓国語)2019

    • Author(s)
      サゴン・ジン,キム・サンギ,チェ・ビュンソ,田畑諒一,大槻達郎,リュ・シヒョン,ユ・ジョンナム
    • Organizer
      第74回韓国動物分類学会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 伊吹山に自生するヨーロッパ原産帰化植物の移入経路2019

    • Author(s)
      中島 優介,大槻 達郎,野間 直彦,原田 英美子
    • Organizer
      日本植物学会第83回大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 海浜植物の種子に寄生するマメゾウムシの寄生率の変動2019

    • Author(s)
      大槻達郎
    • Organizer
      日本植物分類学会第18回大会,首都大学東京 南大沢キャンパス(東京都八王子市)
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] Physiological differentiation inferred from germination rate between coastal and freshwater populations of the beach pea2019

    • Author(s)
      大槻達郎
    • Organizer
      第66回日本生態学会大会,神戸国際展示場(兵庫県神戸市)
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Remarks] 年報・業績目録

    • URL

      https://www.biwahaku.jp/research/publication/report/

    • Related Report
      2018 Research-status Report

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Published: 2018-04-23   Modified: 2022-01-27  

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