Study of environmental adaptation and horizontal gene transfer of soybean-nodulating rhizobia

• Project/Area Number: 19580069
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Plant nutrition/Soil science
• Research Institution: University of Miyazaki
• Principal Investigator: SAEKI Yuichi University of Miyazaki, 農学部, 准教授 (50295200)
• Project Period (FY): 2007 – 2009
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2009)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2009: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000); Fiscal Year 2008: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000); Fiscal Year 2007: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
• Keywords: ダイズ / Rj遺伝子型 / 根粒菌 / 遺伝子水平伝播 / 環境適応性 / ダイズ根粒菌 / Bradyrhizobium / 環境傾度 / 土壌pH / 土壌温度 / Rj遺伝子 / Sinorhizobium

Research Abstract

In this study, we have studied to clarify the mechanism of occupancy of soybean-nodulating rhizobia under various environmental conditions. We clarified environmental factors, soil temperature and soil pH for establishment of soybean-nodulating rhizobia flora through the analyses about bacterial culture and composition of flora of soybean-nodulating rhizobia under various temperature, gene expression analysis under various pH conditions, and horizontal gene transfer.

Research Products

• [Journal Article] ダイズ根粒菌の外来遺伝子獲得に関する菌株間差異の解析. (2010)
  • Author(s): 城惣吉, 山本昭洋, 吉田ナオト, 佐伯雄一
  • Journal Title: 宮崎大学農学部研究報告 55巻 Pages: 79-87
  • NAID: 110008658917
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] ダイズ根粒菌の外来遺伝子獲得に関する菌株間差異の解析 (2010)
  • Author(s): 城惣吉, 山本昭洋, 吉田ナオト, 佐伯雄一
  • Journal Title: 宮崎大学農学部研究報告 56 Pages: 79-87
  • NAID: 110008658917
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Intragenomic variation of internal transcribed spacer regions between 16S-23S rRNA genes among the three copies of Sinorhizobium fredii strains. (2009)
  • Author(s): Saeki Y, Oguro H, Akagi I, Yamakawa T, Yamamoto A
  • Journal Title: Soil Science and Plant Nutrition 55 Pages: 627-633
  • NAID: 110007502755
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 日本国内におけるダイズ根粒菌の分布と多様性～共生窒素固定の農業技術としての有効利用を目指して～ (2009)
  • Author(s): 佐伯雄一
  • Journal Title: 化学と生物 47巻 Pages: 228-230
  • NAID: 10026435129
• [Journal Article] Estimation of nodulation tendency among Rj-genotype soybeans by bradyrhizobial community isolated from an Andosol. (2009)
  • Author(s): Minami M, Yamakawa T, Yamamoto A, Akao S, Saeki Y
  • Journal Title: Soil Science and Plant Nutrition 54 Pages: 65-72
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Intragenomic variation of internal transcribed spacer regions between 16S-23S rRNA genes among the three copies of Sinorhizobium fredii strains (2009)
  • Author(s): Saeki Y, Oguro H, Akagi I, Yamakawa T, Yamamoto A
  • Journal Title: Soil Science and Plant Nutrition 55 Pages: 627-633
  • NAID: 110007502755
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 日本国内におけるダイズ根粒菌の分布と多様性～共生窒素固定の農業技術としての有効利用を目指して～ (2009)
  • Author(s): 佐伯雄一
  • Journal Title: 化学と生物 47 Pages: 228-230
  • NAID: 10026435129
• [Journal Article] Estimation of nodulation tendency among Rj-genotype soybeans by bradyrhizobial community isolated from an Andosol (2009)
  • Author(s): Minami M, et al.
  • Journal Title: Soil Science and Plant Nutrition 54 Pages: 65-72
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Estimation of bacterial community diversity of soybean-nodulating bradyrhizobia isolated from Rj-genotype soybeans. (2008)
  • Author(s): Saeki Y, Minami M, Yamamoto A, Akao S
  • Journal Title: Soil Science and Plant Nutrition 54 Pages: 718-724
  • NAID: 110007331015
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Diversity and Distribution of Indigenous Soybean-Nodulating Rhizobia in the Okinawa Islands (2008)
  • Author(s): Suzuki K, Oguro H, Yamakawa T, Yamamoto A, Akao S, Saeki Y
  • Journal Title: Japan. Soil Science and Plant Nutrition 54 Pages: 237-246
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Diversity and Distribution of Indigenous Soybean-Nodulating Rhizobia in the Okinawa Islands, Japan (2008)
  • Author(s): Suzuki K, et al.
  • Journal Title: Soil Science and Plant Nutrition 54 Pages: 237-246
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Estimation of bacterial community diversity of soybean-nodulating bradyrhizobia isolated from Rj-genotype soybeans (2008)
  • Author(s): Saeki Y, et al.
  • Journal Title: Soil Science and Plant Nutrition 54 Pages: 718-724
  • NAID: 110007331015
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Diversity and Distribution of Indigenous Soybean-Nodulating Rhizobia in the Okinawa Islands, Japan (2008)
  • Author(s): Suzuki K, et. al.
  • Journal Title: Soil Science and Plant Nutrition 54(In press)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Differentiation of soybean-nodulating Bradyrhziobium USDA strains based on restriction fragment length polymorphisms of 23S-5S rRNA genes. (2007)
  • Author(s): Saeki Y, Murata T, Yamakawa T, Akao S
  • Journal Title: Soil Science and Plant Nutrition 53 Pages: 562-567
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Differentiation of soybean-nodulating Bradyrhziobium USDA strains based on restriction fragment length polymorphisms of 23S-5S rRNA genes (2007)
  • Author(s): Saeki Y, et. al.
  • Journal Title: Soil Science and Plant Nutrition 53 Pages: 562-567
  • Peer Reviewed
• [Presentation] ダイズの根粒着生におけるRj遺伝子型と温度の影響 (2009)
  • Author(s): 城惣吉, 南麻衣, 梅原洋佐, 林正紀, 山本昭洋, 佐伯雄一
  • Organizer: 日本土壌肥料学会2009年度京都大会
  • Place of Presentation: 京都
• [Presentation] Rj遺伝子型ダイズの根粒菌選択性に関する群集構造解析 (2009)
  • Author(s): 田島稔之, 大塚亜沙子, 梅原洋佐, 林正紀, 山本昭洋, 佐伯雄一
  • Organizer: 日本土壌肥料学2009年度京都大会
  • Place of Presentation: 京都
• [Presentation] ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumのアルカリ耐性とnha遺伝子発現 (2009)
  • Author(s): 小黒紘子, 山本昭洋, 佐伯雄一
  • Organizer: 日本土壌微生物学会2009年度大会
  • Place of Presentation: 福岡
• [Presentation] ダイズ根粒菌の外来遺伝子獲得機構に関する検討 (2009)
  • Author(s): 城惣吉, 山本昭洋, 佐伯雄一
  • Organizer: 日本土壌肥料学会九州支部春季例会
  • Place of Presentation: 佐賀
• [Presentation] ダイズの根粒着生におけるRj遺伝子型と温度の影響 (2009)
  • Author(s): 城惣吉, 南麻衣, 梅原洋佐, 林正紀, 山本昭洋, 佐伯雄一
  • Organizer: 日本土壌肥料学会2009年度京都大会
  • Place of Presentation: 京都大学
• [Presentation] Rj遺伝子型ダイズの根粒菌選択性に関する群集構造解析 (2009)
  • Author(s): 田島稔之, 大塚亜沙子, 梅原洋佐, 林正紀, 山本昭洋, 佐伯雄一
  • Organizer: 日本土壌肥料学会2009年度京都大会
  • Place of Presentation: 京都大学
• [Presentation] ダイズ根粒菌 Bradyrhiaobium japonicum のアルカリ耐性とnha遺伝子発現 (2009)
  • Author(s): 小黒紘子, 山本昭洋, 佐伯雄一
  • Organizer: 日本土壌微生物学会2009年度大会
  • Place of Presentation: 九州大学
• [Presentation] ダイズ根粒菌の外来遺伝子獲得機構に関する検討 (2009)
  • Author(s): 城惣吉, 山本昭洋, 佐伯雄一
  • Organizer: 日本土壌肥料学会九州支部春季例会
  • Place of Presentation: 佐賀大学
• [Presentation] 特定根粒菌株に対して非親和性を示すRj4遺伝子保有ダイスの解析 (2008)
  • Author(s): 林 正紀ら
  • Organizer: 日本育種学会
  • Place of Presentation: 滋賀県立大学 (滋賀)
  • Year and Date: 2008-10-10
• [Presentation] 土着ダイス根粒菌の占有率に及ぼす温度の影響 (2008)
  • Author(s): 小住哲ら
  • Organizer: 日本土壌肥料学会
  • Place of Presentation: 名古屋市立大学 (愛知)
  • Year and Date: 2008-09-10
• [Presentation] 日本の土着ダイス根粒菌の群集構造と分布に関する研究 (2008)
  • Author(s): 田島稔之ら
  • Organizer: 日本土壌肥料学会
  • Place of Presentation: 名古屋市立大学 (愛知)
  • Year and Date: 2008-09-10
• [Presentation] ダイス根粒菌の分布と多様性に関する分子生態学的研究 (2008)
  • Author(s): 佐伯雄一
  • Organizer: 日本土壌肥料学会
  • Place of Presentation: 名古屋市立大学 (愛知)
  • Year and Date: 2008-09-10
• [Presentation] 梅原洋佐特定根粒菌株に対して非親和性を示すRj4遺伝子保有ダイズの解析 (2008)
  • Author(s): 林正紀, 佐伯雄一, 西岡美樹, 高橋将一, 佐山貴司, 石本政男, 原田久也, 河内宏
  • Organizer: 日本育種学会第114回大会
  • Place of Presentation: 滋賀
• [Presentation] ダイズ根粒菌の分布と多様性に関する分子生態学的研究 (2008)
  • Author(s): 佐伯雄一
  • Organizer: 日本土壌肥料学会2008年度愛知大会
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] 土着ダイズ根粒菌の占有率に及ぼす温度の影響 (2008)
  • Author(s): 小住哲, 小黒紘子, 山本昭洋, 佐伯雄一
  • Organizer: 日本土壌肥料学会2008年度愛知大会
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] 日本の土着ダイズ根粒菌の群集構造と分布に関する研究 (2008)
  • Author(s): 田島稔之, 南麻衣, 山本昭洋, 佐伯雄一
  • Organizer: 日本土壌肥料学会2008年度愛知大会
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] ダイズ根粒菌の宿主への感染傾向に関する解析 -根粒着生・培養を通して見える根粒菌生態- (2007)
  • Author(s): 佐伯 雄一
  • Organizer: 日本土壌肥料学会
  • Place of Presentation: 東京農業大学(東京)
  • Year and Date: 2007-08-24
• [Presentation] ダイズ根粒菌の宿主への感染傾向に関する解析-根粒着生・培養を通して見える根粒菌生態- (2007)
  • Author(s): 佐伯雄一
  • Organizer: 日本土壌肥料学会2007年度東京大会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] 宿主遺伝子型による土着ダイズ根粒菌の分離傾向 (2007)
  • Author(s): 南麻衣, 山本昭洋, 佐伯雄一, 赤尾勝一郎
  • Organizer: 日本土壌肥料学会2007年度東京大会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] ダイズ根粒菌Sinorhizobium属USDA株の16S-23S rDNAITS領域の多様性 (2007)
  • Author(s): 小黒紘子, 佐伯雄一, 山本昭洋, 赤尾勝一郎
  • Organizer: 日本土壌肥料学会2007年度東京大会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] 赤尾勝一郎ダイズ根粒菌の土壌中における占有率評価法の開発 (2007)
  • Author(s): 小住哲, 堀真治, 佐伯雄一, 山本昭洋
  • Organizer: 日本土壌肥料学会九州支部春期例会
  • Place of Presentation: 福岡
• [Remarks]
  • URL: http://www.agr.miyazaki-u.ac.jp/~abs/sspn/index.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.agr.miyazaki-u.ac.jp/~abs/sspn/index.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.agr.miyazaki-u.ac.jp/~abs/index.html