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Mechanism of brain homeostasis dysfunction by spatiotemporal transcriptional dysregulation of microglia.

Research Project

Project/Area Number 19H01024
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Medium-sized Section 49:Pathology, infection/immunology, and related fields
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

Ohteki Toshiaki  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (50233200)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 村川 泰裕  国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, チームリーダー (50765469)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥45,110,000 (Direct Cost: ¥34,700,000、Indirect Cost: ¥10,410,000)
Fiscal Year 2022: ¥11,700,000 (Direct Cost: ¥9,000,000、Indirect Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2021: ¥11,700,000 (Direct Cost: ¥9,000,000、Indirect Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2020: ¥10,270,000 (Direct Cost: ¥7,900,000、Indirect Cost: ¥2,370,000)
Fiscal Year 2019: ¥11,440,000 (Direct Cost: ¥8,800,000、Indirect Cost: ¥2,640,000)
Keywordsミクログリア / 老化 / アルツハイマー病 / 転写性エンハンサー / NET-CAGE / エンハンサー / NET-CAGE法 / 活性化エンハンサー / CAGE法 / ライフステージ
Outline of Research at the Start

本研究では、細胞機能変化の最も初期に起こるエンハンサーの活性化を一塩基レベルの解像度で計測可能なNET-CAGE法を用いて、ミクログリアの加齢に伴う再生→炎症転換を規定する活性化エンハンサー(active enhancer, AE)を同定・可視化することにより、同細胞の時空依存的転写制御変容に基づく再生→炎症転換の原因とプロセスの全貌を明らかにする。さらに再生→炎症転換制御法を開発して脳機能低下の改善を目指す。AEは細胞種特異的であるため、ミクログリア特異的機能制御法の開発が期待できる。NET-CAGE法の開発者が研究分担者として参画しており、技術的優位性と独創性を有する提案である。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we used the NET-CAGE method to measure transcribed enhancers (TE) at high nucleotide resolution to elucidate the mechanisms of microglial transcriptional regulation and alteration associated with aging and the development of Alzheimer's disease (AD). As a result, we succeeded in identifying approximately 44,000 microglial TEs, more than half of which are new TEs, and revealed that they dynamically change with life stage progression and the onset of AD. In addition, microglia acquired different TE landscapes in aging and AD pathogenesis, each exhibiting unique cellular functions.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

従来法ではTEだけでなくpoised enhancerも検出されてしまうため、TEの識別が困難であったが、NET-CAGE法を用いることで真のミクログリアTE(機能的エンハンサー)の検出が可能になった。また、ミクログリアにおける老化やAD特異的TE並びに両者に共通するTEの同定は、それらの近傍制御遺伝子情報と統合することによって、より正確な病態理解につながると考えられた。さらに、同定したマウスミクログリアTEを、既存の高齢者やAD患者ミクログリアのATAC-seqデータと比較解析することで、種間の共通点や独自性を明らかにすることができると考えられる。

Report

(4 results)
  • 2022 Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Comments on the Screening Results   Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2021 2020 2019 Other

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] NET-CAGE法を用いたエンハンサー解析と病態解明2020

    • Author(s)
      石川駿、佐藤卓、村川泰裕、樗木俊聡
    • Journal Title

      糖尿病・内分泌代謝科(科学評論社)

      Volume: 51 Pages: 323-329

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Journal Article] NET-CAGE 法を用いたミクログリアエンハンサーの同定2020

    • Author(s)
      石川駿、佐藤卓、平林茂樹、山田翔太、村川泰裕、樗木俊聡。
    • Journal Title

      糖尿病・内分泌代謝科

      Volume: 51

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Journal Article] Characterization of radioresistant epithelial stem cell heterogeneity in the damaged mouse intestine.2020

    • Author(s)
      Sato T, Sase M, Ishikawa S, Kajita M, Asano J, Sato T, Mori Y, and Ohteki T.
    • Journal Title

      Sci Rep

      Volume: 10 Issue: 1 Pages: 8308-8308

    • DOI

      10.1038/s41598-020-64987-1

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Propolis induces Ca<sup>2+</sup> signaling in immune cells2019

    • Author(s)
      Adachi T, Yoshikawa S, Tezuka H, Tsuji NM, Ohteki T, Karasuyama H, Kumazawa T.
    • Journal Title

      Bioscience of Microbiota, Food and Health

      Volume: 38 Issue: 4 Pages: 141-149

    • DOI

      10.12938/bmfh.19-011

    • NAID

      130007738832

    • ISSN
      2186-3342
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Regulation of IgA production by intestinal dendritic cells and related cells.2019

    • Author(s)
      Tezuka H, and Ohteki T.
    • Journal Title

      Frontiers in Immunology

      Volume: 10 Pages: 1891-1891

    • DOI

      10.3389/fimmu.2019.01891

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 加齢性ミクログリアの転写制御機構の解明2021

    • Author(s)
      石川駿
    • Organizer
      難治疾患研究所・大学院生・若手研究者研究発表会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] ミクログリアの加齢性機能変容を引き起こす転写制御機構2020

    • Author(s)
      石川駿、佐藤卓、平林茂樹、山田翔太、村川泰裕、樗木俊聡
    • Organizer
      第109回日本病理学会総会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] ミクログリアの加齢機能変容を引き起こす転写制御機構2020

    • Author(s)
      石川駿、佐藤卓、平林茂樹、山田翔太、村川泰裕、樗木俊聡
    • Organizer
      第 109 回日本病理学会総会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Remarks] 国立大学法人 東京医科歯科大学(TMDU)難治疾患研究所 生体防御学分野

    • URL

      https://www.tmd.ac.jp/mri/bre/index.html

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Remarks] 国立大学法人東京医科歯科大学(TMDU)難治疾患研究所 生体防御学分野

    • URL

      http://www.tmd.ac.jp/mri/bre/index.html

    • Related Report
      2019 Annual Research Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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