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Understanding of pathogenesis of aggressive periodontitis by omics data

Research Project

Project/Area Number 19H01069
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Medium-sized Section 57:Oral science and related fields
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

Shinya Murakami  大阪大学, 大学院歯学研究科, 教授 (70239490)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 藤原 千春  大阪大学, 大学院歯学研究科, 助教 (00755358)
柏木 陽一郎  大阪大学, 大学院歯学研究科, 助教 (20598396)
岩山 智明  大阪大学, 大学院歯学研究科, 助教 (80757865)
山下 元三  大阪大学, 歯学部附属病院, 講師 (90524984)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥44,980,000 (Direct Cost: ¥34,600,000、Indirect Cost: ¥10,380,000)
Fiscal Year 2022: ¥9,360,000 (Direct Cost: ¥7,200,000、Indirect Cost: ¥2,160,000)
Fiscal Year 2021: ¥9,230,000 (Direct Cost: ¥7,100,000、Indirect Cost: ¥2,130,000)
Fiscal Year 2020: ¥14,820,000 (Direct Cost: ¥11,400,000、Indirect Cost: ¥3,420,000)
Fiscal Year 2019: ¥11,570,000 (Direct Cost: ¥8,900,000、Indirect Cost: ¥2,670,000)
Keywords侵襲性歯周炎 / エクソームシークエンス解析 / GWAS / SNP / 歯根膜細胞 / エクソームシークエンス / 疾患関連遺伝子 / LIPA / CLSPN / ゲノムワイドアプローチ / オミクス解析 / メタボローム解析 / プロテオーム解析
Outline of Research at the Start

若年者より発症する侵襲性歯周炎(AgP) は、遺伝子の関与が大きい歯周炎として知られている。本研究では、これまでに申請者が構築した日本人侵襲性歯周炎患者のゲノムデータベースのゲノム検体数の拡充を行う。本研究により新たに構築されるデータベースを公的に活用する基盤を構築すると共に、ゲノムワイド関連解析を遂行し、侵襲性歯周炎の発症・進行に関わる疾患関連候補遺伝子の抽出を行う。得られた候補遺伝子に対して、in vitroおよびin vivo解析を行うことでAgP関連遺伝子の機能解析を推進する。世界中の研究者に活用されるバイオサイエンスデータを構築し、AgPに対する新規診断法や治療法の開発に繋げる。

Outline of Final Research Achievements

Aggressive periodontitis (AgP) is characterized by general health and rapid destruction of periodontal tissue. The familial aggregation of this disease highlights the involvement of genetic factors in its pathogeny. Previously, we conducted a genome-wide association study (GWAS) to identify AgP-related genes in a Japanese population; however, the small genome sample size remains unsolved issue. Thus, in this study, we aimed to expand the genome samples of Japanese AgP patients and establish a bigger Japanese AgP genome database.In addition, using the AgP database, we conducted a GWAS and identified Japanese AgP-related candidate genes such as PON-1 and LIPA. Furthermore, we confirmed the involvement of these disease-related candidate genes in AgP by the functional analyses.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ゲノムワイドアプローチによる網羅的バイオインフォマティクス解析手法を用いて、疾患関連遺伝子を同定するためには、多くの検体数が必要となる。本研究では、多施設共同研究を推進することで、日本中の歯科大学において、侵襲性歯周炎 (AgP) 患者のリクルートを実施し、検体数の拡充を実施した。そして本研究成果により、日本人の侵襲性歯周炎大規模データベースを構築した。この情報は、AgPの病態を多面的に理解するために役立つのみならず、今後、この成果を利用することでAgPの治療法の開発につながることが期待できる。

Report

(6 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Comments on the Screening Results   Annual Research Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2023 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 4 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Lysosomal acid lipase regulates bioenergetic process during the cytodifferentiation of human periodontal ligament cells2023

    • Author(s)
      Teerachate Nantakeeratipat, Chiharu Fujihara, Takuto Nogimori, Masahiro Matsumoto, Takuya Yamamoto, Shinya Murakami
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 662 Pages: 84-92

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2023.04.041

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Lipase-a single-nucleotide polymorphism rs143793106 is associated with increased risk of aggressive periodontitis by negative influence on the cytodifferentiation of human periodontal ligament cells2022

    • Author(s)
      Masahiro Matsumoto, Chiharu Fujihara, Teerachate Nantakeeratipa, Jirouta Kitagaki, Yu Yamamoto, Satoru Yamada, Masahiro Kitamura, Shinya Murakami
    • Journal Title

      Journal of Periodontal Research

      Volume: 00 Issue: 1 Pages: 1-9

    • DOI

      10.1111/jre.13079

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] <i>Plap-1</i> lineage tracing and single-cell transcriptomics reveal cellular dynamics in the periodontal ligament2022

    • Author(s)
      Iwayama Tomoaki、Iwashita Mizuho、Miyashita Kazuya、Sakashita Hiromi、Matsumoto Shuji、Tomita Kiwako、Bhongsatiern Phan、Kitayama Tomomi、Ikegami Kentaro、Shimbo Takashi、Tamai Katsuto、Murayama Masanori A.、Ogawa Shuhei、Iwakura Yoichiro、Yamada Satoru、Olson Lorin E.、Takedachi Masahide、Murakami Shinya
    • Journal Title

      Development

      Volume: 149 Issue: 19 Pages: 201203-201203

    • DOI

      10.1242/dev.201203

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Periodontal tissue stem cells and mesenchymal stem cells in the periodontal ligament2022

    • Author(s)
      Iwayama Tomoaki、Sakashita Hiromi、Takedachi Masahide、Murakami Shinya
    • Journal Title

      Japanese Dental Science Review

      Volume: 58 Pages: 172-178

    • DOI

      10.1016/j.jdsr.2022.04.001

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Energy metabolism in osteogenic differentiation and reprogramming: A strategy for periodontal regeneration.2022

    • Author(s)
      C Fujihara, T Nantakeeratipat, S Murakami
    • Journal Title

      Front Dent Med

      Volume: 3 Pages: 815140-815140

    • DOI

      10.3389/fdmed.2022.815140

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 歯周病新分類の解釈とその応用2022

    • Author(s)
      村上伸也、藤原千春、岩山智明
    • Journal Title

      日本臨床歯周病学会会誌39(2)

      Volume: 39(2) Pages: 20-26

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Journal Article] 歯の早期喪失と老後のQOL、認知機能、生命予後等の関連性を縦断的に追跡調査可能とするための新たな診断法の開発と罹患率のパイロット調査2021

    • Author(s)
      藤原千春、北垣次郎太、桝本梨沙、松本昌大、山本 優、村上伸也
    • Journal Title

      日本歯科医学会誌

      Volume: 40 Pages: 49-54

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      2020 Annual Research Report
  • [Journal Article] Association of periodontal disease with atherosclerosis in 70-year-old Japanese older adults2020

    • Author(s)
      Kitamura M, Ikebe K, Kamide K, Gondo Y, Yamashita M, Takedachi M, Nozaki T, Fujihara C, Yamada S, Kashiwagi Y, Miki K, Iwayama T, Hatta K, Mihara Y, Kurushima Y et al
    • Journal Title

      Odontology

      Volume: 109 Issue: 2 Pages: 506-513

    • DOI

      10.1007/s10266-020-00567-z

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Response to "Genetics of Periodontitis without Bias".2019

    • Author(s)
      Masumoto R, Kitagaki J, Fujihara C, Matsumoto M, Miyauchi S, Asano Y, Imai A, Kobayashi K, Nakaya A, Yamashita M, Yamada S, Kitamura M, Murakami S
    • Journal Title

      The Journal of Periodontal Research

      Volume: 54(5) Issue: 5 Pages: 455-456

    • DOI

      10.1111/jre.12652

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 日本人侵襲侵襲炎疾患関連遺伝子Claspinのヒト歯根膜細胞における機能解析2021

    • Author(s)
      Teerachate Nantakeeratipat、藤原 千春、松本 昌大、桝本 梨沙、山本 優、 北垣 次郎太、北村 正博、 村上 伸也
    • Organizer
      第154回春季日本歯科保存学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 日本人侵襲性歯周炎の疾患関連遺伝子LIPA SNP rs14379316のヒト歯根膜細胞における機能解析2021

    • Author(s)
      松本 昌大、藤原 千春、北垣 次郎太、Teerachate Nantakeeratipat、桝本 梨沙、山本 優、 村上 伸也
    • Organizer
      第155回秋季日本歯科保存学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Lipolysis Is Involved in Cytodifferentiation of Human Periodontal Ligament Cells2021

    • Author(s)
      Teerachate Nantakeeratipat, Chiharu Fujihara, Masahiro Matsumoto, Risa Masumoto, Yu Yamamoto, Jirouta Kitagaki, Shinya Murakami
    • Organizer
      The 2021 IADR/AADR/CADR General Session & Exhibition
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 侵襲性歯周炎患者に対して包括的治療を行なった10年経過症例2021

    • Author(s)
      柏木陽一郎、北村正博、村上伸也
    • Organizer
      第64回秋季日本歯周病学総会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 日本人侵襲性歯周炎の疾患関連遺伝子Paraoxonase-1の機能解析2020

    • Author(s)
      枡本梨沙, 藤原千春, 松本昌大, 山本優, 北垣次郎太, 北村正博, 村上伸也
    • Organizer
      第153回秋季日本歯科保存学会学術大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Identification of genetic risk factors of aggressive periodontitis in the Japanese population2020

    • Author(s)
      Teerachate Nantakeeratipat, 藤原千春, 松本昌大, 桝本梨沙, 北垣次郎太, 山本優, 木下茉優, 北村正博, 村上伸也
    • Organizer
      第63回秋季日本歯周病学会学術大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Paraoxonase-1, a risk factor of Aggressive Periodontitis2020

    • Author(s)
      Masumoto R, Fujihara C, Matsumoto M, Kitagaki J, Murakami S
    • Organizer
      The 98th General Session of the International Association of Dental Research
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 歯周病の新分類から侵襲性歯周炎を再考する2020

    • Author(s)
      村上 伸也
    • Organizer
      日本歯周病学会 第5回近畿地区(滋賀)臨床研修会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 遺伝子多型解析から侵襲性歯周炎を再考する2020

    • Author(s)
      藤原 千春
    • Organizer
      日本歯周病学会 第5回近畿地区(滋賀)臨床研修会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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