• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Single-molecule absorption spectroscopy

Research Project

Project/Area Number 19H02665
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 32010:Fundamental physical chemistry-related
Research InstitutionTokyo Institute of Technology (2020-2021)
Tohoku University (2019)

Principal Investigator

Kondo Toru  東京工業大学, 生命理工学院, 講師 (30452204)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Fiscal Year 2020: ¥7,280,000 (Direct Cost: ¥5,600,000、Indirect Cost: ¥1,680,000)
Fiscal Year 2019: ¥7,930,000 (Direct Cost: ¥6,100,000、Indirect Cost: ¥1,830,000)
Keywords1分子分光 / 顕微分光 / 生体系の動的挙動と機能の相関 / 光合成 / タンパク質ダイナミクス / 1分子吸収 / 電子移動 / エネルギー移動 / 生体光反応
Outline of Research at the Start

近年、タンパク質構造が原子分解能で明らかにされ、構造を基にした機能解析が可能になってきた。一方で、生体内の生理環境は刻一刻と変化しており、構造は常に変動している。このようなタンパク質構造ダイナミクスを解析するため、1分子蛍光分光法が発展した。しかし蛍光検出では、非蛍光性の分子・状態・反応中間体は解析できない。そこで本研究では、1分子の吸収分光法を新たに開発し、光合成光反応の光電変換過程を1分子レベルで観測する。タンパク質構造ダイナミクスと反応経路・速度の相関解析から、『構造自由度の高い生体タンパク質のような巨大高分子で、どのように反応の経路・速度が安定化されているのか?』を明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

Highly-sensitive absorption microscope was developed for the single-molecule absorption spectroscopy. To detect a feeble absorption signal, we reduced noises caused by a laser source, light scattering, inappropriate optics, and instability of an optical system. Additionally, a sensitive photodetector was utilized. Consequently, we achieved the absorption imaging of single photosystem I (PS I) particles with diffraction-limited spatial resolution.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

近年、タンパク質構造が原子分解能で明らかにされ、構造を基にした機能解析が可能になってきた。一方で、生体内の生理環境は刻一刻と変化しており、構造は常に変動している。このようなタンパク質構造ダイナミクスを解析するため、1分子蛍光分光法が発展した。しかし、蛍光検出では非蛍光性の分子・状態・反応中間体は解析できない。そこで、吸収検出をベースにした1分子分光法の開拓が不可欠となる。本研究で開発した高感度吸収顕微技術を発展させることで、従来の蛍光顕微では見えなかった生体光反応の1分子観測が可能となり、生体系の動的挙動の意義の解明に繋がる。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (20 results)

All 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 1 results) Presentation (13 results) (of which Invited: 11 results)

  • [Journal Article] Observation of robust energy transfer in the photosynthetic protein allophycocyanin using single-molecule pump-probe spectroscopy2022

    • Author(s)
      Moya Raymundo、Norris Audrey C.、Kondo Toru、Schlau-Cohen Gabriela S.
    • Journal Title

      Nature Chemistry

      Volume: 14 Issue: 2 Pages: 153-159

    • DOI

      10.1038/s41557-021-00841-9

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Energy transfer fluctuation observed by single-molecule spectroscopy of red-shifted bacteriochlorophyll in the homodimeric photosynthetic reaction center2022

    • Author(s)
      Kondo Toru、Mutoh Risa、Arai Shun、Kurisu Genji、Oh-oka Hirozo、Fujiyoshi Satoru、Matsushita Michio
    • Journal Title

      The Journal of Chemical Physics

      Volume: 156 Issue: 10 Pages: 105102-105102

    • DOI

      10.1063/5.0077290

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Recent advances in single-molecule spectroscopy studies on light-harvesting processes in oxygenic photosynthesis2022

    • Author(s)
      Kondo Toru、Shibata Yutaka
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 19 Issue: 0 Pages: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v19.0013

    • ISSN
      2189-4779
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spectrally-tunable femtosecond single-molecule pump-probe spectroscopy2021

    • Author(s)
      Moya Raymundo、Kondo Toru、Norris Audrey C.、Schlau-Cohen Gabriela S.
    • Journal Title

      Optics Express

      Volume: 29 Issue: 18 Pages: 28246-28246

    • DOI

      10.1364/oe.432995

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 単一タンパク質分光でみえる光合成の光反応制御に関わる複数のタンパク質構造揺らぎ2021

    • Author(s)
      近藤 徹
    • Journal Title

      日本物理学会誌

      Volume: 76 Pages: 17-22

    • NAID

      130007966128

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cryogenic Single-Molecule Spectroscopy of the Primary Electron Acceptor in Photosynthetic Reaction Center2020

    • Author(s)
      T. Kondo, R. Mutoh, H. Tabe, G. Kurisu, H. Oh-oka, S. Fujiyoshi, and M. Matsushita
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. Lett.

      Volume: - Issue: 10 Pages: 3980-3986

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.0c00891

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Microsecond and millisecond dynamics in the photosynthetic protein LHCSR1 observed by single-molecule correlation spectroscopy2019

    • Author(s)
      Kondo Toru、Gordon Jesse B.、Pinnola Alberta、Dall’Osto Luca、Bassi Roberto、Schlau-Cohen Gabriela S.
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 116 Issue: 23 Pages: 11247-11252

    • DOI

      10.1073/pnas.1821207116

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 複数の分子が織りなす安定・高効率な生体光反応2022

    • Author(s)
      近藤徹
    • Organizer
      第102回日本化学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 一分子吸収分光に向けた高感度吸収顕微鏡の開発2022

    • Author(s)
      新井峻, 近藤徹
    • Organizer
      第77回日本物理学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 二次元蛍光寿命相関分光による光化学系Iタンパク質の単一分子電子移動速度の測定2021

    • Author(s)
      谷口凜,篠田稔行,鞆達也,叶深,近藤徹,柴田穣
    • Organizer
      第15回分子科学討論会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 光合成光反応制御システムの機能的ロバスト性2021

    • Author(s)
      近藤徹
    • Organizer
      人工光合成研究センター 第1回若手研究者研究発表
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 光合成光捕集制御に関わるタンパク質構造揺らぎの単⼀タンパク質分光解析2021

    • Author(s)
      近藤徹
    • Organizer
      第76回日本物理学会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 単一タンパク質分光で解き明かす生体系の動的挙動と機能の相関2020

    • Author(s)
      近藤徹
    • Organizer
      第75回日本物理学会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 生物から学ぶ新規機能性物質の設計指針:不均一媒質が生み出す多機能性の理解に向けて2020

    • Author(s)
      近藤徹
    • Organizer
      第100回日本化学会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 光合成生物の日焼け防止策 ~1粒のタンパク質を光学顕微鏡で眺めてみた~2019

    • Author(s)
      近藤徹
    • Organizer
      光科学技術研究会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] レーザー同期できないタンパク質揺らぎの解析:生体系のロバスト性の理解に向けて2019

    • Author(s)
      近藤徹
    • Organizer
      第22回光科学若手研究会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 単一タンパク質分光で観る光合成光反応の動的制御機構2019

    • Author(s)
      近藤徹
    • Organizer
      第27回光合成セミナー
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] タンパク質の動的性質を利用したロバストな生体光反応2019

    • Author(s)
      近藤徹
    • Organizer
      第3回定量生命科学研究所シンポジウム
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Next challenge in biological photophysics: From static/isolated protein to dynamic/assembled protein network2019

    • Author(s)
      Toru Kondo
    • Organizer
      第57回生物物理学会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Regulation mechanism of photochemical reaction through protein dynamics in biological photosynthetic system2019

    • Author(s)
      Toru Kondo
    • Organizer
      第4回 FRIS Retreat
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi