Single molecule imaging of eukaryotic transcription.
| Project/Area Number |
19H03197
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 43040:Biophysics-related
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
TADAKUMA HISASHI 東京大学, 定量生命科学研究所, 協力研究員 (10339707)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
安達 成彦 大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 特任准教授 (70707489)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2021)
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| Budget Amount *help |
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2020: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2019: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
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| Keywords | 1分子計測(SMD) / DNAデバイス / 遺伝子発現 / 転写 / 翻訳 / クライオ電子顕微鏡 / 核酸 / 蛋白質 / 分子モーター / ナノバイオ |
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| Outline of Research at the Start |
生命の設計図であるゲノムから、RNAを作る転写反応は、生命の基本反応の1つです。しかし、従来、関与する因子の同定は進んでいるものの、実際に機能する際の3次元的な空間配置を解析する技術に限界があり、その分子機構は良くわかっていませんでした。本研究では、ナノメートル精度で設計された人工反応場を構築し、関与因子の空間配置がどのように転写反応に影響を与えるかを明らかにします。
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| Outline of Final Research Achievements |
Gene expression is powered by weak interaction of bio-molecules. To compensate the weak interaction, related molecules are integrated on the scaffold and form super-complex and "Nano reaction field", which allows the efficient process of specific reaction while excluding unintended factors. Here, we developed basic techniques to reconstitute these "Nano reaction field". We established DNA origami-based technologies for activity and structure analysis (e.g., Cryo-EM), which would be also the platform for future gene expression control nano-device.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究では、従来の反応拡散系を基にした反応系ではなく、反応に関与する因子をDNAナノ構造の上に集積化した反応系(ナノ反応場)を構築・解析する為の基盤技術の確立を行った。確立した技術は、生体の超分子構造の解析に応用可能であり、生命科学研究の進展に寄与すると思われる。また、我々が構築してきたプログラム可能な遺伝子発現ナノデバイス(ナノチップ)に適用する事で、細胞や人工細胞の運命制御が可能となり、医薬や有用物質生産に貢献すると期待される
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Report
(4 results)
Research Products
(42 results)
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[Journal Article] Non-conventional octameric structure of C-phycocyanin2021
Author(s)
Minato Takuo、Teramoto Takamasa、Adachi Naruhiko、Hung Nguyen Khac、Yamada Kaho、Kawasaki Masato、Akutsu Masato、Moriya Toshio、Senda Toshiya、Ogo Seiji、Kakuta Yoshimitsu、Yoon Ki-Seok
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Journal Title
Communications Biology
Volume: 4
Issue: 1
Pages: 1238-1238
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Structural analysis reveals TLR7 dynamics underlying antagonism2020
Author(s)
Tojo Shingo、Zhang Zhikuan、Matsui Hiroyuki、Tahara Masahiro、Ikeguchi Mitsunori、Kochi Mami、Kamada Mami、Shigematsu Hideki、Tsutsumi Akihisa、Adachi Naruhiko、Shibata Takuma、Yamamoto Masaki、Kikkawa Masahide、Senda Toshiya、Isobe Yoshiaki、Ohto Umeharu、Shimizu Toshiyuki
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Journal Title
Nature Communications
Volume: 11
Issue: 1
Pages: 1-11
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] HCV IRES captures an actively translating 80S ribosome2019
Author(s)
Yokoyama Takeshi、Machida Kodai、Iwasaki Wakana、Shigeta Tomoaki、Nishimoto Madoka、Takahashi Mari、Sakamoto Ayako、Yonemochi Mayumi、Harada Yoshie、Shigematsu Hideki、Shirouzu Mikako、Tadakuma Hisashi、Imataka Hiroaki、Ito Takuhiro
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Journal Title
Molecular Cell
Volume: 印刷中
Issue: 6
Pages: 1205-1214
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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