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Development of photonic crystal resonator for epigenome analysis

Research Project

Project/Area Number 19H04451
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 90110:Biomedical engineering-related
Research InstitutionOsaka Prefecture University

Principal Investigator

Endo Tatsuro  大阪府立大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (40432017)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2020: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2019: ¥7,280,000 (Direct Cost: ¥5,600,000、Indirect Cost: ¥1,680,000)
Keywordsフォトニック結晶 / バイオセンサ / ナノインプリントリソグラフィー / エピゲノム解析 / ナノ共振器 / エピゲノム / ナノインプリントリソグラフィ / DNA / フォトニック決勝 / バイオセンサー
Outline of Research at the Start

本研究の目的は、①可視領域の光でDNA鎖中シトシン塩基のメチル化に起因するわずかな分子量・構造変化を屈折率変化として高感度に直接検出可能な光学素子「フォトニック結晶(Photonic crystal: PhC)ナノ共振器」を設計・開発し、②DNA鎖のメチル化率を非染色で解析可能にし、③アルツハイマー病とDNAメチル化率の相関を明らかにすることにある。
本研究では、既存の技術を凌駕する性能(簡便性・感度)でエピゲノム解析デバイスを開発し、アルツハイマー病モデル培養細胞を用いて開発したデバイスの有用性評価を行い、アルツハイマー病早期診断デバイスとして応用展開を進める。

Outline of Final Research Achievements

In this study, design and development of a photonic crystal (PhC) nanocavity which is an optical device that can directly detect small refractive index changes for epigenome analysis was aimed. The PhC nanocavity was fabricated using nanoimprint lithography, and the TiO2 layer was deposited on to the PhC cavity surface. For epigenome analysis, the target DNA solution was introduced onto the probe DNA immobilizaed PhC nanocavity surface. And then, the detection of methylation and unmethylation was carried out by DNA hybridization.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

バイサルファイト法等従来のエピゲノム解析法は、DNAシーケンサーを用いて結果を取得するため煩雑な操作を必要とし、高額な装置が必要という課題があった。しかし本研究で開発したPhCナノ共振器を用いたエピゲノム解析法は、前述した従来法の課題を克服し、簡便・安価に解析が可能になることが期待でき、生命科学・医学の発展に貢献できるという点で意義がある。
加えて開発したPhCナノ共振器は、DNAハイブリダイゼーションの他抗原抗体反応等種々の生化学反応によって誘起される屈折率変化を高感度に検出することが可能であり、エピゲノム解析に限定されず疾病の超早期診断などへの応用展開が期待できる点で社会的意義がある。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (33 results)

All 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (13 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 6 results) Presentation (20 results) (of which Invited: 4 results)

  • [Journal Article] Fabrication and Characterization of YAG:Ce<sup>3+</sup> Phosphor Powder-Contained Photonic Crystal for Optical Sensor2022

    • Author(s)
      Ueda Shotaro、Kobayashi Nao、Kawasaki Daiki、Yamada Hirotaka、Sueyoshi Kenji、Hisamoto Hideaki、Endo Tatsuro
    • Journal Title

      IEEJ Transactions on Sensors and Micromachines

      Volume: 142 Issue: 2 Pages: 29-30

    • DOI

      10.1541/ieejsmas.142.29

    • NAID

      130008149941

    • ISSN
      1341-8939, 1347-5525
    • Year and Date
      2022-02-01
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  • [Journal Article] Fabrication of Metal-Insulator-Metal Nanostructures Composed of Au-MgF2-Au and Its Potential in Responding to Two Different Factors in Sample Solutions Using Individual Plasmon Modes2022

    • Author(s)
      Yamada Hirotaka、Kawasaki Daiki、Sueyoshi Kenji、Hisamoto Hideaki、Endo Tatsuro
    • Journal Title

      Micromachines

      Volume: 13 Issue: 2 Pages: 257-257

    • DOI

      10.3390/mi13020257

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Imprinted Photonic Crystal-Film-Based Smartphone-Compatible Label-Free Optical Sensor for SARS-CoV-2 Testing2022

    • Author(s)
      Kawasaki Daiki、Yamada Hirotaka、Sueyoshi Kenji、Hisamoto Hideaki、Endo Tatsuro
    • Journal Title

      Biosensors

      Volume: 12 Issue: 4 Pages: 200-200

    • DOI

      10.3390/bios12040200

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    • Author(s)
      Kawasaki Daiki、Yamada Hirotaka、Sueyoshi Kenji、Hisamoto Hideaki、Endo Tatsuro
    • Journal Title

      Sensors and Actuators B: Chemical

      Volume: 361 Pages: 131747-131747

    • DOI

      10.1016/j.snb.2022.131747

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      Yamada Hirotaka、Sueyoshi Kenji、Hisamoto Hideaki、Endo Tatsuro
    • Journal Title

      Micromachines

      Volume: 12 Issue: 11 Pages: 1323-1323

    • DOI

      10.3390/mi12111323

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      Endo Tatsuro、Yamada Hirotaka
    • Journal Title

      IEEJ Transactions on Sensors and Micromachines

      Volume: 140 Issue: 12 Pages: 382-383

    • DOI

      10.1541/ieejsmas.140.382

    • NAID

      130007948614

    • ISSN
      1341-8939, 1347-5525
    • Year and Date
      2020-12-01
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      Maeno Kenichi、Patel Bhargav R.、Endo Tatsuro、Kerman Kagan
    • Journal Title

      Micromachines

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 93-93

    • DOI

      10.3390/mi11010093

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      Kawasaki Daiki、Oishi Ryoutarou、Kobayashi Nao、Mizuta Tatsumi、Sueyoshi Kenji、Hisamoto Hideaki、Endo Tatsuro
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Issue: 1 Pages: 16739-16739

    • DOI

      10.1038/s41598-020-73858-8

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      Tatsuro Endo, Hirotaka Yamada, Kenji Yamada
    • Journal Title

      Mivromachines

      Volume: 11 Issue: 10 Pages: 936-936

    • DOI

      10.3390/mi11100936

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      遠藤達郎
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      月刊オプトロニクス

      Volume: 465 Pages: 164-167

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  • [Journal Article] Au &quot;Edged Hole Array&quot; for Sensor Application2019

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      Hirotaka Yamada, Daiki Kawasaki, Chigusa Inoue, Kenichi Maeno, Kenji Sueyoshi, Hideaki Hisamoto, Tatsuro Endo
    • Journal Title

      Journal of Photopolymer Science and Technology

      Volume: 32 Issue: 1 Pages: 101-105

    • DOI

      10.2494/photopolymer.32.101

    • NAID

      130007744377

    • ISSN
      0914-9244, 1349-6336
    • Year and Date
      2019-06-24
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    • Author(s)
      Daiki Kawasaki, Kenichi Maeno, Hirotaka Yamada, Kenji Sueyoshi, Hideaki Hisamoto, Tatsuro Endo
    • Journal Title

      Sensors and Actuators B: Chemical

      Volume: 299 Pages: 126932-126932

    • DOI

      10.1016/j.snb.2019.126932

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    • Author(s)
      Daiki Kawasaki, Hirotaka Yamada, Kenichi Maeno, Kenji Sueyoshi, Hideaki Hisamoto, Tatsuro Endo
    • Journal Title

      ACS Appl. Nano Mater.

      Volume: 2 Issue: 8 Pages: 4983-4990

    • DOI

      10.1021/acsanm.9b00930

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      山田大空,川﨑大輝,井上千種,前野権一,末吉健志,久本秀明,遠藤達郎
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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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