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Creation of hyper-thermostable peptide nanotubes based on the cryo-EM structures

Research Project

Project/Area Number 19K05210
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 28030:Nanomaterials-related
Research InstitutionKobe University

Principal Investigator

Tamura Atsuo  神戸大学, 理学研究科, 准教授 (90273797)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsペプチド / ナノファイバー / 耐熱性 / ヘリックス / ナノチューブ / クライオ電顕 / レアメタル / 耐熱化 / ペプチドナノチューブ
Outline of Research at the Start

申請者の独自技術によって創製してきた機能性人工設計ペプチドナノチューブにクライオ電顕による構造解析法を適用する。得られた非結晶性ナノファイバーの原子レベルでの構造に基いた新たな精密設計を行うことで、超耐熱性という形質を付与する。これにより、常温でほどよく機能するという天然の生体物質の性質を超えて高温高機能となる生体ナノ材料を創製することは可能なのか、という問いに答えるべく研究を推進する。また、このような材料の創製は、生体物質に本来備わっている高い選択性などの高機能を、より高速にさらにはより過酷な条件化で発揮することにつながり、生体機能を新たな局面で発揮させる新技術となることが期待される。

Outline of Final Research Achievements

Cryo-EM can determine the structure of amorphous nanofibers. We have applied this technique to our peptide designing strategy to obtain hyper-thermostability. Several alpha-helical peptides were found to be assembled into nanofibers, resulting in the transition temperature over 130℃. Interestingly, liquid crystal-like cooperative transition was observed for some nanofibers.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

生物中で機能を担っている生体物質であるタンパク質とペプチドは、自然環境や生物中で働くため、通常は10-40℃程度で安定な構造を取っている。高温環境では、一般的にはタンパク質構造が壊れ機能が失われてしまう。この欠点を補うため、タンパク質(ペプチド)分子を規則的に多数集合させてナノファイバーとして非常に高い熱安定性を獲得することに成功し、高温での機能化への道筋をつけることに至った。さらに、分子的には水素結合1つの有無によって、分子集合体の方向が一斉に変化する液晶様現象を生じることから、ペプチド分子集合体の新たな構造転移の発見につながった。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (29 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (24 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Microenvironment pH-Induced Selective Cell Death for Potential Cancer Therapy Using Nanofibrous Self-Assembly of a Peptide Amphiphile2021

    • Author(s)
      Yamamoto Shota、Nishimura Kanon、Morita Kenta、Kanemitsu Sayuki、Nishida Yuki、Morimoto Tomoyuki、Aoi Takashi、Tamura Atsuo、Maruyama Tatsuo
    • Journal Title

      Biomacromolecules

      Volume: 22 Issue: 6 Pages: 2524-2531

    • DOI

      10.1021/acs.biomac.1c00267

    • NAID

      120007168996

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    • Journal Title

      月刊BIO INDUSTRY

      Volume: 38 Pages: 1-8

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    • Author(s)
      Sakurai Haruka、Nishimura Kanon、Yamamoto Shota、Maruyama Tatsuo、Tamura Atsuo
    • Journal Title

      ACS Applied Bio Materials

      Volume: 4 Issue: 3 Pages: 2442-2452

    • DOI

      10.1021/acsabm.0c01407

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      櫻井 遥,田村 厚夫
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  • [Presentation] Designing an α-helical peptide nanofiber with α-β conformational switching ability2019

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      黒川 南,田村 厚夫
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      Joint Annual Meeting of 71st JSCB & 19th PSSJ
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  • [Presentation] Artificially designed peptides that bind rare metals selectively2019

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      飯田 禎弘,田村 厚夫
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      Joint Annual Meeting of 71st JSCB & 19th PSSJ
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  • [Presentation] Trapping and structural analysis of nucleation intermediates aimed at clarifying amyloid nucleation mechanisms2019

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      吉川 祐樹,山本 直樹,井上 倫太郎,杉山 正明,田村 厚夫,茶谷 絵理
    • Organizer
      Joint Annual Meeting of 71st JSCB & 19th PSSJ
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  • [Presentation] Designing artificial peptides that hydrolyze amyloid beta protein2019

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      飯田 禎弘,田村 厚夫
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      第57回日本生物物理学会年会
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  • [Presentation] Artificially designed pH-responsive α helical peptides that damage tumor cells selectively2019

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      櫻井遥,西村香音,山本翔太,丸山達夫,田村厚夫
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      黒川 南,田村 厚夫
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      森下梨佳子,田村厚夫
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  • [Presentation] 亜鉛結合能を持つペプチドの人工設計2019

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      本多紘,田村厚夫
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      櫻井遥,西村香音,山本翔太,丸山達夫,田村厚夫
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  • [Book] 熱量測定・熱分析ハンドブック 第3版 (5.4.6項「タンパク質の低温変性」担当)2020

    • Author(s)
      日本熱測定学会 (田村厚夫分担)
    • Total Pages
      392
    • Publisher
      丸善出版
    • ISBN
      9784621305072
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  • [Patent(Industrial Property Rights)] ペプチド結合切断活性を有する人工ペプチドおよびその利用2021

    • Inventor(s)
      飯田禎弘、田村厚夫
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人神戸大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2021-062637
    • Filing Date
      2021
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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