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Screening of novel beta-peptide hydrolases from metagenomic libraries and their applications for synthesis of functional beta-peptide materials

Research Project

Project/Area Number 19K05576
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 34030:Green sustainable chemistry and environmental chemistry-related
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

Hiraishi Tomohiro  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 専任研究員 (20321804)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywordsβペプチド分解酵素 / 環境メタゲノム / 生分解性物質 / 分解酵素
Outline of Research at the Start

βペプチドは、αペプチドの長所を維持しつつ易分解性を改良した材料であり生体内などでの利用が期待される。申請者が発見したβペプチド分解酵素は、低効率であったがバイオマス由来アスパラギン酸からβポリアスパラギン酸を合成できる。一方、現在使用可能な全ての酵素は、環境中の培養可能な1 %未満の微生物から得られたものであり、残り99 %の微生物資源の有効利用が望まれている。そこで本研究では、環境DNAからメタゲノムライブラリを作製・スクリーニングを行い、難培養微生物由来新規βペプチド分解酵素を獲得する。さらに、βペプチド骨格を有する機能性材料開発を指向した酵素の高性能化・高機能化を目指す。

Outline of Final Research Achievements

The aim of this study is the screening of novel β-peptide hydrolases from metagenomic libraries of environmental samples such as soil and fresh water. For effective screening of the enzymes, biodegradation of the polymer by the environmental samples was carried out and the resultant biofilms generated during the biodegradation were used for construction of metagenomic libraries. The optimum assay conditions for high-throughput-screening of the enzymes using multiple pNP substrates were examined. Functional screens were carried out under the optimum assay conditions and the hydrolysis activity of some clones was higher than that of the negative control cells.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究で標的としているβペプチド分解酵素は希少性が高く、現在得られている知見は限定的である。また、自然界にはβペプチドのみで構成される化合物は存在しないため、βペプチド分解酵素の生理学的・進化的役割は不明である。従って、本研究で得られる知見により、特異な活性であるβペプチド分解活性の発現メカニズムが解明されれば、学術的・社会的意義が非常に高いといえる。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2021 2020 2019 Other

All Journal Article (1 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] ポリアスパラギン酸分解酵素の構造と機能:非天然型β-ペプチドの酵素分解2020

    • Author(s)
      平石知裕
    • Journal Title

      化学と工業

      Volume: 73 Pages: 852-854

    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] QCMと電気化学測定を用いた生分解性ポリマーの分解過程の解析2021

    • Author(s)
      大槻拓馬、竹中康将、平石知裕、阿部英喜、朝倉則行
    • Organizer
      第15回バイオ関連化学シンポジウム
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌由来ラッカーゼ変異体の性質2020

    • Author(s)
      平石知裕、阿部英喜、前田瑞夫
    • Organizer
      第9回 JACI/GSCシンポジウム
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] ポリアスパラギン酸分解酵素の基質認識メカニズム2019

    • Author(s)
      平石知裕、久野玉雄、阿部英喜、前田瑞夫
    • Organizer
      第68回高分子討論大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Recombinant expression of E. coli laccase and its characteristics2019

    • Author(s)
      T. Hiraishi; H. Abe; and M. Maeda
    • Organizer
      IUPAC 47th World Chemistry Congress
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Book] 「生分解性プラスチックの環境配慮設計指針 第5章 ポリアスパラギン酸分解酵素の構造と機能」2019

    • Author(s)
      平石知裕
    • Total Pages
      291
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Remarks] 国立研究開発法人理化学研究所 研究紹介 環境資源科学研究センター バイオプラスチック研究チーム

    • URL

      https://www.riken.jp/research/labs/csrs/bioplastic/index.html

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Remarks] 国立研究開発法人理化学研究所 研究紹介 主任研究員研究室 前田バイオ工学研究

    • URL

      https://www.riken.jp/research/labs/chief/bioeng/

    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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