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Study of amino acid sensing

Research Project

Project/Area Number 19K06668
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 44010:Cell biology-related
Research InstitutionNational Institute for Basic Biology

Principal Investigator

Kamada Yoshiaki  基礎生物学研究所, 多様性生物学研究室, 助教 (20291891)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 松浦 彰  千葉大学, 大学院理学研究院, 教授 (10272692)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords酵母 / アミノ酸 / シグナル伝達 / トア複合体 / 細胞応答 / タンパク質合成 / Tor / プロテインキナーゼ
Outline of Research at the Start

トア複合体1(TORC1)は細胞にとって必須のプロテインキナーゼであり、細胞内アミノ酸センシングを担っている。しかし、TORC1が20種類のアミノ酸すべてを個別にモニターし、活性調節を受ける仕組みは未解明のまま残されている。
申請者は、これまでにtRNAを介したTORC1によるアミノ酸センシングの新規モデルを提唱した(Kamada 2017)。
本研究では、研究代表者は研究分担者と共に、遺伝学的・生化学的手法、そして最新鋭の構造解析やメタボローム解析を駆使して、細胞内アミノ酸センシング機構を分子メカニズムの視点および生理学的な視点から解明し、新規モデルに確証を付与する計画である。

Outline of Final Research Achievements

In this study I investigated the mechanism of Tor complex1 regulation by amino acid signaling. The goal of this study is to establish the novel model of TORC1 regulation by tRNA as an amino acid-starvation signal.
I found that tRNA binds to FRB domain of Tor1 protein. Since FRB domain is known as a rapamycin (a TORC1 specific inhibitor)- binding site, tRNA is supposed to regulate TORC1 activity in a same manner with rapamycin.
Therefore, I analyzed the tRNA-FRB binding using structural biological methods, and molecular biological methods to examine the above model.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

TORC1によるアミノ酸センシング研究において、Sabatiniが提唱する低分子量GTPase Ragを介したTORC1制御モデルが、多くの矛盾点を抱えつつも広く受け入れられている(Bar-Peled, 2013)。しかし、最近多くの疑問が国内外のTOR研究者により呈され、再考を余儀なくされている。本研究により提唱・検証された新規モデルは、TOR研究分野にパラダイムシフトを起こすことが期待される。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2022 2020 2019

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Involvement of Gtr1p in the oxidative stress response in yeast Saccharomyces cerevisiae2022

    • Author(s)
      Sekiguchi Takeshi、Ishii Takashi、Kamada Yoshiaki、Funakoshi Minoru、Kobayashi Hideki、Furuno Nobuaki
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 598 Pages: 107-112

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.02.016

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Novel Links between TORC1 and Traditional Non-Coding RNA, tRNA2020

    • Author(s)
      Otsubo Yoko、Kamada Yoshiaki、Yamashita Akira
    • Journal Title

      Genes

      Volume: 11 Issue: 9 Pages: 956-956

    • DOI

      10.3390/genes11090956

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 出芽酵母トア複合体1とtRNAの相互作用の解析2020

    • Author(s)
      鎌田芳彰
    • Organizer
      第53回酵母遺伝学フォーラム研究報告会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] トア複合体1によるアミノ酸センシングの新規モデル2020

    • Author(s)
      鎌田芳彰
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] tRNAによるトア複合体1の制御機構解明の試み2019

    • Author(s)
      鎌田芳彰
    • Organizer
      第52回酵母遺伝学フォーラム研究報告会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] トア複合体1を介したアミノ酸センシング機構の新規モデル2019

    • Author(s)
      鎌田芳彰
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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