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Analysis of ribosome stress response in plants: mechanisms of stress sensing and signalling system

Research Project

Project/Area Number 19K06714
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 44030:Plant molecular biology and physiology-related
Research InstitutionRikkyo University

Principal Investigator

Horiguchi Gorou  立教大学, 理学部, 教授 (70342847)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 古賀 皓之  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (30783865)
前川 修吾  立教大学, 理学部, 助教 (80711209)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsシロイヌナズナ / リボソーム / リボソームストレス応答 / NAC型転写因子 / E3 ubiquitin ligase / ユビキチンリガーゼ / リボソームストレス / RING finger タンパク質
Outline of Research at the Start

リボソームは細胞内で最も複雑なRNA-タンパク質複合体であり、翻訳を制御する必須の因子である。その生合成は極めて複雑であり、合成エラーがしばしば起きる。これを放置すると、誤翻訳により細胞の恒常性が損なわれると考えられる。動物では、リボソーム生合成異常は、p53を活性化し、細胞周期や細胞死を導くことで、がん化が抑制される仕組み、すなわちリボソームストレス応答が知られているが、植物では、その存在がごく最近になって示されたばかりである。本研究では、リボソームストレス応答に関わる正、負の制御因子を遺伝学的、生化学的に同定し、その作用機構をタンパク質レベルで明らかにすることを目的とする。

Outline of Final Research Achievements

The ribosome is the most complex ribonucleoprotein particle in cells. Due to its complexity, its biogenesis is error-prone and may lead to cytotoxicity. To appropriately handle this potential risk, ribosome stress response plays an important role in animal cells yet a corresponding mechanism in plants has just been emerging. In this study, we investigated ribosome stress response in Arabidopsis thaliana and found that the RING finger protein SZK2 promotes ribosome stress response. We found that SZK2 is a functional E3 ubiquitin ligase and ubiquitinates and destabilizes RPL12. Furthermore we identified SZK2 interactors that act as negative regulators of ribosome stress response. In addition, a C-terminally truncated RPL4D strongly localizes in the nucleolus and can induce ribosome stress response.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

動物のストレス応答のマスター因子であるp53のホモログは植物には存在しない。そのため、植物のリボソームストレス応答の実体はほとんど不明であった。本研究ではRING finger タンパク質であるSZK2がRPL12を基質とするE3 ubiquitin ligaseであり、リボソームストレス応答の正の制御因子として働くことを示した。また、これらの周囲で働くと考えられる多数の因子の同定にも成功した。これらの成果は、植物独自のリボソームストレス応答機構の存在を証明するとともに、植物のストレス応答研究に新たな展開をもたらすものと期待される。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2022 2021 2020 2019 Other

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (10 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The bRPS6-Family Protein RFC3 Prevents Interference by the Splicing Factor CFM3b during Plastid rRNA Biogenesis in Arabidopsis thaliana2020

    • Author(s)
      Nagashima Yumi、Ohshiro Katsutomo、Iwase Akiyasu、Nakata Miyuki T.、Maekawa Shugo、Horiguchi Gorou
    • Journal Title

      Plants

      Volume: 9 Issue: 3 Pages: 328-328

    • DOI

      10.3390/plants9030328

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるプラスチド型および細胞質 型リボソームストレス応答経路の比較解析2022

    • Author(s)
      長嶋 友美,藤井 佑郁,伊藤 早紀,大城 克友,Zhang Ruiyue,前川 修吾,大林 祝, 杉山 宗隆,塚谷 裕一,堀口 吾朗
    • Organizer
      第 63 回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナ IMPDH とリボソームストレスの関係2021

    • Author(s)
      前川 修吾,西川 幾人,堀口 吾朗
    • Organizer
      日本植物学会第 85 回大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Destabilization of RPL12B by ubiquitin ligase SZK2-mediated ubiquitination is required for ribosome stress response2021

    • Author(s)
      前川修吾、五十嵐幹太、深田かなえ、高原正裕、西村奎亮、塚谷裕一、堀口吾朗
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] シロイヌナズナrfc3変異における側根形成異常にはリボソームストレス応答因子SZK1が関与する2020

    • Author(s)
      堀口吾朗、長嶋友美、前川修吾、中田未友希、塚谷裕一
    • Organizer
      日本植物学会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] リボソームストレスシグナル伝達の鍵因子RING型ユビキチンリガーゼSZK2とリボソームタンパク質RPL12Bの関係2020

    • Author(s)
      前川修吾、五十嵐幹太、深田かなえ、高原正裕、西村奎亮、塚谷裕一、堀口吾朗
    • Organizer
      日本植物学会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] プラスチドおよび細胞質リボソームの生合成異常によって引き起こされるストレス応答経路の解析2020

    • Author(s)
      長嶋友美、前川修吾、中田未友希、塚谷裕一、堀口吾朗
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] リボソームストレスシグナル伝達の鍵因子RING型ユビキチンリガーゼSZK2とリボソームタンパク質RPL12Bの役割2020

    • Author(s)
      前川修吾、五十嵐幹太、深田かなえ、高原正裕、西村奎亮、塚谷裕一、堀口吾朗
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] プラスチドタンパク質RFC3欠損変異体の主根伸長阻害の解析2019

    • Author(s)
      長嶋友美、大城克友, 岩瀬晃康、中村栞理、中田未友希、前川修吾、堀口吾朗
    • Organizer
      日本植物形態学会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 植物リボソームストレスのシグナル伝達因子SZK2とRPL12Bの相互作用の意義2019

    • Author(s)
      前川修吾、五十嵐幹太、深田かなえ、高原正裕、塚谷裕一、堀口吾朗
    • Organizer
      日本植物学会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] RFC3とスプライシング因子SPRT2/CFM3bによるプラスチドリボソーム生合成および側根形成制御2019

    • Author(s)
      長嶋友美、大城克友、岩瀬晃康、中村栞理、中田未友希、前川修吾、堀口吾朗
    • Organizer
      日本植物学会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Remarks] 立教大学理学部生命理学科 植物分子発生学研究室ホームページ

    • URL

      https://sites.google.com/rikkyo.ac.jp/rikkyo-horiguchi-lab/home

    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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