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Identification of genes which control seed germination response to temperature and phenology

Research Project

Project/Area Number 19K06729
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 44030:Plant molecular biology and physiology-related
Research InstitutionMeiji University

Principal Investigator

Kawakami Naoto  明治大学, 農学部, 専任教授 (10211179)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 井内 聖  国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 専任研究員 (90312256)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2021: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywords種子 / 発芽 / フェノロジー / 自然変異 / 温度 / 量的遺伝子座 / ゲノム配列解析 / 組換え自殖系統 / ゲノムシークエンス / 遺伝解析 / QTL解析 / 種子発芽 / シロイヌナズナ
Outline of Research at the Start

冬型と夏型のフェノロジーを持つ植物に対照的な発芽の温度反応性をもたらす遺伝子を同定する。このため、シロイヌナズナの自然変異系統を利用したQTL(量的形質遺伝子座)解析を行う。また、既知の発芽制御遺伝子の発現に対する温度の影響を比較解析し、その共通点と相違点を明らかにする。本研究により温度による発芽制御メカニズム、発芽の季節決定に寄与する遺伝子が見出され、適応の分子レベルでの理解、気候変動が発芽に与える影響の予測と対応に寄与すると期待している。

Outline of Final Research Achievements

Summer and winter annual Arabidopsis wild accessions were crossed and analyzed quantitative trait loci (QTLs) which determine seed germination phenotypes at high and low temperature conditions. Our genetic analysis indicated that germination phenotypes at low and high temperature conditions are determined by different QTLs. HTG1 and HTG2 were found as major QTLs for germination at high temperature conditions, and mapped on the bottom arms of chromosomes 5 and 2. We identified 81 candidate genes for HTG1, and we have obtained preliminary data that indicates one of the 81 genes is responsible for germination at high temperature condition.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

種子が発芽する季節は、個体の生存そして次世代の種子生産を左右する。本研究では、発芽時季決定の鍵を握る高温と低温条件での発芽反応が、それぞれ少数の主要遺伝子に支配されることを見出しており、その分子機構解明に大きな進展をもたらすと期待される。温暖化の影響が顕在化しつつある現在、発芽の温度反応性や季節決定に関わる遺伝子の同定としくみの解明に手がかりを与えた意義は大きい。また、作物種子の発芽も温度の影響を強く受け、生産量と品質を大きく左右する。このため、本研究の成果は温暖化に対応した発芽制御技術の開発に繋がるなど、社会的にも大きな意義を持つ。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2022 2021 2020 2019

All Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results)

  • [Presentation] シロイヌナズナ種子発芽の高温反応性を制御する自然変異遺伝子座のマッピング2022

    • Author(s)
      新津 嵩大、渡辺 暢斗、高木 健太郎、永田 果穂、井内 敦子、井内 聖、小林 正智、川上 直人
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナ種子の高温発芽能を左右する自然変異遺伝子座の解析2022

    • Author(s)
      永田果穂、川上直人
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] シロイヌナズナ種子発芽の温度反応性を支配する自然変異遺伝子座の解析2021

    • Author(s)
      渡辺暢斗、清水諒、井内敦子、永田果穂、高木健太郎、井内聖、小林正智、川上直人
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 種子発芽時のジベレリン制御におけるMAPKカスケードの役割2020

    • Author(s)
      大谷真彦、東城僚、鄭李鵬、大森涼葉、田中瑞季、杉本和彦、市村和也、川上直人
    • Organizer
      第61回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 温度による種子発芽の制御には、明暗で異なる因子が働く2020

    • Author(s)
      高山恵里菜、渡邊飛鳥、中澤祐樹、藤茂雄、川上直人
    • Organizer
      第61回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Sdr4-like (SFL) 遺伝子は、シロイヌナズナ種子の発芽と芽生えの発達を正に制御する2020

    • Author(s)
      鄭李鵬、大谷真彦、杉本和彦、川上直人
    • Organizer
      第61回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] シロイヌナズナ野生株における種子発芽の温度反応性の自然変異2019

    • Author(s)
      川上直人、丸山紘輝、重枝 絢、長竹 望、清水 諒、栩内美咲、井内 聖、小林正智
    • Organizer
      日本植物学会第83回大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Distinct Genetic Factors are Responsible for Thermoinhibition of Arabidopsis Seeds in the Light and in the dark2019

    • Author(s)
      Naoto Kawakami, Asuka Watanabe, Yuki Nakazawa, Erina Takayama and Shigeo Toh
    • Organizer
      6th Workshop on the Molecular Aspects of Seed Dormancy and Germination
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Role of MAPK cascade in seed dormancy and germination2019

    • Author(s)
      Masahiko Otani, Ryo Tojo, Lipeng Zheng, Suzuha Omori, Kazuhiko Sugimoto, Kazuya Ichimura, Naoto Kawakami
    • Organizer
      6th Workshop on the Molecular Aspects of Seed Dormancy and Germination
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Genetic analysis of viviparous germination mutant of Arabidopsis thaliana2019

    • Author(s)
      Chihiro Nomura, Natsuki Oonuma, Naoto Kawakami
    • Organizer
      6th Workshop on the Molecular Aspects of Seed Dormancy and Germination
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Role of Autophagy in Germination Performance of Arabidopsis Seeds2019

    • Author(s)
      Erina Takayama, Kohki Yoshimoto and Naoto Kawakami
    • Organizer
      6th Workshop on the Molecular Aspects of Seed Dormancy and Germination
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research

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Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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