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Effects of amino acid sequence and lipids on the structure and self-association of transmembrane helices

Research Project

Project/Area Number 19K07013
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 47020:Pharmaceutical analytical chemistry and physicochemistry-related
Research InstitutionMukogawa Women's University (2021)
Kyoto University (2019-2020)

Principal Investigator

Yano Yoshiaki  武庫川女子大学, 薬学部, 教授 (60402799)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywordsモデル膜貫通ヘリックス / transmembrane helix / シングルペア蛍光測定 / GXXXG配列
Outline of Research at the Start

モデル膜貫通ヘリックスを用いて以下の課題①②に取り組む。①会合モチーフとして知られるGXXXGの周辺配列とコレステロールの組み合わせがヘリックス会合に与える重要性を解明する。独自開発した膜貫通ヘリックス会合測定技術を主な手法として会合・構造測定を行う。また得られた知見の一般性を確かめるため、生細胞膜での膜タンパク質会合挙動も独自開発した手法で測定する。②ヘリックスブレーカーとして知られるプロリンが誘起しうるヘリックス折れ曲がり構造が膜厚によりどのように調節されるか明らかにする。部位特異的に安定同位体標識したヘリックスを用い膜内折れ曲がり構造を詳細に調べる。

Outline of Final Research Achievements

Effects of sequence context around GXXXG and membrane cholesterol on the self-association of helices were investigated to reveal lipid regulation mechanisms of membrane protein functions. The strength of helix association was very sensitive to the lipid composition. Measurements of helix orientation angle and computer prediction of the dimer structure revealed that membrane cholesterol selectively stabilize X-shaped helix dimers. These results demonstrate the significance of membranous force that constraint structure of membrane proteins.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

これまで、膜貫通ヘリックスのアミノ酸配列に着目した研究、二分子膜の脂質組成に着目した研究はそれぞれ行われてきたが、生理的状態を考えると当然研究すべきにもかかわらず、両者の影響を系統的に測定し統合的に解釈するアプローチは皆無だった。本研究では定量性や一般性に優れ、膜内のヘリックス安定性、自己会合力を熱力学量や速度定数として計測できるモデル実験系を活用し、膜貫通ヘリックスの会合・構造のアミノ酸配列・コレステロール依存性のルールを解明した。これまで測定法の欠如、重要性の認知度不足などから無視されることも多かった、脂質による膜タンパク質制御メカニズムの一端を解明できた。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2022 2020 2019 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Effects of Membrane Cholesterol on Stability of Transmembrane Helix Associations2022

    • Author(s)
      Yoshiaki Yano
    • Journal Title

      Chem. Pharm. Bull.

      Volume: in press

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] INTERPLAY BETWEEN AMINO ACID SEQUENCES AND LIPID COMPOSITIONS IN THE GXXXG-MEDIATED SELF-ASSOCIATION OF TRANSMEMBRANE HELICES AS REVEALED BY SINGLE-PAIR FRET2020

    • Author(s)
      矢野義明、森瀬敬之、松崎勝巳
    • Organizer
      第57回ペプチド討論会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Single-Pair FRET measurement of GXXXG-mediated transmembrane helix associations -high sensitivity to the surrounding residues-2019

    • Author(s)
      Takayuki Morise, Yoshiaki Yano, Katsumi Matsuzaki
    • Organizer
      The 11th Seoul-Kyoto-Osaka Joint Symposium on Pharmaceutical Sciences for Young Scientists
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 武庫川女子大学薬学部生命物理化学研究室

    • URL

      https://www.mukogawa-u.info/research/chemistry/post-1327

    • Related Report
      2021 Annual Research Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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