| Project/Area Number |
19K07348
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 48040:Medical biochemistry-related
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2021)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
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| Keywords | 受容体型チロシンホスファターゼ / 軸索再生 / 近位依存性標識 / 基質 / タンパク質相互作用 / 受容体型チロシンフォスファターゼ / オートファジー / 質量分析 / リン酸化 / 近位依存性ビオチン標識法 / プロテオミクス / 脱リン酸化 |
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| Outline of Research at the Start |
受容体型チロシンフォスファターゼ（RPTP)ファミリーはおよそ20の分子からなる。それぞれ特異的なタンパク質のリン酸化チロシンを脱リン酸化し、その基質分子の活性を調節する、いわゆる分子スイッチとして働いている。特に神経系でその重要性が認識されており、研究代表者は、PTPRσと呼ばれるRPTPの基質としてCortactinを同定し、これが軸索再生阻害に繋がることを示した。しかし一般に、RPTPの基質分子の多くが未だ不明のため、創薬などの標的となるには心もとない。
本研究では、近位依存性ビオチン標識法を基盤に、RPTPの基質分子を網羅的に同定する手法の確立を目指す。
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| Outline of Final Research Achievements |
In this study, I aimed to establish a method for the comprehensive identification of substrates of receptor-type tyrosine phosphatases (RPTPs). In particular, we focused on PTPσ, a member of the RPTP family that is involved in the inhibition of axon regeneration in the central nervous systems. I applied a proximity-dependent ligation assay to identify the interacting molecules for PTPσ. As a result, approximately 100 proteins were identified as PTPσ interactors. This list included already-known interactors such as Liprin-α and Trio. Among these molecules, those involved in axon elongation were validated for their tyrosine phosphorylation and dephosphorylation by PTPσ. Together, a proximity-dependent ligation assay seems to be a powerful tool for the comprehensive identification of substrates for RPTP.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
近位依存性標識法を用いることにより、これまでに困難であったRPTPの基質同定を簡便に行うことができることを示した。既知分子も再現性よくフォローされており、本手法は信頼性も十分に担保されている。これまでにRPTPは神経疾患やがん、炎症性疾患や代謝性疾患に関与していることが報告されている。ヒト疾患において標的とするには、基質分子の不明瞭さが律速段階になっていたが、本手法の利用により、RPTPのバイオロジーの理解につながることが期待できる。
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