| Project/Area Number |
19K07766
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
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| Research Institution | Research Institute for Clinical Oncology Saitama Cancer Center (2023-2024)
Showa University (2021-2022)
Japanese Foundation for Cancer Research (2019-2020) |
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Principal Investigator |
Yoshida Reiko 地方独立行政法人埼玉県立病院機構埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 病院 遺伝科, 科長兼診療部長 (10421166)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
森 誠一 公益財団法人がん研究会, がんプレシジョン医療研究センター 次世代がん研究シーズ育成プロジェクト, プロジェクトリーダー (10334814)
上野 貴之 公益財団法人がん研究会, 有明病院 乳腺外科, 部長 (40452362)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2025-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2024)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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| Keywords | BRCAness / HRD / HBOC / MGPT / VUS / 遺伝性乳がん / Cascade screening / 乳がん / 相同組み換え修復不全 / PARP阻害剤 |
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| Outline of Research at the Start |
遺伝性乳がん卵巣がん（HBOC）にはBRCA1/2以外のHR関連遺伝子群が存在し、それらの遺伝子のバリアントはVUSであることが多く、変異を有する人に生じた腫瘍が、BRCA1/2腫瘍と類似の表現型を示す“BRCAness”、を示すのかは不明である。本研究の目的は、相同組換え修復（HR）関連遺伝子にゲノム異常を認める乳がんの『遺伝型』と、臨床像・ゲノム全体の変化などの乳がんの『表現型』の相関を検討し、HR関連遺伝子の病的意義不明（VUS）の病原性予測と、乳がんのPARP阻害剤などの薬物療法の効果予測を行うことを目的としている。
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| Outline of Final Research Achievements |
We investigated the correlation between breast cancer genotypes and phenotypes of homologous recombination repair (HR)-related genes, which are causative genes of hereditary breast and ovarian cancer (HBOC), established a BRCAness prediction model, predicted the pathogenicity of variants of unknown significance (VUS) in HR-related genes, and reported the results in a paper. This statistical model of BRCAness was constructed using Lasso logistic regression by comparing 116 genomic parameters obtained from breast cancer exome analysis with 37 BRCA1/2 biallelic loss pair samples as positive controls and 32 homologous recombination repair intact pair samples as negative controls. As a result, five VUS were reclassified.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
HBOCの最も代表的な原因遺伝子はBRCA1とBRCA2であり、その腫瘍はHRDを示し、PARP阻害剤やプラチナ製剤に高感受性であることが知られている。近年HBOCにはBRCA1/2以外の HR関連遺伝子が多く存在することが明らかになっているが、それらの遺伝子のバリアントは、データの蓄積が乏しいためVUSが多く検出されており、その腫瘍のHRDや薬剤感受性などの表現型は不明である。バリアントのVUS病原性予測にゲノムの表現型であるBRCAnessを用いることは、臨床の遺伝診療において有用な指標となる可能性がある。
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