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Search for new rubber-degrading enzymes produced by fungi and analysis using organic chemical methods

Research Project

Project/Area Number 19K12389
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 64020:Environmental load reduction and remediation-related
Research InstitutionKanto Gakuin University

Principal Investigator

Shimizu Yumi  関東学院大学, 理工学部, 教授 (50725124)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 香西 博明  関東学院大学, 理工学部, 教授 (00272089)
清水 公徳  東京理科大学, 先進工学部生命システム工学科, 教授 (40345004)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywords白色腐朽菌 / ゴム分解 / 遺伝子クローニング / ゴム資化真菌 / ゴム分解関連遺伝子 / クローニング / ゴム分解物 / 担子菌 / リグニン分解酵素 / リパーゼ / 担子菌類 / 酵素 / ゴム分解酵素 / 菌類
Outline of Research at the Start

近年、地球温暖化対策と自然界の物質循環に適合する社会の構築が求められており、廃ゴムの原型加工利用による有効で、かつ環境負荷の少ない分解技術の開発が進められている。このような背景から、廃ゴムの原型加工利用による、有効かつ環境負荷の少ないリサイクル技術の開発のために、本研究では、加熱・加圧することなく分解反応を触媒する「酵素」に着目した。昨年までに、我々はゴムを炭素源として利用する真菌(ゴム資化真菌)からゴム資化に関与する候補となる遺伝子群を同定した。本研究では、これら遺伝子群の機能解析を行い、ゴム代謝メカニズムを解明することにより、ゴムを効率よく分解する酵素群、反応条件等を明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

(1) Two rubber assimilation fungi were used. We searched for genes with a particularly high expression level and a signal peptide sequence when these fungi were cultured in a rubber medium. As a result, 27 genes were identified in H. marmoreus and 30 genes were identified in Phanerochaete sp. These genes were introduced into basidiomycete yeast. Protein sample preparation was simplified by having yeast synthesize the protein and secrete it extracellularly.
(2) From the structural analysis of the rubber sample, SBR or IR which were treated by these fungi, it was confirmed that a hydroxyl group was added to SBR and IR fragmentation occurred.
(3) The amino acid sequence of a part of the extracellular lipase of yeast that produces extracellular lipase was determined. Three genes encoding this amino acid sequence were obtained.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

SBR、IRの合成ゴムを分解する白色腐朽菌を2菌種得た。これらの菌を応用すれば、環境負荷の少ない廃ゴム処理方法を見出せる可能性がある。また、SBRとIRの分解物の同定を現在試みている。分解物の分子量は100以上のものであり、構造式が明らかになれば加工利用する方法も具体化する。
低温でも活性があり、細胞外分泌性のリパーゼの同定を試みた。本酵素をコードすると予想される遺伝子を3遺伝子まで絞りこんだ。本酵素は脂質を分解することを確認しているが、ゴム分解への関与が明らかになれば、低い温度でも酵素活性が高いため、油による海洋汚染の浄化はもちろん、海洋プラスチック汚染に対応できることが期待される。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 2 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] A capsule-associated gene of Cryptococcus neoformans, CAP64, is involved in pH homeostasis2021

    • Author(s)
      Imanishi-Shimizu Yumi、Kamogawa Yukina、Shimada Yukino、Shimizu Kiminori
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 167 Issue: 6 Pages: 1-11

    • DOI

      10.1099/mic.0.001029

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A capsule-associated gene of Cryptococcus neoformans, CAP64, is involved in pH homeostasis2021

    • Author(s)
      Yumi Imanishi-Shimizu, Yukina Kamogawa, Yukino Shimada, Kiminori Shimizu
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: -

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effects of White Rot Fungus <i>Physisporinus</i> sp., Isolated in Japan, on Styrene-butadiene Rubber2020

    • Author(s)
      SHIMIZU Yumi、SATHO Shuma、NAKAJIMA Taro、KOUZAI Hiroaki、SHIMIZU Kiminori
    • Journal Title

      NIPPON GOMU KYOKAISHI

      Volume: 93 Issue: 9 Pages: 289-292

    • DOI

      10.2324/gomu.93.289

    • NAID

      130007940396

    • ISSN
      0029-022X, 1884-0442
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Wickerhamomyces psychrolipolyticus f.a., sp. nov., a novel yeast species producing two kinds of lipases with activity at different temperatures2020

    • Author(s)
      Shimizu Yumi、Konno Yusuke、Tomita Yosuke
    • Journal Title

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology

      Volume: 70 Issue: 2 Pages: 1158-1165

    • DOI

      10.1099/ijsem.0.003894

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Heparinase gene homolog is essential for the DBB staining reaction in Crypotococcus neoformans2020

    • Author(s)
      Shimizu Yumi, Sugawara Yuko
    • Journal Title

      The Journal of Technological Researches. Society of Science and Engineering/Architecture and Environmental Design, Kanto Gakuin University.

      Volume: 63 Pages: 5-12

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      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 日本産の Cladonia ramulosa は Cladonia rei か? ITS領域からの示唆2020

    • Author(s)
      小竹ひとみ, 原田浩, 坂田歩美, 今西(清水)由巳, 清水公徳
    • Journal Title

      Lichenology

      Volume: 18 Pages: 45-50

    • NAID

      40022219901

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      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 利尻産酵母 Wickerhamomyces psychrolipolyticus が産生する細胞外分泌性リパーゼ2021

    • Author(s)
      老川玲海, 鈴木大貴, 清水由巳
    • Organizer
      2021年度関東学院大学理工/建築・環境学会研究発表講演会
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      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] ラテックスゴム分解菌の探索と分解産物の検出2019

    • Author(s)
      中島太郎 川村真由 青木大輝 佃雅俊 高橋弘喜 香西博明 清水公徳 清水由巳
    • Organizer
      第63回日本菌学会大会
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  • [Presentation] Heparinase遺伝子ホモログは Cryptococcus neoformansのDBB染色に必須である2019

    • Author(s)
      桶川 直実 清水 由巳
    • Organizer
      第 63 回日本医真菌学会総会・学術集会
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  • [Presentation] Cryptococcus neoformans 莢膜合成関連遺伝子CAP64の細胞内酸性ホメオスタシスの維持への関与2019

    • Author(s)
      上﨑竜一 清水由巳
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      第 63 回日本医真菌学会総会・学術集会
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  • [Presentation] 真菌のゴム資化とリグニン分解酵素との関与2019

    • Author(s)
      佐藤脩真 中島太郎 香西博明 清水由巳
    • Organizer
      第9回CSJ化学フェスタ2019
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  • [Presentation] 白色腐朽菌を用いた合成ゴムの酵素分解挙動2019

    • Author(s)
      佐藤脩真 中島太郎 川村真由 香西博明 清水由巳
    • Organizer
      マテリアルライフ学会 第24回春季研究発表会
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      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Identification of a sulfur amino acid biosynthetic gene in Cryptococcus neoformans2019

    • Author(s)
      ニュエンフンタオ 東江昭夫 今西(清水)由巳 清水公徳
    • Organizer
      第 63 回日本医真菌学会総会・学術集会
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      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 担子菌酵母Cryptococcus neoformansのGLH1タンパク質の局在解析2019

    • Author(s)
      関根祐美 今西由巳 清水公徳
    • Organizer
      第63回日本菌学会大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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