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The relevance of the membrane dynamics of ceramide 1-phosphate in the activation of cytosolic phospholipase A2

Research Project

Project/Area Number 19K15707
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 37020:Chemistry and chemical methodology of biomolecules-related
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

Yasuda Tomokazu  大阪大学, 大学院理学研究科, 特任助教(常勤) (90771121)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywordsセラミド-1-リン酸 / 細胞質型ホスホリパーゼA2 / 蛍光寿命測定 / 表面プラズモン共鳴法 / 動的挙動解析 / 分子認識機構 / 類縁体合成
Outline of Research at the Start

細胞膜上に局所的に分布するセラミド-1-リン酸(C1P)が、どのようにして細胞質型ホスホリパーゼA2 (cPLA2α)と特異的に結合するのか、その分子基盤の解明を目指す。そのために、構造改変したC1P類縁体を化学合成し、多様な計測手法を用いて、人工膜や細胞膜におけるC1PおよびcPLA2αとの複合体の動的挙動や相互作用を原子レベルで観測する。これらを統合的に解析することによって、C1Pの挙動秩序と生理機能の関係の理解が深まることが期待される。

Outline of Final Research Achievements

Ceramide 1-phosphate (C1P) is a lipid mediator that specifically binds and activates cytosolic phospholipase A2α (cPLA2α). In this study, we prepared C1P analogues containing modifications in the hydrophilic parts of the structure and subjected them to fluorescence spectroscopy using trans-parinaric acid and SPR, to elucidate both the properties of segregated C1P domains and the affinity of cPLA2α in different lipid environments. These results indicate that the alteration of membrane properties by C1P domain formation drives the molecular recognition of the membrane, through specific binding between the C1P structure and the basic residues of cPLA2α, which leads to increased membrane affinity for and activation of cPLA2α.
This study highlights the important role of trace lipid mediators present in biomembranes in local domain formation and their involvement in biological functions.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は、リガンドである脂質の原子レベルの動的情報を基軸とした新たな解析アプローチによって、生体内で微量脂質として含まれる脂質メディエーターの機能にも膜動態が重要な役割を果たしていることを示すことができた。このアプローチは、多くの生理機能や疾患に関与するタンパク質の活性を調節する膜脂質分子の分子認識機構研究へも展開することが可能であり、タンパク質の脂質結合部位をターゲットとした有効な薬剤開発など医薬化学分野の応用面にも大きく寄与することが期待される。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2022 2021 2019 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Int'l Joint Research] Abo Akademi University(フィンランド)

    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Journal Article] Lateral Segregation of Palmitoyl Ceramide-1-Phosphate in Simple and Complex Bilayers2019

    • Author(s)
      Al Sazzad Md. Abdullah、Yasuda Tomokazu、Nyholm Thomas K.M.、Slotte J. Peter
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: 117 Issue: 1 Pages: 36-45

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2019.05.015

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 細胞質型ホスホリパーゼA2活性化に寄与するセラミド1-リン酸の膜動態解析2022

    • Author(s)
      植浦 大貴、中込 まどか、花島 慎弥、安田 智一、村田 道雄
    • Organizer
      日本化学会第102春季年会(2022)
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] セラミド-1-リン酸の動態解析に基づくホスホリパーゼA2 分子認識機構の解明2021

    • Author(s)
      安田 智一、植浦 大貴、中込 まどか、花島 慎弥、J. P. Slotte、村田 道雄
    • Organizer
      第15回スフィンゴテラピィ研究会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Dynamic behavior of ceramide-1-phosphate in lipid bilayers examined by fluorescence lifetime measurement2019

    • Author(s)
      Tomokazu Yasuda, J. Peter Slotte
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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