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Development of a chemical probe for single-cell imaging of FAO pathway and the mechanism of alternation of FAO activity

Research Project

Project/Area Number 19K15715
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 37030:Chemical biology-related
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

Uchinomiya Shohei  九州大学, 薬学研究院, 助教 (10770498)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords蛍光イメージング / 代謝経路 / 脂肪酸β酸化 / ケミカルバイオロジー / 脂肪酸ベータ酸化 / ケミカルプロテオミクス / 代謝不均一性 / ケモプロテオミクス
Outline of Research at the Start

疾病での代謝変化の解明は、疾病機構の理解や創薬に重要である。最近では特に細胞ごとの代謝不均一性を解明することが重要と指摘されているが、広く用いられている同位体標識化合物と質量分析を組み合わせた解析法では、全細胞集団の平均化された情報しか得られないという問題点がある。本研究では、標的代謝が活性化した細胞での特異的なプロテオミクスと蛍光イメージングを相補的に行う新しいケミカルツールを開発し、代謝不均一性の可視化とその制御タンパク質を解明する。標的代謝にはエネルギー生産に重要な脂肪酸β酸化を選択し、β酸化が関連する疾病での不均一性の解明を目指す。

Outline of Final Research Achievements

It is widely recognized that activities of various metabolic pathways are altered in diseases such as cancer. Therefore, development of chemical probes for measuring activities of metabolic pathways is keenly desired for understanding of disease mechanisms and drug development. In this research, we have developed a new chemical probe for detection of fatty acid beta oxidation (FAO), an important metabolic pathway for energy generation. Using this probe, it was successfully achieved to fluorescently visualize FAO activity in cultured cells and mouse liver tissue. We will apply our probe for chemical proteomics to investigate the alternation of proteome upon the change of FAO activity in cultured cells and mouse liver tissue.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ガンを始め様々な疾病では代謝活性が大きく変化しているため、標的代謝経路の活性変化を検出する手法の開発は疾病メカニズムの理解や創薬研究に重要である。しかし、従来の同位体標識化合物を用いた測定では細胞集団の平均値しか得られず、代謝研究において重要な不均一性を検出することは困難である。本研究で開発したケミカルプローブはエネルギー生産に重要な脂肪酸β酸化経路を一細胞レベルで蛍光検出可能であり、培養細胞のみならずマウス肝臓サンプルでもβ酸化経路を検出可能であった。今後は本プローブを用いてβ酸化活性変化に伴うプロテオーム変化を解析することで、様々な疾病でのβ酸化が果たす役割を詳細に解析できると期待される。

Report

(3 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2020 2019 Other

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Trimethyl-Substituted Carbamate as a Versatile Self-Immolative Linker for Fluorescence Detection of Enzyme Reactions2020

    • Author(s)
      Nakamura Noriaki、Uchinomiya Shohei、Inoue Kazuya、Ojida Akio
    • Journal Title

      Molecules

      Volume: 25 Issue: 9 Pages: 2153-2153

    • DOI

      10.3390/molecules25092153

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Fluorescence detection of metabolic activity of the fatty acid beta oxidation pathway in living cells2020

    • Author(s)
      Uchinomiya Shohei、Matsunaga Naoya、Kamoda Koichiro、Kawagoe Ryosuke、Tsuruta Akito、Ohdo Shigehiro、Ojida Akio
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 56 Issue: 20 Pages: 3023-3026

    • DOI

      10.1039/c9cc09993j

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Electron Microscopic Detection of Single Membrane Proteins by a Specific Chemical Labeling2019

    • Author(s)
      Tabata Shigekazu、Jevtic Marijo、Kurashige Nobutaka、Fuchida Hirokazu、Kido Munetsugu、Tani Kazushi、Zenmyo Naoki、Uchinomiya Shohei、Harada Harumi、Itakura Makoto、Hamachi Itaru、Shigemoto Ryuichi、Ojida Akio
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 22 Pages: 256-268

    • DOI

      10.1016/j.isci.2019.11.025

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Optimized Reaction Pair of the CysHis Tag and Ni(II)-NTA Probe for Highly Selective Chemical Labeling of Membrane Proteins2019

    • Author(s)
      N. Zenmyo, H. Tokumaru, S. Uchinomiya, H. Fuchida, S. Tabata, I. Hamachi, R. Shigemoto, A. Ojida
    • Journal Title

      Bull. Chem. Soc. Jpn.

      Volume: 92 Issue: 5 Pages: 995-1000

    • DOI

      10.1246/bcsj.20190034

    • NAID

      130007649762

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] ケミカルプローブによる生体組織での脂肪酸β酸化イメージング2020

    • Author(s)
      9.内之宮祥平,永浦智樹,松永直哉,Weber Mark,井上和哉,大戸茂弘,王子田彰夫
    • Organizer
      第14回バイオ関連化学シンポジウム(オンライン)
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 蛍光プローブを用いたβ酸化の生細胞イメージング2020

    • Author(s)
      井上和哉, 坂本茉莉, 内之宮祥平, 王子田彰夫
    • Organizer
      第14回バイオ関連化学シンポジウム(オンライン)
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  • [Presentation] 細胞内代謝経路を解明するケミカルツールの開発2020

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      内之宮祥平,Mark Weber, 松永直哉, 大戸茂弘, 王子田彰夫
    • Organizer
      日本薬学会第140年会
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      2019 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] ケミカルプローブによる代謝経路の解析(1) 生体組織での脂肪酸β酸化を目指したキノンメチド放出型プローブの開発2020

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      井上和哉,ウェーバーマーク,永浦智樹,内之宮祥平,王子田彰夫
    • Organizer
      日本化学会第100春季年会
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  • [Presentation] ケミカルプローブによる代謝経路の解析(2): キノンメチド放出型β酸化検出プローブの構造検討と機能評価2020

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      永浦智樹,井上和哉,ウェーバーマーク,内之宮祥平,王子田彰夫
    • Organizer
      日本化学会第100春季年会
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  • [Presentation] ケミカルプローブによる代謝経路の解析(3):尿素回路内アルギナーゼ検出蛍光プローブの開発2020

    • Author(s)
      鴨田光一郎, 内之宮祥平,王子田彰夫
    • Organizer
      日本化学会第100春季年会
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  • [Presentation] 蛍光プローブを用いた細胞内フマル酸検出法の開発2020

    • Author(s)
      得丸祥貴,内之宮祥平,王子田彰夫
    • Organizer
      日本化学会第100春季年会
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      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Live-cell imaging of activity of fatty acid beta oxidation pathway with a fluorescent probe2019

    • Author(s)
      Shohei Uchinomiya
    • Organizer
      10th Joint RSC-CSJ Symposium
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      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 小分子プローブを用いた脂肪酸β酸化経路活性の生細胞蛍光イメージング2019

    • Author(s)
      内之宮祥平, 松永直哉, 鴨田光一郎, 大戸茂弘, 王子田彰夫
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第14回年会
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      2019 Research-status Report
  • [Presentation] TEMイメージングを目指したリアクティブタグシステムの開発2019

    • Author(s)
      善明直輝、得丸祥貴、田畑栄一、内之宮祥平、重本隆一、王子田彰夫
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第14回年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] イメージングとケミカルプロテオミクスによる脂肪酸β酸化解析用ケミカルツールの開発2019

    • Author(s)
      内之宮祥平, Weber mark, 永浦智樹, 王子田彰夫
    • Organizer
      第13回バイオ関連化学シンポジウム2019
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 細胞代謝を解析するケミカルツール群の開発2019

    • Author(s)
      内之宮祥平
    • Organizer
      新学術領域「分子夾雑の生命化学」第2回関東地区シンポジウム
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Remarks]

    • URL

      https://www.phar.kyushu-u.ac.jp/topics/view.php?S_Publ_Year=&word=&page=2&B_Code=496

    • Related Report
      2020 Annual Research Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2022-01-27  

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