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Analysis of how the biofilm supplies nitrogen source to leaves of seagrass (Thalassia hemprichii)

Research Project

Project/Area Number 19K16236
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 45040:Ecology and environment-related
Research InstitutionNihon University

Principal Investigator

TSUCHIYA Yuki  日本大学, 生物資源科学部, 講師 (10636806)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywordsバイオフィルム / リュウキュウスガモ / 窒素源 / 植物ホルモン / 殺藻細菌 / アマモ / 窒素固定 / アンモニウムイオン / 窒素吸収 / 16S rRNA遺伝子 / イオン濃縮 / 次世代シークエンス / パスウェイ / 硝化 / ショットガンメタゲノム
Outline of Research at the Start

アマモは沿岸域の海水中に見られる植物で、その群落は、貝や小魚など様々な生物の棲みかあるいは餌場として、沿岸域の生態系を支えていると考えられている。近年、アマモが根からのみでなく葉からも多くの栄養(主に窒素源)を取り込み利用していることが解ってきた。アマモの葉表面には微生物がバイオフィルムを形成しており、このバイオフィルムがアマモの栄養吸収や生長に関与している可能性がある。本研究では、バイオフィルムおよびバイオフィルム内の微生物による栄養分の保持・変換(窒素固定や硝化等)およびアマモへの供給メカニズムを明らかにし、失われつつあるアマモ群落の再生に役立つ知見を得ることを目指す。

Outline of Final Research Achievements

In this study, I analyzed the mechanism of nitrogen supply to seagrass (Thalassia hemprichii) by biofilm (BF) formed on the surface of seagrass leaves. The seagrasses planted in the aquarium were used for microbial isolation and metagenomic analysis in the BF. The genetic and physiological analyses of the microbial strains and the pathway analysis of the metagenomic sequence revealed 1) the potential activities of assimilatory nitrate reduction and amino acid metabolism and 2) the presence of algicidal bacteria and auxin-producing bacteria in the BF. The results suggest that microbes in the BF supply seagrass leaves with NH4+ and auxin, derived from algal lysis and/or transformations of nitrogen compounds, leading to promoting plant growth.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

リュウキュウスガモを含めたアマモ類は沿岸域生態系において水浄化や生物多様性維持などの重要な役割を担うとともに、ブルーカーボンの一部として地球温暖化防止の鍵を握る植物である。陸上植物においてはその成長への微生物の関与がよく研究されており、実際に微生物を植物の栽培に応用している例があるが、水中植物についてはまだ報告が少ない。本研究の結果は、陸上植物の根でよく見られるような植物―微生物間相互作用が、アマモの場合は葉でも起こり得ることを示す。これは、水中植物の生態に関する新しい知見となるだけでなく、近年急激に減少しているアマモ群落の維持、再生に葉表面の微生物が応用できる可能性を示すものである。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2022 2021 2019

All Presentation (4 results)

  • [Presentation] リュウキュウスガモ(Thalassia hemprichii)の葉表面におけるオーキシン生産菌の群集構造と機能の解析2022

    • Author(s)
      横山潮、土屋雄揮、中川達功、高橋令二
    • Organizer
      日本微生物生態学会第35回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] リュウキュウスガモ(Thalassia hemprichii)の葉表面に棲息する微生物の機能解析2021

    • Author(s)
      土屋雄揮、横山潮、中川達功、高橋令二
    • Organizer
      日本微生物生態学会第34回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] アマモ葉表面に形成されたバイオフィルム内の微生物群集構造の解析2019

    • Author(s)
      土屋 雄揮 , 村中 優紀 , 中川 達功 , 高橋 令二
    • Organizer
      微生物生態学会第33回大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] ショットガンメタゲノム解析による厚岸湖アマモ群落の底泥における亜酸化窒素還元微生物の 群集構造解析2019

    • Author(s)
      中川 達功 , 石川 直央也 , 須藤 健吾 , 森川 翠 , 宮本 優貴 , 神宮寺 賢 , 冨澤 璃乃 , 土屋 雄揮 , 上田 眞吾 , 福井 学 , 高橋 令二
    • Organizer
      微生物生態学会第33回大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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