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Analysis between RNA modification and pathogenesis in myelodysplastic syndromes

Research Project

Project/Area Number 19K16988
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 52010:General internal medicine-related
Research InstitutionInternational University of Health and Welfare

Principal Investigator

Shibuta Tatsuki  国際医療福祉大学, 福岡保健医療学部, 講師 (20799192)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywords骨髄異形成症候群 / RNA修飾 / NGS解析
Outline of Research at the Start

高齢化に伴い生じる造血器腫瘍に対する早期診断および治療は非常に困難であり,現在の日本において大きな課題の1つである。骨髄異形成症候群は年間5,000例以上が発症する造血器腫瘍で,その多くは60歳以上の高齢者で増加傾向にある。
本研究においては骨髄異形成症候群の細胞内で生じるRNA修飾異常に焦点を当て次世代シーケンサーを用いた解析を実施し,さらに修飾酵素の変異・タンパク発現解析を行う。
高齢者における造血器腫瘍の早期発見,身体的負担の少ない継続治療可能な診断法および薬剤の開発を目指す。

Outline of Final Research Achievements

Cytosine methylation in mRNA and RNA methyltransferases in myelodysplastic syndrome (MDS) were analyzed. Compared to CD34-positive cells, MDS cells showed increased expression of transcription factors and granulocyte lineage-specific genes, and increased methylated cytosine in the untranslated region. In addition, NSUN2, which is a RNA methyltransferase, was highly expressed in MDS cells, and its expression level was involved in cell proliferatin.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

MDSには芽球比率による病期が存在するが、NSUN2 mRNAがMDSでの病期を推測するための病態進展マーカーとして有用となり、侵襲性の高い検査の回避や検査者の習熟が必要な形態診断を補助できる可能性が高い。
またNSUN2阻害剤によりMDSの進展を抑制できる可能性があり、今後さらに検討する必要がある。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (15 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] Pre-Analytical Modification of Serum miRNAs: Diagnostic Reliability of Serum miRNAs in Hemolytic Diseases2021

    • Author(s)
      Yukichi Takada, Tatsuki Shibuta, Mayu Hatano, Kenichi Sato, Mari Koga, Ayaka Ishibashi, Tetsuhiro Harada, Takashi Hisatomi, Hanae Shimura, Noriyasu Fukushima, Kamonlak Leecharoenkiat,Supat Chamnanchanunt, Saovaros Svasti, Suthat Fucharoen and Tsukuru Umemura
    • Journal Title

      J. Clin. Med.

      Volume: 10 Issue: 21 Pages: 692008-692008

    • DOI

      10.3390/jcm10215045

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 血中マイクロRNA解析に及ぼすPre-analytical因子の検討2021

    • Author(s)
      梅村 創, 南 杜萌,髙田 勇吉,澁田 樹, 佐藤 謙一
    • Organizer
      国際医療福祉大学学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Direct RNA-seqを用いた腫瘍細胞中RNA修飾の解明(第二報)2021

    • Author(s)
      澁田 樹
    • Organizer
      国際医療福祉大学学会
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      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 血清マイクロ RNA 解析による新型コロナウイルス感染症(COVID-19)重症度マーカーの開発2021

    • Author(s)
      南 杜萌,佐藤 謙一,髙田 勇吉,澁田 樹,安田 聖子, 富安 聡,香月 耕多,永沢 善三,若松謙太郎,梅村 創
    • Organizer
      日本臨床検査医学会
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      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 子宮体癌の早期発見に有用な特異的microRNAの同定および機能解析2021

    • Author(s)
      丸岡 恵利奈, 富安 聡, 澁田 樹, 髙田 勇吉, 佐藤 謙一, 梅村 創, 太田 昭一郎
    • Organizer
      日本臨床化学会
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      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 循環細胞外小胞のアレイ解析の疾患バイオマーカーへの応用2020

    • Author(s)
      梅村 創, 高田 勇吉, 澁田 樹, 廣岡 良隆
    • Organizer
      国際医療福祉大学学会
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Direct RNA-seqを用いた腫瘍細胞中RNA修飾の解明2020

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      澁田 樹
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      国際医療福祉大学学会
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      2020 Research-status Report
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    • Author(s)
      佐藤 謙一, 若松 謙太郎, 片平 雄之, 香月 耕多, 澁田 樹, 富安 聡, 高田 勇吉, 永沢 善三, 梅村 創
    • Organizer
      日本臨床検査医学会
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Ⅱ型糖尿病患者における血清マイクロRNAの解析2020

    • Author(s)
      髙田 勇吉, 澁田 樹, 石橋 郁佳, 古賀 眞理, 小野 恭裕, 廣岡 良隆, 梅村 創
    • Organizer
      日本臨床検査医学会
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Masson trichrome染色におけるクロム酸フリー時間短縮法の検討2020

    • Author(s)
      大塚 百華, 富安 聡, 四丸 知弥, 澁田 樹, 宿谷 賢一, 大田 喜孝, 三宅 康之, 佐藤 信也
    • Organizer
      日本医学検査学会
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] クロム酸フリーazan染色における時間短縮法の検討2020

    • Author(s)
      富安 聡, 大塚 百華, 四丸 知弥, 澁田 樹, 宿谷 賢一, 大田 喜孝, 三宅 康之, 佐藤 信也
    • Organizer
      日本医学検査学会
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Interaction via exosome miRNAs between myelodysplatic cell and normal Treg.2019

    • Author(s)
      Tatsuki Shibuta, Yukichi Takada, Tsukuru Umemura
    • Organizer
      International Society for Extracellular Vesicles
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    • Int'l Joint Research
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    • Author(s)
      Yukichi Takada, Tatsuki Shibuta, Tsukuru Umemura
    • Organizer
      International Society for Extracellular Vesicles
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      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
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    • Author(s)
      澁田 樹, 清水 穂乃香, 富安 聡,佐藤 謙一,梅村 創
    • Organizer
      日本臨床検査医学会
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      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 表面プラズモンイメージングによる細胞外小胞(EV)解析2019

    • Author(s)
      髙田 勇吉,澁田 樹,古賀 眞理, 石橋 郁佳, 小野 恭裕,廣岡 良隆,梅村 創
    • Organizer
      日本臨床検査医学会
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      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Nanopore SequencerによるHOXA9 splicing variantの検出2019

    • Author(s)
      澁田 樹
    • Organizer
      国際医療福祉大学学会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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