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Detection of tumor-specific antigen of highly prevalent angiosarcoma in Okinawa by comprehensive transcriptome analysis

Research Project

Project/Area Number 19K21277
Project/Area Number (Other) 18H06168 (2018)
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund (2019)
Single-year Grants (2018)
Review Section 0901:Oncology and related fields
Research InstitutionUniversity of the Ryukyus

Principal Investigator

UTSUMI DAISUKE  琉球大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (40551958)

Project Period (FY) 2018-08-24 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords血管肉腫 / バイオインフォマティクス / 次世代シーケンサ / 免疫チェックポイント阻害剤 / SIRPα / CD47 / 頭部血管肉腫 / 沖縄 / トランスクリプトーム解析 / 腫瘍特異蛋白 / ドライバー遺伝子変異 / ドライバー / 遺伝子変異
Outline of Research at the Start

これまでに、多数の頭部血管肉腫の臨床検体を用いたトランスクリプトーム解析を行った報告はなく、頭部血管肉腫の好発地域である沖縄の地理的特性を活かした研究である。教室内に蓄積された血管肉腫のトランスクリプトームデータと多岐に渡る癌腫や正常組織のパブリックデータベースを用い包括的な遺伝子発現比較を行うことができ、精度の高い頭部血管肉腫組織の特異抗原や変異分子の探索が見込める。腫瘍組織の網羅的遺伝子発現プロファイルの取得だけではなく、腫瘍組織の遺伝子変異情報を得ることがでる。頭部血管肉腫のドライバー遺伝子の探索や病態機序の解明を目指す。

Outline of Final Research Achievements

We performed differential gene expression analysis between angiosarcoma tumor samples obtained from 5 long-term survivors (> 3 years) and 4 short survivors (< 1 year) based on the transcriptome data. RNA extracted from FFPE samples were used for the transcriptome analysis as we discovered the high correlation between gene expression profile of frozen and FFPE samples. Among genes associated with immune checkpoint, SIRPα,which inhibits macrophage phagocytic activity, was significantly lowly expressed in long-term survivors.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

血管肉腫は高齢者に好発する疾患であり、高齢化社会の進展と共に本邦でも患者数が増加している。一方で全悪性腫瘍の0.01%程の希少な悪性腫瘍であるため、大規模な臨床試験が行われておらず、エビデンスレベルの高い治療方法は限られているのが現状である。今回の研究により、短期および長期生存患者腫瘍の群間に、免疫チェックポイントに関連する遺伝子群のうちSIRPα発現に統計学的に優位な差があることを見出した。血管肉腫の病態におけるSIRPαの役割を更に検討することで、今後増加が予測される頭部血管肉腫に対する免疫チェックポイント阻害剤などの分子標的薬を含む新たな治療法導入の足がかりとなる可能性がある。

Report

(3 results)
  • 2019 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2019 2018

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] K1 gene transformation activities in AIDS-related and classic type Kaposi’s sarcoma: Correlation with clinical presentation2019

    • Author(s)
      Tamanaha-Nakasone Ayumi、Uehara Karina、Tanabe Yasuka、Ishikawa Haruna、Yamakawa Natsuko、Toyoda Zensei、Kurima Kiyoto、Kina Shinichiro、Tsuneki Masayuki、Okubo Yuko、Yamaguchi Sayaka、Utsumi Daisuke、Takahashi Kenzo、Arakawa Hirofumi、Arasaki Akira、Kinjo Takao
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Issue: 1 Pages: 1-12

    • DOI

      10.1038/s41598-019-42763-0

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Expression Changes of Structural Protein Genes May Be Related to Adaptive Skin Characteristics Specific to Humans2019

    • Author(s)
      Arakawa Nami、Utsumi Daisuke、Takahashi Kenzo、Matsumoto-Oda Akiko、Nyachieo Atunga、Chai Daniel、Jillani Ngalla、Imai Hiroo、Satta Yoko、Terai Yohey
    • Journal Title

      Genome Biology and Evolution

      Volume: 11 Issue: 3 Pages: 613-628

    • DOI

      10.1093/gbe/evz007

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 2018年度琉球大学医学部皮膚科外来紹介患者のまとめ2019

    • Author(s)
      山口 さやか, 上原 遥, 兼島 明子, 伊藤 誠, 松尾 雄司, 佐久川 裕行, 山城 充士, 深井 恭子, 岡本 有香, 宮城 拓也, 林 健太郎, 安村 涼, 内海 大介, 新嘉喜 長, 山本 雄一, 高橋健造
    • Organizer
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      山口さやか、伊藤誠、内海大介、宮城拓也、山本雄一、高橋健造
    • Organizer
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      Aoi Ohira, Sayaka Yamaguchi, Daisuke Utsumi, Kenzo Takahashi
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      2019 Annual Research Report
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      A. Ohira, S. Yamaguchi, D. Utsumi, K. Takahashi
    • Organizer
      International Investigative Dermatology 2018
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      2018 Annual Research Report
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      内海大介、苅谷嘉之、大平 葵、 宮城拓也、山本雄一、高橋健造 、片岡圭亮
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      2018 Annual Research Report
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      山本 雄一、上原 遥、堀口 亜有未、兼島 明子、伊藤 誠、松尾 雄司、山城 充士、深井 恭子、岡本 有香、宮城 拓也、林 健太郎、安村 涼、内海 大介、新嘉喜 長、山口 さやか、高橋健造
    • Organizer
      日本皮膚科学会第84回沖縄地方会
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      内海大介、高橋健造
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      大久保優子、松尾雄司、内海大介、山口さやか、山本雄一、高橋健造
    • Organizer
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    • Author(s)
      林健太郎、上間道仁、内海大介、兼島明子、松尾雄司、山口さやか、高橋健造
    • Organizer
      第70回日本皮膚科学会西部支部学術大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report

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Published: 2018-08-27   Modified: 2024-03-26  

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