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Investigation of the rapid culture method using inert solvent

Research Project

Project/Area Number 19K22347
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 41:Agricultural economics and rural sociology, agricultural engineering, and related fields
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Ogawa Yuichi  京都大学, 農学研究科, 准教授 (20373285)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 原田 昌彦  東北大学, 農学研究科, 教授 (70218642)
菊池 正二郎  兵庫医科大学, 医学部, 准教授 (70381960)
Project Period (FY) 2019-06-28 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2020: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Fiscal Year 2019: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Keywords細菌培養 / 不活性溶剤 / センサ / 代謝物 / 微生物 / フルオロカーボン / 近接センサアレイ / 増殖能 / 出芽酵母 / 細胞 / 不活性溶媒 / 細菌 / 迅速培養
Outline of Research at the Start

不活性溶媒を培地に添加した際に生じる細菌の増殖亢進メカニズムを解明し,超迅速な培養技術の構築に役立てるとともに,既存の培養方法が細胞や細菌にとって最適だったのかという問いがけを通じて,生命の根幹である細胞分裂と培地環境との相互作用に迫る研究を実施する.本研究では特に,培養方法の最適化や培地の詳細な分析,分子生物学的アプローチによる機序解明に取り組むだけでなく,原理検証評価に必要なセンサ技術の構築も行う.

Outline of Final Research Achievements

As a method for rapidly and quantitatively monitoring the bacterial growth ability, we succeeded in constructing a method for accurately measuring the bacterial growth in the medium using Near-field array sensor. Furthermore, from the image data obtained by the sensor, it was found that bacterial growth flourished at the boundary between perfluorocarbon and the medium. This results suggests that local interactions at the interface affect bacterial growth. As a result of analyzing the composition of the components in the medium by LC-MS / MS, it was clarified that the addition of perfluorocarbon has a significant effect on the amount of metabolites of a specific component. The combination of the developed evaluation system and composition analysis will enable detailed elucidation of the mechanism by which the addition of perfluorocarbons affects bacterial growth potential.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

多くの細菌検査の場面において,従来の検査法では最初に細菌を平板培養法で増殖させる必要がある。そのような中,不活性溶媒を培地に添加すると細菌の増殖能が向上することが分かってきた。しかし,どのような仕組みで不活性溶媒が細胞増殖に影響を与えているかが明らかになっていない。そこで我々は本研究を通じて,迅速かつ定量的な微生物モニタリング技術や代謝物解析からメカニズム解明につながる知見を得た。この結果は,食の安全安心だけでなく,今後ますます重要となる微生物利用の場面でも利用可能な技術であり,食料生産や微生物エネルギー利用,さらには感染症対策や創薬などの場面でも広く貢献できる基盤的な技術と期待される。

Report

(3 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 7 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Near-field sensor array with 65-GHz CMOS oscillators for rapid detection of viable Escherichia coli2021

    • Author(s)
      Yuichi Ogawa,Shojiro Kikuchi,Yoshihisa Yamashige,Keiichiro Shiraga,Takeshi Mitsunaka
    • Journal Title

      Biosensors and Bioelectronics

      Volume: 176 Pages: 112935-112935

    • DOI

      10.1016/j.bios.2020.112935

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Understanding of the dynamics of water molecules by using terahertz spectroscopy and its bio-applications2021

    • Author(s)
      Yuichi Ogawa
    • Journal Title

      SPIE Proceedings 11789

      Volume: 11789 Pages: 29-29

    • DOI

      10.1117/12.2589583

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Journal Article] 近接型アレイセンサによる微量牛乳中の非標識大腸菌計測2021

    • Author(s)
      山重貴久,菊池正二郎,原田昌彦,陳 思遥,小川雄一
    • Journal Title

      農業食料工学会誌

      Volume: 83

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bacteria Detection and Separation Using Dielectrophoresis on Near-Field Array Sensor2021

    • Author(s)
      Siyao Chen, Yoshihisa Yamashige, Naoshi Kondo, Yuichi Ogawa
    • Journal Title

      関西農業食料工学会会報

      Volume: 129 Pages: 29-30

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Journal Article] サブミリ波近接アレイセンサを用いた大腸菌(Escherichia coli)の増殖モニタリング2020

    • Author(s)
      山重貴久,小川雄一,菊池正二郎,満仲健,白神慧一郎,鈴木哲仁,近藤直
    • Journal Title

      関西農業食料工学会会報

      Volume: 128 Pages: 38-38

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 水の誘電緩和に着目したCMOSバイオセンサ2021

    • Author(s)
      小川雄一,菊池正二郎
    • Organizer
      電子情報通信学会2021年総合大会
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      2020 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 水のテラヘルツ分光に基づく細菌検査用センサの開発2021

    • Author(s)
      小川雄一
    • Organizer
      レーザー学会学術講演会第41回年次大会
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      2020 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 東北大学農学研究科の取り組みと農学分野における利用可能性2021

    • Author(s)
      原田昌彦
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
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      2020 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Understanding of the dynamics of water molecules by using terahertz spectroscopy and its bio-applications2020

    • Author(s)
      Yuichi Ogawa
    • Organizer
      The 4 th International Seminar on Photonics, Optics, and its Applications (ISPhOA) 2020
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      2020 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] サブミリ波近接アレイセンサを用いた大腸菌(Escherichia coli)の増殖モニタリング2020

    • Author(s)
      山重貴久,小川雄一,菊池正二郎,満仲健,白神慧一郎,鈴木哲仁,近藤直
    • Organizer
      第143回関西農業食料工学会例会
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      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Bacteria Detection and Separation Using Dielectrophoresis on Near-Field Array Sensor2020

    • Author(s)
      Siyao Chen, Yoshihisa Yamashige, Naoshi Kondo, Yuichi Ogawa
    • Organizer
      第144回関西農業食料工学会例会
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      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 60GHzで動作する近接アレイセンサによる大腸菌の増殖能の評価2019

    • Author(s)
      山重貴久, 菊池正二郎, 小川雄一
    • Organizer
      シンポジウムテラヘルツ科学の最先端Ⅵ
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      2019 Research-status Report
  • [Presentation] ライフサイエンスに貢献するためのテラヘルツ研究2019

    • Author(s)
      小川雄一
    • Organizer
      ポストLEDフォトニクス公開シンポジウム
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      2019 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] テラヘルツ波を用いた細胞計測と操作2019

    • Author(s)
      小川雄一
    • Organizer
      ACS (American Chemical Society) on Campus
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      2019 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 細胞核内の階層構造による生命機能の制御2019

    • Author(s)
      原田昌彦
    • Organizer
      遺伝研研究会「クロマチン・細胞核の形成のダイナミクスによるゲノム制御」
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 細胞計測を目的としたテラヘルツ近接アレイセンサの開発2019

    • Author(s)
      小川雄一,菊池正二郎,松井毅
    • Organizer
      産学共創基礎基盤研究プログラム「テラヘルツ波新時代を切り拓く革新的基盤技術の創出」
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 微生物検査方法および微生物検査装置2020

    • Inventor(s)
      菊池正二郎,小川雄一
    • Industrial Property Rights Holder
      兵庫医科大学,京都大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2020
    • Related Report
      2020 Annual Research Report

URL: 

Published: 2019-07-04   Modified: 2023-01-30  

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