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Genome evolutionary insights into obligate parasitism of phytoplasmas

Research Project

Project/Area Number 19K23673
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section 0602:Agricultural and environmental biology and related fields
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Miyazaki Akio  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特任助教 (70847748)

Project Period (FY) 2019-08-30 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsファイトプラズマ / 絶対寄生性 / 次世代シーケンス / ゲノム進化 / 植物病 / 比較ゲノム解析
Outline of Research at the Start

植物病による農業被害は大きく、病原体の寄生システムを解明して防除法を構築することが喫緊の課題である。重要な防除対象の一つであるファイトプラズマ属細菌は、宿主から独立して生育できない性質 “絶対寄生性” をもつ。この性質は宿主への物質依存に起因すると考えられているが、詳細な機構は未知のままであった。本研究では、本属が辿った遺伝子構成の変遷を比較ゲノム解析によって推定し、物質収奪や代謝の観点から解釈することで、本属に共通する “絶対寄生性” の遺伝的背景を包括的に解明する。これにより、防除法構築の基盤的知見を得るのみならず、病原性の理解に示唆を与え、更には長年の課題である人工培養の実現に貢献する。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we aimed to approach the molecular mechanism underlying obligate parasitism, which is characteristic and common among phytoplasmas. In order to overcome the technical barriers to the elucidation of the genetic background, we developed a method for enrichment of phytoplasma DNA to achieve efficient genome sequencing. We also revealed the commonality and variation in phyllogen, an effector family secreted in plants, among phytoplasma strains. In addition, to understand the parasitism in insects in detail, we observed the spatiotemporal dynamics of phytoplasmas.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ファイトプラズマ属細菌は、世界中で様々な農作物に壊滅的な被害をもたらしている植物病原体である。有効な農薬は開発できておらず、防除策の構築が喫緊の課題となっている。本研究では、その寄生システムの一端を、植物宿主と昆虫宿主の両面から明らかにした。ファイトプラズマは宿主細胞から独立しては生育できないため、寄生を成立させている分子メカニズムを標的にした新たな防除法が期待されており、本研究はその実現に寄与すると期待される。

Report

(3 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2021 2020

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] Enrichment of phytoplasma genome DNA through a methyl-CpG binding domain-mediated method for efficient genome sequencing2021

    • Author(s)
      Nijo Takamichi、Iwabuchi Nozomu、Tokuda Ryosuke、Suzuki Takumi、Matsumoto Oki、Miyazaki Akio、Maejima Kensaku、Oshima Kenro、Namba Shigetou、Yamaji Yasuyuki
    • Journal Title

      Journal of General Plant Pathology

      Volume: 87 Issue: 3 Pages: 154-163

    • DOI

      10.1007/s10327-021-00993-z

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spatiotemporal dynamics and quantitative analysis of phytoplasmas in insect vectors2020

    • Author(s)
      Koinuma Hiroaki、Maejima Kensaku、Tokuda Ryosuke、Kitazawa Yugo、Nijo Takamichi、Wei Wei、Kumita Kohei、Miyazaki Akio、Namba Shigetou、Yamaji Yasuyuki
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Issue: 1 Pages: 4291-4291

    • DOI

      10.1038/s41598-020-61042-x

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] フィールドサンプルからの効率的なファイトプラズマゲノム解読系の構築2021

    • Author(s)
      二條貴通・岩渕望・徳田遼佑・鈴木拓海・松本旺樹・宮﨑彰雄・前島健作・大島研郎・難波成任・ 山次康幸
    • Organizer
      令和3年度日本植物病理学会大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 媒介昆虫の主要感染器官におけるファイトプラズマの時空間動態2021

    • Author(s)
      鯉沼宏章・徳田遼佑・松本旺樹・北沢優悟・二條貴通・宮﨑彰雄・前島健作・難波成任・山次康幸
    • Organizer
      令和3年度日本植物病理学会大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] ファイトプラズマの葉化誘導因子ファイロジェンの網羅的探索2021

    • Author(s)
      岩渕望・北沢優悟・松本旺樹・鈴木拓海・宮﨑彰雄・二條貴通・前島健作・大島研郎・難波成任・ 山次康幸
    • Organizer
      令和3年度日本植物病理学会大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 葉化誘導能をもたないファイロジェングループの特定2021

    • Author(s)
      松本旺樹・岩渕望・北沢優悟・鈴木拓海・鯉沼宏章・宮崎彰雄・前島健作・大島研郎・難波成任・ 山次康幸
    • Organizer
      令和3年度日本植物病理学会大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 媒介昆虫個体内におけるファイトプラズマの経時的動態解析2020

    • Author(s)
      鯉沼宏章・魏薇・徳田遼佑・ 北沢優悟・二條貴通・汲田幸平・ 宮﨑彰雄・前島健作・難波成任・ 山次康幸
    • Organizer
      令和2年度日本植物病理学会大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-09-03   Modified: 2022-01-27  

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